MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 28668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_013440	GCC	2	6	5334785	5334790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16002	NC_013440	C	6	6	5334806	5334811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16003	NC_013440	CGA	2	6	5337203	5337208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_013440	CGT	2	6	5337224	5337229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_013440	CCG	2	6	5337299	5337304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16006	NC_013440	CG	4	8	5337413	5337420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16007	NC_013440	GCA	2	6	5337456	5337461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_013440	CG	3	6	5337476	5337481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16009	NC_013440	GCGCAC	2	12	5337492	5337503	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16010	NC_013440	CCA	2	6	5337521	5337526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16011	NC_013440	GC	3	6	5337559	5337564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16012	NC_013440	CGC	2	6	5337617	5337622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16013	NC_013440	GCC	2	6	5337623	5337628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16014	NC_013440	CG	3	6	5337666	5337671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16015	NC_013440	GCC	2	6	5337686	5337691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16016	NC_013440	GGC	2	6	5337694	5337699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_013440	TC	4	8	5339731	5339738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16018	NC_013440	CGC	2	6	5339821	5339826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16019	NC_013440	GCC	4	12	5339827	5339838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16020	NC_013440	GC	3	6	5339856	5339861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16021	NC_013440	GC	3	6	5339893	5339898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16022	NC_013440	CAAA	2	8	5341606	5341613	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16023	NC_013440	GCC	4	12	5341631	5341642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16024	NC_013440	GC	3	6	5341654	5341659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16025	NC_013440	TGC	2	6	5341704	5341709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16027	NC_013440	GCCCC	4	20	5341734	5341753	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
16028	NC_013440	GC	3	6	5341758	5341763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16029	NC_013440	CGC	2	6	5341766	5341771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16030	NC_013440	GC	3	6	5341770	5341775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16031	NC_013440	AGC	2	6	5344372	5344377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_013440	GCCCGC	2	12	5344428	5344439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16033	NC_013440	GC	3	6	5344438	5344443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16034	NC_013440	CCG	2	6	5344444	5344449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16035	NC_013440	GGT	2	6	5345571	5345576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_013440	TCG	2	6	5345587	5345592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_013440	GC	3	6	5345665	5345670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16038	NC_013440	GAG	2	6	5345678	5345683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_013440	GC	3	6	5345704	5345709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16040	NC_013440	GCG	2	6	5345726	5345731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_013440	C	6	6	5345863	5345868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16042	NC_013440	GC	3	6	5345870	5345875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16043	NC_013440	CGC	2	6	5351504	5351509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16044	NC_013440	GC	4	8	5351521	5351528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16045	NC_013440	CTC	2	6	5351619	5351624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16046	NC_013440	CG	3	6	5351664	5351669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16047	NC_013440	T	7	7	5351682	5351688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16049	NC_013440	TTC	2	6	5352987	5352992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16054	NC_013440	GTAC	2	8	5354053	5354060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16055	NC_013440	GCC	2	6	5354079	5354084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16056	NC_013440	GC	3	6	5354089	5354094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16057	NC_013440	C	6	6	5354094	5354099	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16058	NC_013440	TTG	2	6	5354115	5354120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_013440	TCC	2	6	5354144	5354149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16060	NC_013440	GC	3	6	5354155	5354160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16061	NC_013440	CGGC	2	8	5354199	5354206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16062	NC_013440	GGGGA	2	10	5354211	5354220	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_013440	GGC	2	6	5355691	5355696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16064	NC_013440	GCC	2	6	5355709	5355714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16065	NC_013440	CTG	2	6	5355815	5355820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16068	NC_013440	CG	3	6	5355883	5355888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16069	NC_013440	CGA	2	6	5355930	5355935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16074	NC_013440	CAAG	2	8	5356131	5356138	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16075	NC_013440	CCGCG	2	10	5356140	5356149	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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16078	NC_013440	GCC	3	9	5356183	5356191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16079	NC_013440	CGAG	2	8	5356238	5356245	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16081	NC_013440	CGC	3	9	5356300	5356308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16086	NC_013440	GC	3	6	5360599	5360604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16087	NC_013440	GC	3	6	5360649	5360654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16091	NC_013440	GC	3	6	5361113	5361118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16092	NC_013440	GC	3	6	5361125	5361130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16093	NC_013440	CGC	2	6	5362655	5362660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16094	NC_013440	CGAG	2	8	5362661	5362668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16095	NC_013440	GCG	2	6	5362689	5362694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16096	NC_013440	TGGCGG	2	12	5362728	5362739	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16097	NC_013440	GCG	2	6	5362744	5362749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16098	NC_013440	TTC	2	6	5363895	5363900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16099	NC_013440	CCCAT	2	10	5363925	5363934	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16100	NC_013440	GGC	2	6	5363979	5363984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_013440	GCGCTC	2	12	5363996	5364007	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16102	NC_013440	CGAG	2	8	5364033	5364040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16103	NC_013440	CG	4	8	5364041	5364048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16104	NC_013440	AGC	2	6	5364072	5364077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16106	NC_013440	CG	3	6	5366430	5366435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16107	NC_013440	CCG	2	6	5366445	5366450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16108	NC_013440	CG	4	8	5366449	5366456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16109	NC_013440	GC	3	6	5366894	5366899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16110	NC_013440	ATCG	2	8	5366931	5366938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16111	NC_013440	AAAC	2	8	5366996	5367003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16112	NC_013440	G	6	6	5367055	5367060	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_013440	CG	3	6	5367372	5367377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16114	NC_013440	CAGG	2	8	5367391	5367398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16115	NC_013440	ACG	2	6	5368472	5368477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16116	NC_013440	A	7	7	5368560	5368566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_013440	TC	3	6	5368574	5368579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16118	NC_013440	TTG	2	6	5368669	5368674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_013440	GAC	2	6	5368724	5368729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_013440	ATG	2	6	5368731	5368736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_013440	GTC	2	6	5368818	5368823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16122	NC_013440	GCG	3	9	5368826	5368834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_013440	CGC	2	6	5368837	5368842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16124	NC_013440	GAG	2	6	5368895	5368900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_013440	TCG	2	6	5368920	5368925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16126	NC_013440	TGCG	2	8	5368935	5368942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16127	NC_013440	GAA	2	6	5369030	5369035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_013440	GCGCC	2	10	5369054	5369063	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16129	NC_013440	CGT	2	6	5369072	5369077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16130	NC_013440	CGC	2	6	5369081	5369086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16263	NC_013440	GC	3	6	5439364	5439369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16264	NC_013440	CG	4	8	5439376	5439383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16265	NC_013440	GCA	2	6	5439389	5439394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16271	NC_013440	GA	3	6	5443855	5443860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16393	NC_013440	G	7	7	5500639	5500645	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16394	NC_013440	CGCC	2	8	5500710	5500717	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16395	NC_013440	GCGGA	2	10	5500737	5500746	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16396	NC_013440	CGT	2	6	5500779	5500784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16397	NC_013440	A	6	6	5500799	5500804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16398	NC_013440	GCT	2	6	5500892	5500897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16399	NC_013440	GAC	2	6	5500952	5500957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16400	NC_013440	CGC	2	6	5505461	5505466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16401	NC_013440	TGC	2	6	5505467	5505472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16402	NC_013440	CGA	2	6	5505478	5505483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16403	NC_013440	GC	4	8	5507420	5507427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16404	NC_013440	CGC	2	6	5507464	5507469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16407	NC_013440	CCCTGC	2	12	5509671	5509682	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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16413	NC_013440	GGC	2	6	5518361	5518366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16416	NC_013440	GC	4	8	5518489	5518496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16417	NC_013440	C	6	6	5518502	5518507	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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16422	NC_013440	CGGG	2	8	5518651	5518658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16423	NC_013440	CTAT	2	8	5518666	5518673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16426	NC_013440	G	6	6	5519909	5519914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16427	NC_013440	TCG	2	6	5519981	5519986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16431	NC_013440	CACT	2	8	5520910	5520917	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16432	NC_013440	TGGC	2	8	5520943	5520950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16437	NC_013440	AG	3	6	5522061	5522066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16439	NC_013440	CT	3	6	5522166	5522171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16440	NC_013440	CG	3	6	5522245	5522250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16441	NC_013440	CGC	2	6	5522265	5522270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16476	NC_013440	AG	3	6	5540076	5540081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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