MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 28668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_013440	CTG	2	6	5556224	5556229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16502	NC_013440	TCA	2	6	5556286	5556291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16503	NC_013440	GCA	2	6	5556601	5556606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16504	NC_013440	GCA	2	6	5556644	5556649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16505	NC_013440	GCA	2	6	5556687	5556692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16506	NC_013440	GCA	2	6	5556730	5556735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_013440	GCA	2	6	5556773	5556778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16508	NC_013440	GCA	2	6	5556816	5556821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16509	NC_013440	GCA	2	6	5556859	5556864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16510	NC_013440	TGC	2	6	5556900	5556905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16511	NC_013440	GGC	2	6	5557034	5557039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16512	NC_013440	GAG	2	6	5557062	5557067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_013440	GGC	2	6	5557086	5557091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16514	NC_013440	ACG	2	6	5557121	5557126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16515	NC_013440	GGA	2	6	5557132	5557137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16516	NC_013440	GCC	2	6	5557151	5557156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16517	NC_013440	CCG	2	6	5557167	5557172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16518	NC_013440	GGC	2	6	5557177	5557182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16519	NC_013440	CCG	2	6	5557187	5557192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16520	NC_013440	CTC	2	6	5557209	5557214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16521	NC_013440	C	6	6	5557216	5557221	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16522	NC_013440	GCC	2	6	5557241	5557246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16523	NC_013440	CTC	2	6	5560514	5560519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16524	NC_013440	ACT	2	6	5560527	5560532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16525	NC_013440	GC	3	6	5560554	5560559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16526	NC_013440	TAT	2	6	5560579	5560584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16527	NC_013440	AGC	2	6	5561523	5561528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16528	NC_013440	GCC	2	6	5561545	5561550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16529	NC_013440	GAA	2	6	5561561	5561566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16530	NC_013440	CGA	2	6	5561579	5561584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16531	NC_013440	CCG	2	6	5561598	5561603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16532	NC_013440	CT	3	6	5561653	5561658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16533	NC_013440	GC	4	8	5566139	5566146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16534	NC_013440	GGC	2	6	5566974	5566979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16535	NC_013440	GCTG	2	8	5567626	5567633	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16536	NC_013440	G	6	6	5567633	5567638	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16537	NC_013440	CG	3	6	5567639	5567644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16538	NC_013440	GCC	2	6	5567681	5567686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16539	NC_013440	GC	3	6	5567709	5567714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16540	NC_013440	CAT	2	6	5567724	5567729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16541	NC_013440	GC	4	8	5567780	5567787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16542	NC_013440	GCG	2	6	5567791	5567796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16543	NC_013440	GGT	2	6	5567803	5567808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16544	NC_013440	CGG	2	6	5567842	5567847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16545	NC_013440	AGC	2	6	5571819	5571824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16546	NC_013440	CGC	2	6	5571838	5571843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16547	NC_013440	GC	3	6	5571842	5571847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16548	NC_013440	CGA	2	6	5571885	5571890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16549	NC_013440	GTC	2	6	5576127	5576132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16550	NC_013440	CG	3	6	5576198	5576203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16551	NC_013440	GCC	3	9	5576221	5576229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16552	NC_013440	GCT	2	6	5576235	5576240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16553	NC_013440	CGG	2	6	5576241	5576246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16554	NC_013440	ACCG	2	8	5579837	5579844	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16555	NC_013440	CGG	2	6	5579861	5579866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16556	NC_013440	GCG	2	6	5584456	5584461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16557	NC_013440	GCT	2	6	5584512	5584517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16558	NC_013440	CGT	2	6	5584528	5584533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16559	NC_013440	CGG	2	6	5584574	5584579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16560	NC_013440	CG	4	8	5584603	5584610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16561	NC_013440	GC	3	6	5584621	5584626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16562	NC_013440	GCG	2	6	5584645	5584650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16563	NC_013440	TAC	2	6	5586263	5586268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16564	NC_013440	TTTC	2	8	5588487	5588494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16565	NC_013440	CTG	2	6	5588513	5588518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16566	NC_013440	CTCATC	2	12	5588638	5588649	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
16567	NC_013440	GAGC	2	8	5588672	5588679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16568	NC_013440	TCG	2	6	5588688	5588693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16569	NC_013440	GCCT	2	8	5588727	5588734	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16570	NC_013440	ACC	2	6	5588764	5588769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16571	NC_013440	ACA	2	6	5588773	5588778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16572	NC_013440	CA	3	6	5588777	5588782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16573	NC_013440	GCC	2	6	5588917	5588922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16574	NC_013440	C	6	6	5588925	5588930	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16575	NC_013440	C	6	6	5588992	5588997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16576	NC_013440	CGC	2	6	5589002	5589007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16577	NC_013440	ACG	2	6	5589011	5589016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16578	NC_013440	CG	3	6	5589049	5589054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16579	NC_013440	CCA	2	6	5589057	5589062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16580	NC_013440	GCGTC	2	10	5589063	5589072	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16581	NC_013440	CGGC	2	8	5589083	5589090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16582	NC_013440	GC	3	6	5589108	5589113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16583	NC_013440	GC	3	6	5589118	5589123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16584	NC_013440	GCG	2	6	5590079	5590084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16585	NC_013440	GCGA	2	8	5590093	5590100	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16587	NC_013440	CG	3	6	5590155	5590160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16588	NC_013440	GTT	2	6	5590242	5590247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16589	NC_013440	CAG	2	6	5591206	5591211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16590	NC_013440	GC	3	6	5591228	5591233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16591	NC_013440	CGC	4	12	5591237	5591248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16592	NC_013440	CGA	2	6	5591280	5591285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16593	NC_013440	GC	3	6	5591289	5591294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16594	NC_013440	GC	4	8	5591309	5591316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16595	NC_013440	CGGCC	2	10	5591369	5591378	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16596	NC_013440	GGC	2	6	5591394	5591399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16597	NC_013440	GCG	2	6	5591405	5591410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16598	NC_013440	CGG	3	9	5591425	5591433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16599	NC_013440	CGG	3	9	5591436	5591444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16600	NC_013440	C	7	7	5591486	5591492	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16601	NC_013440	TCG	2	6	5591493	5591498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16602	NC_013440	GTC	2	6	5593432	5593437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16603	NC_013440	GCC	2	6	5593454	5593459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16604	NC_013440	CCGAGA	5	30	5593464	5593493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16605	NC_013440	GCG	3	9	5593527	5593535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16606	NC_013440	CCA	2	6	5593536	5593541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16607	NC_013440	GC	4	8	5593548	5593555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16608	NC_013440	GTC	2	6	5593565	5593570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16609	NC_013440	CGGC	2	8	5593599	5593606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16610	NC_013440	GCA	2	6	5593620	5593625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16611	NC_013440	GC	5	10	5593645	5593654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16612	NC_013440	CGGC	2	8	5593659	5593666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16613	NC_013440	GGC	2	6	5593672	5593677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16614	NC_013440	GC	3	6	5593676	5593681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16615	NC_013440	CCG	2	6	5593689	5593694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16616	NC_013440	GCCA	2	8	5593700	5593707	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16617	NC_013440	GCG	2	6	5593740	5593745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16618	NC_013440	AAG	2	6	5593787	5593792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16619	NC_013440	CCG	2	6	5593802	5593807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16620	NC_013440	CCCAG	2	10	5593851	5593860	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16621	NC_013440	TTC	2	6	5595806	5595811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16622	NC_013440	C	6	6	5595861	5595866	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16623	NC_013440	ACG	2	6	5595872	5595877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16624	NC_013440	CG	3	6	5595876	5595881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16625	NC_013440	CCT	2	6	5595899	5595904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16626	NC_013440	GCCC	2	8	5595979	5595986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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16893	NC_013440	CCCG	2	8	5720013	5720020	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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