MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 28668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_013440	GC	3	6	6362098	6362103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19002	NC_013440	GCC	2	6	6362105	6362110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19003	NC_013440	CGC	2	6	6362118	6362123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19004	NC_013440	CGC	2	6	6362132	6362137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19005	NC_013440	CG	3	6	6362150	6362155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19006	NC_013440	G	9	9	6363252	6363260	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_013440	ACG	2	6	6368229	6368234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19008	NC_013440	GC	3	6	6368254	6368259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19009	NC_013440	CGCT	2	8	6368263	6368270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19010	NC_013440	GGCGC	2	10	6368276	6368285	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19011	NC_013440	GCC	2	6	6368290	6368295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19012	NC_013440	GC	3	6	6368297	6368302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19013	NC_013440	ACTT	2	8	6369401	6369408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19014	NC_013440	CGG	2	6	6369434	6369439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19015	NC_013440	CAGG	2	8	6369476	6369483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19016	NC_013440	CGCC	2	8	6369490	6369497	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19017	NC_013440	GCCC	2	8	6369504	6369511	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19018	NC_013440	CCAGC	2	10	6369526	6369535	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19019	NC_013440	CGG	2	6	6369610	6369615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19020	NC_013440	GGCCA	2	10	6369620	6369629	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19021	NC_013440	GC	3	6	6369639	6369644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19022	NC_013440	GC	4	8	6369717	6369724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19023	NC_013440	GCC	2	6	6369737	6369742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19024	NC_013440	CGG	2	6	6369748	6369753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19025	NC_013440	CGA	2	6	6369767	6369772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19040	NC_013440	CTC	2	6	6370173	6370178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19041	NC_013440	GC	3	6	6372596	6372601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19042	NC_013440	GCC	2	6	6372651	6372656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19043	NC_013440	CGC	2	6	6372678	6372683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19048	NC_013440	CG	3	6	6372877	6372882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19049	NC_013440	GTGGC	2	10	6372884	6372893	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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19055	NC_013440	GA	3	6	6374391	6374396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19056	NC_013440	AAT	2	6	6374410	6374415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19057	NC_013440	CTG	2	6	6374458	6374463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19059	NC_013440	TGCT	2	8	6374479	6374486	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19060	NC_013440	CGA	2	6	6374537	6374542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19063	NC_013440	GT	3	6	6374850	6374855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19064	NC_013440	CGCC	2	8	6374871	6374878	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19065	NC_013440	GCC	2	6	6374890	6374895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19066	NC_013440	CG	3	6	6375003	6375008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19067	NC_013440	GCCCG	2	10	6375014	6375023	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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19086	NC_013440	GCTC	2	8	6380891	6380898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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19093	NC_013440	CG	3	6	6381172	6381177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19094	NC_013440	CG	3	6	6381189	6381194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19095	NC_013440	TCCCCT	2	12	6381930	6381941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19102	NC_013440	CAG	2	6	6386958	6386963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19107	NC_013440	CGA	2	6	6387052	6387057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19108	NC_013440	CGC	2	6	6387062	6387067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19109	NC_013440	TGG	2	6	6387068	6387073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19111	NC_013440	GC	3	6	6387098	6387103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19112	NC_013440	GCT	2	6	6387115	6387120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19113	NC_013440	CGA	2	6	6387139	6387144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19114	NC_013440	CCCTT	2	10	6387156	6387165	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19115	NC_013440	CGG	2	6	6387444	6387449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19116	NC_013440	ATT	2	6	6387462	6387467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19117	NC_013440	AG	3	6	6388325	6388330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19118	NC_013440	CG	3	6	6388652	6388657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19119	NC_013440	CG	3	6	6388674	6388679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19120	NC_013440	GCG	2	6	6388968	6388973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19121	NC_013440	CGCGG	2	10	6389044	6389053	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19122	NC_013440	CGGCC	2	10	6389082	6389091	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19123	NC_013440	CAG	2	6	6389098	6389103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19124	NC_013440	GCGG	2	8	6389152	6389159	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19125	NC_013440	GAA	2	6	6389161	6389166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19126	NC_013440	C	7	7	6390186	6390192	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19127	NC_013440	CTGCG	2	10	6390205	6390214	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19128	NC_013440	CCG	2	6	6394231	6394236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19129	NC_013440	TGCGCA	2	12	6394971	6394982	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19130	NC_013440	GC	3	6	6395015	6395020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19131	NC_013440	GAT	2	6	6395110	6395115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19132	NC_013440	ACG	2	6	6395123	6395128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19133	NC_013440	AC	3	6	6395129	6395134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19134	NC_013440	GA	3	6	6395159	6395164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19135	NC_013440	GTAA	2	8	6395216	6395223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19136	NC_013440	CCG	2	6	6395305	6395310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19137	NC_013440	CT	3	6	6395349	6395354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19138	NC_013440	GAG	2	6	6395428	6395433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19139	NC_013440	CG	3	6	6395939	6395944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19140	NC_013440	AGC	2	6	6395948	6395953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19141	NC_013440	CG	3	6	6396004	6396009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19142	NC_013440	AAC	2	6	6396018	6396023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19145	NC_013440	ACC	2	6	6396094	6396099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19146	NC_013440	CTC	2	6	6396111	6396116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19147	NC_013440	CTG	2	6	6396125	6396130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19151	NC_013440	AACG	2	8	6396180	6396187	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19152	NC_013440	TG	3	6	6396213	6396218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19153	NC_013440	CGGC	2	8	6396319	6396326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19154	NC_013440	CA	3	6	6396329	6396334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19155	NC_013440	GC	4	8	6396356	6396363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19162	NC_013440	CG	4	8	6398273	6398280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19163	NC_013440	GCG	2	6	6398302	6398307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19164	NC_013440	GC	3	6	6398323	6398328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19165	NC_013440	AGC	2	6	6398349	6398354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19188	NC_013440	CTC	2	6	6399401	6399406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19200	NC_013440	CG	3	6	6400450	6400455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19201	NC_013440	CCG	2	6	6400457	6400462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19207	NC_013440	GCG	2	6	6400597	6400602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19229	NC_013440	GCG	2	6	6418131	6418136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19231	NC_013440	CGT	2	6	6418186	6418191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19241	NC_013440	ACGG	2	8	6419893	6419900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19242	NC_013440	G	7	7	6419899	6419905	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19243	NC_013440	ACCGC	2	10	6419906	6419915	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19244	NC_013440	GC	3	6	6419914	6419919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19245	NC_013440	CCG	3	9	6419920	6419928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19247	NC_013440	CCG	3	9	6419946	6419954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19248	NC_013440	GCCCG	2	10	6419961	6419970	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19249	NC_013440	CCG	3	9	6419972	6419980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19250	NC_013440	GCCCG	2	10	6419987	6419996	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19251	NC_013440	C	6	6	6420018	6420023	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19252	NC_013440	TGC	2	6	6420874	6420879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19253	NC_013440	GC	4	8	6422447	6422454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19254	NC_013440	CGG	2	6	6422465	6422470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19255	NC_013440	GGCG	2	8	6426303	6426310	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19256	NC_013440	TC	3	6	6426337	6426342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19257	NC_013440	AAGC	2	8	6426352	6426359	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19258	NC_013440	CG	3	6	6426427	6426432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19259	NC_013440	CG	4	8	6426438	6426445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19261	NC_013440	CGC	3	9	6426488	6426496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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