MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 28668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_013440	CGC	2	6	6209113	6209118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18502	NC_013440	ATGT	2	8	6209514	6209521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_013440	CGC	2	6	6209525	6209530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18504	NC_013440	CGGCG	2	10	6209598	6209607	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18505	NC_013440	GGC	2	6	6209620	6209625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18506	NC_013440	GC	4	8	6209628	6209635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18507	NC_013440	GC	3	6	6209650	6209655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18508	NC_013440	CGC	2	6	6209667	6209672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18509	NC_013440	CGC	2	6	6209712	6209717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18510	NC_013440	GCCAGC	2	12	6209720	6209731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18511	NC_013440	GC	3	6	6209767	6209772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18512	NC_013440	TCA	2	6	6209784	6209789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18513	NC_013440	TCG	2	6	6209828	6209833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18514	NC_013440	GC	4	8	6209859	6209866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18515	NC_013440	GT	3	6	6209960	6209965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18516	NC_013440	CGT	3	9	6210027	6210035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18517	NC_013440	CGGC	2	8	6210099	6210106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18518	NC_013440	GC	3	6	6210105	6210110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18519	NC_013440	GCC	2	6	6210151	6210156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18520	NC_013440	CGCGC	2	10	6210267	6210276	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18521	NC_013440	CGA	2	6	6210291	6210296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18522	NC_013440	CCT	2	6	6210303	6210308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18523	NC_013440	GTC	2	6	6210325	6210330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18524	NC_013440	TGG	2	6	6210429	6210434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18525	NC_013440	GAT	2	6	6210439	6210444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18526	NC_013440	TTG	2	6	6210452	6210457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18527	NC_013440	GC	3	6	6210474	6210479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18528	NC_013440	AGCTG	2	10	6210504	6210513	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18529	NC_013440	ATA	2	6	6210629	6210634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18530	NC_013440	AGC	2	6	6210641	6210646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18531	NC_013440	TGA	2	6	6210756	6210761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_013440	GGC	2	6	6210769	6210774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18533	NC_013440	TGC	2	6	6210864	6210869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18534	NC_013440	GC	4	8	6210868	6210875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18535	NC_013440	GTTGAC	2	12	6210878	6210889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18536	NC_013440	GCC	2	6	6210923	6210928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18537	NC_013440	GGGC	2	8	6210980	6210987	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18538	NC_013440	TGG	2	6	6210999	6211004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18539	NC_013440	CGAG	2	8	6211042	6211049	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18540	NC_013440	CCG	2	6	6211069	6211074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18541	NC_013440	ACGTTG	2	12	6211083	6211094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18542	NC_013440	GAA	2	6	6211130	6211135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18543	NC_013440	GCCA	2	8	6211182	6211189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18544	NC_013440	GCG	2	6	6211192	6211197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18545	NC_013440	GAC	2	6	6211223	6211228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18546	NC_013440	TGA	3	9	6211327	6211335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18547	NC_013440	AGC	2	6	6211368	6211373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18548	NC_013440	GGA	2	6	6211402	6211407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_013440	CGT	2	6	6211432	6211437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18550	NC_013440	GAT	2	6	6211472	6211477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_013440	GGC	2	6	6211484	6211489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18552	NC_013440	CAG	2	6	6211490	6211495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18553	NC_013440	AGT	2	6	6211519	6211524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18554	NC_013440	GCC	3	9	6211532	6211540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18555	NC_013440	GCA	2	6	6211543	6211548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18556	NC_013440	CGG	2	6	6211585	6211590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18557	NC_013440	GAT	2	6	6211634	6211639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18558	NC_013440	CGA	2	6	6211642	6211647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18559	NC_013440	CGG	2	6	6211651	6211656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18560	NC_013440	TGC	2	6	6211690	6211695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18561	NC_013440	CGA	3	9	6211696	6211704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18562	NC_013440	GCC	2	6	6211706	6211711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18563	NC_013440	TCA	2	6	6211735	6211740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18564	NC_013440	AAG	2	6	6211791	6211796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18565	NC_013440	CCG	2	6	6211868	6211873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18566	NC_013440	AGA	2	6	6211889	6211894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18567	NC_013440	GC	3	6	6211978	6211983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18568	NC_013440	GC	3	6	6212011	6212016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18569	NC_013440	CG	3	6	6212039	6212044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18570	NC_013440	TCG	2	6	6212104	6212109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18571	NC_013440	AGG	2	6	6212520	6212525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18572	NC_013440	CG	4	8	6212594	6212601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18573	NC_013440	CGCC	2	8	6212618	6212625	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18574	NC_013440	CGC	2	6	6212640	6212645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18575	NC_013440	TGC	2	6	6212659	6212664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18576	NC_013440	CG	4	8	6212666	6212673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18577	NC_013440	TGC	2	6	6212707	6212712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18578	NC_013440	GCGCCG	2	12	6212780	6212791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18579	NC_013440	GAAT	2	8	6212828	6212835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18580	NC_013440	TCA	2	6	6212848	6212853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18581	NC_013440	TGT	2	6	6212854	6212859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18582	NC_013440	CAT	2	6	6212860	6212865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18583	NC_013440	ACA	2	6	6212903	6212908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18584	NC_013440	CAC	2	6	6212952	6212957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18585	NC_013440	TCGC	2	8	6212962	6212969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18586	NC_013440	GCT	2	6	6212991	6212996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18587	NC_013440	ACG	2	6	6213011	6213016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18588	NC_013440	GGC	2	6	6213030	6213035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18589	NC_013440	CAA	2	6	6213052	6213057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18590	NC_013440	CGA	2	6	6213066	6213071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18591	NC_013440	GCG	2	6	6213075	6213080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18592	NC_013440	CTG	2	6	6213098	6213103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18593	NC_013440	TCA	2	6	6213104	6213109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18594	NC_013440	GTAT	2	8	6213123	6213130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18595	NC_013440	CCG	2	6	6213141	6213146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18596	NC_013440	ATG	2	6	6213264	6213269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18597	NC_013440	CTGG	2	8	6213277	6213284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18598	NC_013440	CGCC	2	8	6213291	6213298	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18599	NC_013440	GCGGCC	2	12	6213299	6213310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18600	NC_013440	ATG	2	6	6213318	6213323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18601	NC_013440	AG	3	6	6213391	6213396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18602	NC_013440	GGCG	2	8	6213401	6213408	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18603	NC_013440	CG	3	6	6213410	6213415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18604	NC_013440	AGC	2	6	6221993	6221998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18605	NC_013440	CGT	2	6	6222011	6222016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18606	NC_013440	GCG	2	6	6222019	6222024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18607	NC_013440	AAC	2	6	6222028	6222033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18608	NC_013440	GCC	2	6	6222034	6222039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18609	NC_013440	GCA	2	6	6222040	6222045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18610	NC_013440	GGAC	2	8	6222071	6222078	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18611	NC_013440	AC	3	6	6222106	6222111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18612	NC_013440	GC	3	6	6222129	6222134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18613	NC_013440	CATC	2	8	6222168	6222175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18614	NC_013440	CG	3	6	6224043	6224048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18615	NC_013440	CG	3	6	6224060	6224065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18616	NC_013440	CCG	2	6	6224119	6224124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18617	NC_013440	GCG	2	6	6224151	6224156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18618	NC_013440	GCA	2	6	6224189	6224194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18619	NC_013440	GCT	2	6	6224207	6224212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18620	NC_013440	CGC	2	6	6224686	6224691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18621	NC_013440	CATT	2	8	6224712	6224719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18622	NC_013440	CGC	2	6	6224731	6224736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18623	NC_013440	GCG	2	6	6224766	6224771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18624	NC_013440	CGGA	2	8	6224833	6224840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18625	NC_013440	CGC	2	6	6224906	6224911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18626	NC_013440	GCTC	2	8	6224932	6224939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18627	NC_013440	GCCG	2	8	6224967	6224974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18628	NC_013440	CGC	2	6	6225017	6225022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18629	NC_013440	GTC	2	6	6230522	6230527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18630	NC_013440	GTG	2	6	6230528	6230533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18631	NC_013440	GGC	2	6	6230544	6230549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18632	NC_013440	GCG	2	6	6230572	6230577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18633	NC_013440	GC	3	6	6233438	6233443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18634	NC_013440	CG	3	6	6233485	6233490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18635	NC_013440	AGT	2	6	6233497	6233502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18637	NC_013440	CGC	2	6	6233592	6233597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18651	NC_013440	GC	3	6	6234245	6234250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18662	NC_013440	CG	3	6	6236164	6236169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18663	NC_013440	CG	4	8	6236208	6236215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18667	NC_013440	TG	3	6	6237249	6237254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18742	NC_013440	CGGGC	2	10	6272476	6272485	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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18744	NC_013440	CGG	2	6	6273226	6273231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18750	NC_013440	GCG	2	6	6275207	6275212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18751	NC_013440	GCCCGC	2	12	6275453	6275464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18752	NC_013440	GC	4	8	6275463	6275470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18753	NC_013440	CGCGC	2	10	6275481	6275490	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18754	NC_013440	GA	3	6	6277501	6277506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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