MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 28668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_013440	CGA	2	6	8209871	8209876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25002	NC_013440	CG	3	6	8209882	8209887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25003	NC_013440	CG	3	6	8209905	8209910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25004	NC_013440	CG	3	6	8211309	8211314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25005	NC_013440	GC	3	6	8211342	8211347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25006	NC_013440	CGAG	2	8	8211363	8211370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25007	NC_013440	GC	4	8	8212096	8212103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25008	NC_013440	GC	3	6	8213068	8213073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25009	NC_013440	GCG	2	6	8213078	8213083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25010	NC_013440	CGG	3	9	8213119	8213127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25011	NC_013440	GGT	2	6	8213169	8213174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25012	NC_013440	CCG	2	6	8213190	8213195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25013	NC_013440	CAGC	2	8	8213206	8213213	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25014	NC_013440	GC	4	8	8214242	8214249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25015	NC_013440	TGC	2	6	8214280	8214285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25016	NC_013440	CG	4	8	8214351	8214358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25017	NC_013440	GCG	2	6	8215347	8215352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25018	NC_013440	CG	3	6	8215365	8215370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25019	NC_013440	ACCC	2	8	8215382	8215389	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25020	NC_013440	CGG	2	6	8215865	8215870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25021	NC_013440	GC	3	6	8215872	8215877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25022	NC_013440	CG	3	6	8215908	8215913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25023	NC_013440	GCG	2	6	8215916	8215921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25024	NC_013440	CG	3	6	8215920	8215925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25025	NC_013440	C	6	6	8215959	8215964	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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25027	NC_013440	GC	3	6	8216462	8216467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25028	NC_013440	GC	3	6	8216475	8216480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25029	NC_013440	ACG	2	6	8219917	8219922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25030	NC_013440	CG	3	6	8219940	8219945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25031	NC_013440	GCC	2	6	8220757	8220762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25032	NC_013440	TCGC	2	8	8220883	8220890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25033	NC_013440	CCG	2	6	8220894	8220899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25034	NC_013440	GAAT	2	8	8220942	8220949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25035	NC_013440	CGAAA	2	10	8220960	8220969	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25036	NC_013440	CAG	2	6	8221140	8221145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25037	NC_013440	CA	4	8	8221248	8221255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25038	NC_013440	CG	3	6	8222110	8222115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25039	NC_013440	GC	3	6	8222141	8222146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25040	NC_013440	T	6	6	8223537	8223542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25041	NC_013440	GT	3	6	8223874	8223879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25042	NC_013440	GCG	2	6	8226396	8226401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25043	NC_013440	GCG	2	6	8230407	8230412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25044	NC_013440	CGG	2	6	8233281	8233286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25045	NC_013440	CGT	2	6	8233287	8233292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25046	NC_013440	CT	3	6	8233300	8233305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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25050	NC_013440	GC	4	8	8233814	8233821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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25052	NC_013440	CGT	2	6	8233846	8233851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25053	NC_013440	GCC	2	6	8233856	8233861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25054	NC_013440	GCC	2	6	8233868	8233873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25055	NC_013440	GCG	2	6	8233874	8233879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25056	NC_013440	CCG	3	9	8233880	8233888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25057	NC_013440	CTGCCG	2	12	8233947	8233958	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25058	NC_013440	GGGC	2	8	8235517	8235524	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25059	NC_013440	CATCG	2	10	8235525	8235534	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25060	NC_013440	CG	3	6	8235569	8235574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25061	NC_013440	GCC	2	6	8235608	8235613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25062	NC_013440	CGCT	2	8	8235624	8235631	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25063	NC_013440	CGCT	2	8	8235638	8235645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25064	NC_013440	GCG	2	6	8241425	8241430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25065	NC_013440	CGG	2	6	8241434	8241439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25066	NC_013440	CGC	2	6	8242520	8242525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25067	NC_013440	AG	3	6	8242552	8242557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25068	NC_013440	ACG	3	9	8242585	8242593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25069	NC_013440	GCC	2	6	8242619	8242624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25070	NC_013440	T	7	7	8242661	8242667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25078	NC_013440	GAG	2	6	8244006	8244011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25079	NC_013440	AGC	2	6	8244028	8244033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25081	NC_013440	CCGC	2	8	8244160	8244167	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25082	NC_013440	GGAG	2	8	8244205	8244212	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25083	NC_013440	AC	3	6	8244245	8244250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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25090	NC_013440	GCG	2	6	8244794	8244799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25093	NC_013440	GC	4	8	8244921	8244928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25094	NC_013440	GCG	2	6	8244968	8244973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25098	NC_013440	GAC	2	6	8245107	8245112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25099	NC_013440	CGA	2	6	8245113	8245118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25100	NC_013440	CGC	2	6	8245123	8245128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25101	NC_013440	CTA	2	6	8245177	8245182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25102	NC_013440	CTA	2	6	8245196	8245201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25103	NC_013440	C	6	6	8245218	8245223	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25104	NC_013440	CGCGC	2	10	8245272	8245281	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25105	NC_013440	CGG	2	6	8245289	8245294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25107	NC_013440	GC	3	6	8245362	8245367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25108	NC_013440	CG	3	6	8245382	8245387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25109	NC_013440	CGG	2	6	8245398	8245403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25110	NC_013440	CTT	2	6	8245404	8245409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25111	NC_013440	CTT	3	9	8245429	8245437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25112	NC_013440	GTCGCG	2	12	8245528	8245539	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25113	NC_013440	ATG	2	6	8245582	8245587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25114	NC_013440	GC	3	6	8250635	8250640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25115	NC_013440	GCC	2	6	8250681	8250686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25116	NC_013440	AGCC	2	8	8250697	8250704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25117	NC_013440	GTC	2	6	8250775	8250780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25118	NC_013440	TGC	2	6	8250796	8250801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25119	NC_013440	A	8	8	8251255	8251262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25120	NC_013440	CAT	3	9	8251388	8251396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25121	NC_013440	CTT	2	6	8251424	8251429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25122	NC_013440	ATG	2	6	8251456	8251461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25123	NC_013440	TCT	2	6	8251466	8251471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25124	NC_013440	C	6	6	8251496	8251501	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25125	NC_013440	T	6	6	8251532	8251537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25126	NC_013440	GC	4	8	8251560	8251567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25127	NC_013440	CGCA	2	8	8251585	8251592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25128	NC_013440	ACA	2	6	8251624	8251629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25129	NC_013440	CTC	2	6	8251643	8251648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25130	NC_013440	GC	3	6	8251712	8251717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25131	NC_013440	ATGAC	2	10	8251746	8251755	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25132	NC_013440	TGT	2	6	8251772	8251777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25134	NC_013440	CGA	2	6	8251859	8251864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25240	NC_013440	CCGCG	2	10	8292956	8292965	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25241	NC_013440	CCCGC	2	10	8292980	8292989	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
25242	NC_013440	CGC	2	6	8293021	8293026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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25245	NC_013440	GCC	2	6	8293083	8293088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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25248	NC_013440	CGGC	2	8	8293157	8293164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25249	NC_013440	CGGC	2	8	8293175	8293182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25250	NC_013440	GCTC	2	8	8293188	8293195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25251	NC_013440	CGC	2	6	8296149	8296154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25252	NC_013440	ACG	2	6	8296246	8296251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25253	NC_013440	CG	4	8	8296267	8296274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25254	NC_013440	GCT	2	6	8297541	8297546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25255	NC_013440	CAT	2	6	8297550	8297555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25257	NC_013440	CGG	2	6	8299682	8299687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25259	NC_013440	GCC	2	6	8299715	8299720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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