MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 28668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_013440	GAAAC	2	10	5134706	5134715	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15502	NC_013440	CCGG	2	8	5134747	5134754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15503	NC_013440	GGCTC	2	10	5134833	5134842	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15504	NC_013440	GGC	2	6	5135868	5135873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_013440	CG	3	6	5135888	5135893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15506	NC_013440	CGGA	2	8	5136769	5136776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15507	NC_013440	GCC	2	6	5136811	5136816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15508	NC_013440	GCCG	2	8	5137970	5137977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15509	NC_013440	GA	3	6	5137999	5138004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_013440	CG	3	6	5138687	5138692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15511	NC_013440	GAG	2	6	5139846	5139851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_013440	GCC	2	6	5141309	5141314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15513	NC_013440	TGT	2	6	5141378	5141383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_013440	GC	3	6	5141410	5141415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15515	NC_013440	ATA	2	6	5142371	5142376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_013440	TA	3	6	5142375	5142380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_013440	CGA	3	9	5142451	5142459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15518	NC_013440	CAG	2	6	5142475	5142480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15519	NC_013440	CCG	2	6	5142512	5142517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15520	NC_013440	GAAA	2	8	5144537	5144544	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_013440	A	7	7	5144542	5144548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_013440	CCGTCC	2	12	5144571	5144582	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15523	NC_013440	CTTA	2	8	5144672	5144679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15524	NC_013440	GCT	2	6	5145358	5145363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15525	NC_013440	GAATA	2	10	5145389	5145398	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_013440	CGA	2	6	5149050	5149055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15527	NC_013440	CG	4	8	5149095	5149102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15528	NC_013440	CGC	2	6	5149111	5149116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15529	NC_013440	GC	3	6	5149115	5149120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15530	NC_013440	CGCAG	2	10	5149133	5149142	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15531	NC_013440	GGC	2	6	5149151	5149156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_013440	TC	3	6	5149541	5149546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15533	NC_013440	GGT	2	6	5149839	5149844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_013440	GAC	2	6	5149847	5149852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15535	NC_013440	GTC	2	6	5149857	5149862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15536	NC_013440	CGA	2	6	5149881	5149886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_013440	GAA	2	6	5149893	5149898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_013440	CGC	2	6	5149902	5149907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15539	NC_013440	GCGG	2	8	5149926	5149933	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15540	NC_013440	CCG	2	6	5149941	5149946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15541	NC_013440	CGA	2	6	5150086	5150091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_013440	GAA	2	6	5150109	5150114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_013440	CG	3	6	5150119	5150124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15544	NC_013440	GCC	3	9	5150143	5150151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15545	NC_013440	CGA	2	6	5150182	5150187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_013440	GC	3	6	5150221	5150226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15547	NC_013440	CGC	2	6	5150294	5150299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15548	NC_013440	GCG	2	6	5150326	5150331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15549	NC_013440	CG	3	6	5150330	5150335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15550	NC_013440	CCCG	2	8	5150336	5150343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15551	NC_013440	GCA	2	6	5154878	5154883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15552	NC_013440	CGC	2	6	5154931	5154936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15553	NC_013440	CG	3	6	5157390	5157395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15554	NC_013440	GCC	2	6	5157442	5157447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15555	NC_013440	CGC	2	6	5160864	5160869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15556	NC_013440	GCT	2	6	5160898	5160903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_013440	CGC	2	6	5160955	5160960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15558	NC_013440	CCA	2	6	5164102	5164107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15559	NC_013440	CGAG	2	8	5164221	5164228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15560	NC_013440	AG	3	6	5164227	5164232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_013440	GC	3	6	5164552	5164557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15562	NC_013440	CTG	2	6	5165342	5165347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15563	NC_013440	GCG	2	6	5165362	5165367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15564	NC_013440	AGC	2	6	5172389	5172394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15565	NC_013440	GCA	2	6	5172406	5172411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15566	NC_013440	CGG	2	6	5172415	5172420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15567	NC_013440	GGC	2	6	5172462	5172467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15568	NC_013440	CGC	2	6	5172477	5172482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15569	NC_013440	GC	3	6	5172488	5172493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15570	NC_013440	CAA	2	6	5175391	5175396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15571	NC_013440	TTA	2	6	5175421	5175426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_013440	GCG	2	6	5175474	5175479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15573	NC_013440	CG	3	6	5175546	5175551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15574	NC_013440	GCA	2	6	5175564	5175569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15575	NC_013440	CG	3	6	5175591	5175596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15576	NC_013440	GCG	2	6	5177792	5177797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15577	NC_013440	GCC	2	6	5178619	5178624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15578	NC_013440	TGCC	2	8	5178647	5178654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15579	NC_013440	C	6	6	5178718	5178723	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15580	NC_013440	TG	3	6	5178747	5178752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_013440	GCG	2	6	5179930	5179935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15582	NC_013440	C	7	7	5179965	5179971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15583	NC_013440	CGCC	2	8	5179985	5179992	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15584	NC_013440	CTC	2	6	5179993	5179998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15588	NC_013440	GCG	3	9	5181937	5181945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15589	NC_013440	GC	3	6	5181965	5181970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15590	NC_013440	ACA	2	6	5183258	5183263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15591	NC_013440	TGG	2	6	5183332	5183337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_013440	CG	3	6	5183538	5183543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15593	NC_013440	CGC	2	6	5183546	5183551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15594	NC_013440	GCCGGC	2	12	5183553	5183564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15595	NC_013440	GC	4	8	5184286	5184293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15596	NC_013440	GCG	2	6	5184296	5184301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15597	NC_013440	CTAGC	2	10	5184314	5184323	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15598	NC_013440	CGGT	2	8	5184375	5184382	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15599	NC_013440	CGCC	2	8	5184383	5184390	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15600	NC_013440	GCC	3	9	5184388	5184396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15601	NC_013440	CT	4	8	5187135	5187142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15602	NC_013440	GC	3	6	5190816	5190821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15603	NC_013440	GCG	2	6	5191638	5191643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15604	NC_013440	C	6	6	5191644	5191649	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15605	NC_013440	GCG	2	6	5191667	5191672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15606	NC_013440	CG	3	6	5191679	5191684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15607	NC_013440	GCT	2	6	5191701	5191706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15608	NC_013440	GGAC	2	8	5193827	5193834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15609	NC_013440	AGG	2	6	5193856	5193861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_013440	GGAT	2	8	5193877	5193884	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_013440	AGC	2	6	5193897	5193902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15612	NC_013440	CAAG	2	8	5193907	5193914	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15613	NC_013440	CCG	2	6	5193915	5193920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15614	NC_013440	CGA	2	6	5196348	5196353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15615	NC_013440	GCA	2	6	5196354	5196359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15616	NC_013440	AGCA	2	8	5196381	5196388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15617	NC_013440	GC	4	8	5196438	5196445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15618	NC_013440	CCGCA	2	10	5196454	5196463	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15619	NC_013440	CGCGC	2	10	5196472	5196481	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15620	NC_013440	CGA	2	6	5196493	5196498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15621	NC_013440	GCC	2	6	5196531	5196536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15622	NC_013440	C	6	6	5196543	5196548	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15623	NC_013440	TGC	2	6	5196549	5196554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15624	NC_013440	GCGCCG	2	12	5196576	5196587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15625	NC_013440	GCA	2	6	5196593	5196598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15626	NC_013440	CCCG	2	8	5196601	5196608	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15627	NC_013440	GAT	2	6	5196623	5196628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_013440	CAGC	2	8	5196641	5196648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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15630	NC_013440	CCTGG	2	10	5196679	5196688	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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15751	NC_013440	GC	3	6	5231581	5231586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15752	NC_013440	CT	3	6	5231591	5231596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15755	NC_013440	CGC	2	6	5234876	5234881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15762	NC_013440	CG	3	6	5242297	5242302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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