MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 28668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_013440	CCGG	2	8	4316994	4317001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13502	NC_013440	GAC	2	6	4317006	4317011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_013440	TG	3	6	4317042	4317047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_013440	AGG	2	6	4324809	4324814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_013440	CGGC	2	8	4324815	4324822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13506	NC_013440	GC	4	8	4324827	4324834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13507	NC_013440	GGC	2	6	4324839	4324844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_013440	GCCG	2	8	4324846	4324853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13509	NC_013440	CTTC	2	8	4326205	4326212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13510	NC_013440	ATC	2	6	4326248	4326253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_013440	ATT	2	6	4326312	4326317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_013440	GAC	2	6	4326331	4326336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_013440	ACC	2	6	4326361	4326366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13514	NC_013440	TCA	2	6	4326371	4326376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_013440	GCG	2	6	4326386	4326391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13516	NC_013440	CGTG	2	8	4326467	4326474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13517	NC_013440	GC	3	6	4326533	4326538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13518	NC_013440	ACT	2	6	4327445	4327450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_013440	GCG	2	6	4327494	4327499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_013440	GC	5	10	4327520	4327529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13521	NC_013440	CGC	2	6	4327533	4327538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13522	NC_013440	GCT	2	6	4328091	4328096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13523	NC_013440	AGC	2	6	4328097	4328102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_013440	CGGA	2	8	4328123	4328130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13525	NC_013440	GCGA	2	8	4332356	4332363	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13526	NC_013440	CCG	2	6	4332376	4332381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13527	NC_013440	GC	3	6	4332386	4332391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13528	NC_013440	CCG	2	6	4332500	4332505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13529	NC_013440	CAGC	2	8	4332527	4332534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13530	NC_013440	CGACCA	2	12	4332628	4332639	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13531	NC_013440	C	6	6	4332651	4332656	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13532	NC_013440	CCA	2	6	4332674	4332679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13533	NC_013440	TGC	2	6	4332684	4332689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13534	NC_013440	GC	3	6	4332688	4332693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13535	NC_013440	ACC	2	6	4332703	4332708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13536	NC_013440	CAAC	2	8	4332725	4332732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13537	NC_013440	CGC	2	6	4332753	4332758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13538	NC_013440	GGC	2	6	4332801	4332806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13539	NC_013440	GCGCG	2	10	4332835	4332844	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13540	NC_013440	CG	3	6	4337656	4337661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13541	NC_013440	CTG	2	6	4338190	4338195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13542	NC_013440	AAAGC	2	10	4338211	4338220	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13543	NC_013440	GCT	2	6	4338287	4338292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_013440	CGCGG	2	10	4338322	4338331	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13545	NC_013440	CGC	2	6	4338338	4338343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13546	NC_013440	CCG	2	6	4341121	4341126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13547	NC_013440	GCC	2	6	4341132	4341137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13548	NC_013440	AGC	2	6	4341176	4341181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13549	NC_013440	CGA	2	6	4341197	4341202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_013440	CAG	2	6	4341225	4341230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13551	NC_013440	CGAC	2	8	4341265	4341272	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13552	NC_013440	AAC	2	6	4341274	4341279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_013440	TTC	2	6	4341321	4341326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_013440	GC	3	6	4341998	4342003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13555	NC_013440	GC	3	6	4342008	4342013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13556	NC_013440	CCG	2	6	4342046	4342051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13557	NC_013440	CG	5	10	4342078	4342087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13558	NC_013440	CG	3	6	4342094	4342099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13559	NC_013440	CTG	2	6	4342101	4342106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13560	NC_013440	CG	3	6	4342132	4342137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13561	NC_013440	CGTG	2	8	4342142	4342149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13562	NC_013440	TAC	2	6	4342153	4342158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_013440	GC	3	6	4342159	4342164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13564	NC_013440	G	7	7	4342220	4342226	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_013440	CGAG	2	8	4342240	4342247	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13566	NC_013440	CGTC	2	8	4344844	4344851	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13567	NC_013440	CGC	2	6	4344858	4344863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13568	NC_013440	GC	3	6	4344862	4344867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13569	NC_013440	AGC	2	6	4344877	4344882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13570	NC_013440	CGG	2	6	4344884	4344889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13571	NC_013440	CG	4	8	4344893	4344900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13572	NC_013440	CGG	2	6	4344943	4344948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13573	NC_013440	GCC	2	6	4346186	4346191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13574	NC_013440	GGA	2	6	4346792	4346797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_013440	CCG	2	6	4347302	4347307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13576	NC_013440	CG	3	6	4347306	4347311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13577	NC_013440	TGG	2	6	4347357	4347362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_013440	GCG	2	6	4347379	4347384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13579	NC_013440	AGC	2	6	4347412	4347417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13580	NC_013440	CCGA	2	8	4347441	4347448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13581	NC_013440	GTC	2	6	4347458	4347463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13582	NC_013440	CGT	2	6	4348035	4348040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13583	NC_013440	GCC	2	6	4348050	4348055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13584	NC_013440	GCC	2	6	4348065	4348070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13585	NC_013440	GCC	2	6	4348079	4348084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13586	NC_013440	CGG	2	6	4348085	4348090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13587	NC_013440	GC	3	6	4348150	4348155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13588	NC_013440	CCG	2	6	4348172	4348177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13589	NC_013440	ATC	2	6	4348190	4348195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13590	NC_013440	CGG	2	6	4348202	4348207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13591	NC_013440	TTC	2	6	4348250	4348255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13592	NC_013440	CGG	2	6	4348266	4348271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13593	NC_013440	GT	3	6	4348322	4348327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_013440	GTC	2	6	4348389	4348394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13595	NC_013440	CCGC	2	8	4348471	4348478	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13596	NC_013440	TCTA	2	8	4348602	4348609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13597	NC_013440	TGG	2	6	4348648	4348653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_013440	GT	3	6	4348662	4348667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_013440	GGT	2	6	4348669	4348674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_013440	C	6	6	4348689	4348694	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13601	NC_013440	GC	3	6	4350455	4350460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13602	NC_013440	GGT	2	6	4350461	4350466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_013440	CGC	2	6	4356375	4356380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13604	NC_013440	TCGCGT	2	12	4356383	4356394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_013440	CGG	2	6	4356398	4356403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13606	NC_013440	CTG	2	6	4356445	4356450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13607	NC_013440	CG	4	8	4357541	4357548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13608	NC_013440	CG	3	6	4357552	4357557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13609	NC_013440	GA	3	6	4357558	4357563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_013440	TCGA	2	8	4357564	4357571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13611	NC_013440	CGAG	2	8	4357585	4357592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13612	NC_013440	ATCG	2	8	4357605	4357612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13613	NC_013440	GCTC	2	8	4357622	4357629	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13614	NC_013440	GA	3	6	4357642	4357647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_013440	TCGA	2	8	4357648	4357655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13616	NC_013440	TGG	2	6	4357656	4357661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_013440	GCTC	2	8	4357664	4357671	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13618	NC_013440	GATC	2	8	4357688	4357695	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13619	NC_013440	AGCG	2	8	4357713	4357720	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13620	NC_013440	CATGGA	2	12	4357724	4357735	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13621	NC_013440	CTCG	2	8	4357749	4357756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13622	NC_013440	GA	3	6	4357768	4357773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_013440	TCGA	2	8	4357774	4357781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13624	NC_013440	CATGGA	2	12	4357808	4357819	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13625	NC_013440	CG	4	8	4357835	4357842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13626	NC_013440	GATC	2	8	4357856	4357863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13627	NC_013440	GCTC	2	8	4357874	4357881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13628	NC_013440	TGG	2	6	4357908	4357913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13630	NC_013440	CGACA	2	10	4357932	4357941	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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