MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 28668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013440	CGGC	2	8	582909	582916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_013440	CGC	3	9	582919	582927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_013440	CGG	2	6	582952	582957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_013440	GC	3	6	583012	583017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_013440	CGGC	2	8	583054	583061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_013440	CGA	2	6	585937	585942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_013440	CGC	2	6	588732	588737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_013440	GC	3	6	588774	588779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_013440	CGG	2	6	592840	592845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_013440	CGGC	2	8	592854	592861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_013440	CG	3	6	592879	592884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_013440	CGG	2	6	592896	592901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_013440	CG	4	8	594294	594301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_013440	CG	3	6	594325	594330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_013440	GCG	2	6	594337	594342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_013440	GGC	2	6	594936	594941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_013440	CGGCGT	3	18	594942	594959	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_013440	CGC	2	6	594962	594967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_013440	CGG	2	6	595009	595014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_013440	GTC	2	6	595036	595041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_013440	GCC	2	6	595509	595514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_013440	C	6	6	595641	595646	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1523	NC_013440	GAT	2	6	595656	595661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013440	GAT	2	6	595666	595671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_013440	GAT	2	6	595677	595682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013440	TCGCCG	2	12	595703	595714	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_013440	GC	3	6	598297	598302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_013440	CGGGC	2	10	598344	598353	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1529	NC_013440	GC	3	6	598372	598377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_013440	GGGC	2	8	598380	598387	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1531	NC_013440	AGG	2	6	598395	598400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013440	GTC	3	9	600201	600209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_013440	GCGG	2	8	600214	600221	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_013440	CCTG	2	8	601396	601403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_013440	GGGCT	2	10	601404	601413	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1536	NC_013440	CG	4	8	601419	601426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_013440	TCGG	2	8	602451	602458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_013440	CT	3	6	603670	603675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_013440	CCG	2	6	605789	605794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_013440	TGTGC	2	10	606839	606848	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1541	NC_013440	CGGA	2	8	606859	606866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_013440	GC	3	6	606901	606906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_013440	GCG	2	6	606920	606925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_013440	AC	3	6	606966	606971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_013440	GC	4	8	606983	606990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_013440	AC	3	6	607032	607037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_013440	GCG	2	6	607931	607936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_013440	CTCGCC	2	12	608045	608056	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_013440	CG	4	8	609290	609297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_013440	GCG	2	6	609324	609329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_013440	TCT	2	6	609335	609340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_013440	GACCGA	2	12	609371	609382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_013440	GCG	2	6	612306	612311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_013440	TCA	2	6	612378	612383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_013440	GC	3	6	612387	612392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_013440	CG	4	8	613018	613025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_013440	ACG	2	6	613077	613082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_013440	CG	3	6	613084	613089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_013440	ACGGCA	2	12	613118	613129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_013440	ATG	2	6	613204	613209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_013440	CAG	2	6	613259	613264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_013440	AG	3	6	613263	613268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_013440	GCC	2	6	613941	613946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_013440	GCC	2	6	619631	619636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_013440	TTC	2	6	619718	619723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_013440	GA	3	6	619732	619737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013440	GAT	2	6	621107	621112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_013440	CAC	2	6	621113	621118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_013440	CAC	2	6	621126	621131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_013440	CAC	2	6	621139	621144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_013440	CG	3	6	621168	621173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_013440	GCC	2	6	621251	621256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_013440	TGC	2	6	621840	621845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_013440	CCG	2	6	621865	621870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_013440	GT	3	6	621963	621968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013440	GCC	2	6	621971	621976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_013440	GCC	2	6	622002	622007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_013440	CG	3	6	622046	622051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_013440	CGGGCG	2	12	622165	622176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_013440	CAT	2	6	622194	622199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_013440	AGC	2	6	622304	622309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_013440	GAG	2	6	622404	622409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_013440	CG	3	6	624221	624226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_013440	CCCGCG	2	12	624227	624238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_013440	GGC	2	6	625852	625857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_013440	CGG	2	6	629284	629289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_013440	ACC	2	6	634118	634123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_013440	CG	5	10	634129	634138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_013440	TCG	2	6	634151	634156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1591	NC_013440	G	6	6	634215	634220	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_013440	CGA	2	6	635427	635432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_013440	CGG	3	9	635474	635482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_013440	TTG	2	6	635485	635490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_013440	GCG	2	6	635596	635601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_013440	GGC	2	6	635614	635619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_013440	GC	3	6	635634	635639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_013440	GGC	2	6	635666	635671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_013440	GTG	2	6	635698	635703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_013440	CG	4	8	635738	635745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_013440	TGC	2	6	636935	636940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_013440	TCC	2	6	636960	636965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_013440	TGG	2	6	637025	637030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013440	TTGA	2	8	637033	637040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013440	CT	3	6	637097	637102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_013440	CTG	2	6	637124	637129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_013440	AAC	2	6	637213	637218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_013440	CGA	2	6	637256	637261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_013440	GAG	2	6	637310	637315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013440	GCG	2	6	637753	637758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_013440	TGA	2	6	637770	637775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_013440	CAG	2	6	637845	637850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_013440	GCG	2	6	637870	637875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_013440	GGC	2	6	637888	637893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_013440	GC	3	6	637908	637913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_013440	GGC	2	6	637940	637945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_013440	GTG	2	6	637972	637977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013440	CGT	2	6	639191	639196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_013440	GCT	2	6	639197	639202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_013440	GAAG	2	8	639350	639357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013440	GGA	2	6	639392	639397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_013440	ATC	2	6	639473	639478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_013440	GGAT	2	8	639479	639486	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_013440	ATATCG	2	12	639511	639522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1625	NC_013440	CGA	2	6	639523	639528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_013440	GCA	2	6	639529	639534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_013440	AGC	2	6	639568	639573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_013440	TCG	2	6	639582	639587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_013440	AGA	2	6	639643	639648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013440	ACTT	2	8	639670	639677	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_013440	TCC	2	6	639689	639694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_013440	G	6	6	639695	639700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_013440	GC	3	6	640090	640095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_013440	TCG	2	6	640527	640532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_013440	TTGC	2	8	640544	640551	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1637	NC_013440	GC	3	6	640576	640581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1639	NC_013440	GT	3	6	640657	640662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1641	NC_013440	GAG	2	6	640718	640723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1902	NC_013440	GTG	2	6	715460	715465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1903	NC_013440	GAT	2	6	715477	715482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1904	NC_013440	GCGAG	2	10	715500	715509	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1905	NC_013440	GGCG	2	8	715524	715531	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1906	NC_013440	GCCG	2	8	715571	715578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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