MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 28668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013440	TCA	2	6	4174296	4174301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_013440	GT	3	6	4178294	4178299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_013440	ATG	2	6	4178320	4178325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_013440	CGAG	2	8	4178390	4178397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13005	NC_013440	GAG	3	9	4178395	4178403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_013440	TG	3	6	4180476	4180481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_013440	GACC	2	8	4180524	4180531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13008	NC_013440	ACC	2	6	4180580	4180585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13009	NC_013440	CGCAG	2	10	4180630	4180639	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13010	NC_013440	ATAA	2	8	4180712	4180719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_013440	CG	3	6	4180879	4180884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13012	NC_013440	TCCG	2	8	4180902	4180909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13013	NC_013440	GGC	2	6	4180922	4180927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_013440	AGC	2	6	4180953	4180958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_013440	AGCG	2	8	4184850	4184857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13016	NC_013440	GGT	2	6	4184901	4184906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_013440	GAT	2	6	4184958	4184963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_013440	CCG	2	6	4184974	4184979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13019	NC_013440	GGC	2	6	4185009	4185014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_013440	CAC	2	6	4185099	4185104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13021	NC_013440	CAG	2	6	4185213	4185218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_013440	GCTT	2	8	4185258	4185265	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13023	NC_013440	ATG	3	9	4185283	4185291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_013440	CGAA	2	8	4185310	4185317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13025	NC_013440	CGTG	2	8	4186170	4186177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13026	NC_013440	GC	3	6	4186178	4186183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13027	NC_013440	CCTCCG	2	12	4186189	4186200	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
13028	NC_013440	GA	3	6	4186245	4186250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_013440	GC	3	6	4186253	4186258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13030	NC_013440	AGT	2	6	4186267	4186272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_013440	CGG	2	6	4186276	4186281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_013440	TTG	2	6	4186308	4186313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_013440	GGC	2	6	4186323	4186328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_013440	CGGC	2	8	4186371	4186378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_013440	GCC	2	6	4187916	4187921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13036	NC_013440	CG	3	6	4187981	4187986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13037	NC_013440	GAA	2	6	4188092	4188097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_013440	GC	3	6	4188529	4188534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13039	NC_013440	GC	3	6	4189023	4189028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13040	NC_013440	CGG	2	6	4189787	4189792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_013440	GTGCGC	2	12	4189826	4189837	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_013440	GCG	2	6	4189845	4189850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_013440	GAG	2	6	4189912	4189917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_013440	CG	3	6	4190292	4190297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13045	NC_013440	ATTG	2	8	4191289	4191296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_013440	GC	3	6	4191335	4191340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13047	NC_013440	CG	4	8	4191343	4191350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13048	NC_013440	CGC	2	6	4191356	4191361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13049	NC_013440	GCG	2	6	4191384	4191389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_013440	CAGAA	2	10	4191405	4191414	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13051	NC_013440	CCG	2	6	4191445	4191450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13052	NC_013440	CG	4	8	4191460	4191467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13053	NC_013440	TCG	3	9	4191472	4191480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_013440	CG	3	6	4191513	4191518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_013440	CTT	2	6	4191530	4191535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_013440	GC	3	6	4191565	4191570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13057	NC_013440	GC	3	6	4191579	4191584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_013440	TGG	2	6	4191627	4191632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_013440	ACC	2	6	4191648	4191653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13060	NC_013440	TGC	2	6	4191659	4191664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_013440	GC	3	6	4191691	4191696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13062	NC_013440	GCC	2	6	4191703	4191708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13063	NC_013440	GT	3	6	4191715	4191720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_013440	GA	3	6	4191780	4191785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_013440	CTT	2	6	4191803	4191808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_013440	CGGC	2	8	4191852	4191859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13067	NC_013440	GC	3	6	4191858	4191863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13068	NC_013440	A	6	6	4191872	4191877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_013440	CG	3	6	4191920	4191925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13070	NC_013440	CG	3	6	4191972	4191977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13071	NC_013440	A	9	9	4191996	4192004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_013440	CAT	2	6	4192005	4192010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13074	NC_013440	AAC	2	6	4192106	4192111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_013440	GCG	2	6	4192951	4192956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13077	NC_013440	T	6	6	4192996	4193001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_013440	GCC	2	6	4193036	4193041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13081	NC_013440	GCCG	2	8	4194347	4194354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13082	NC_013440	TC	3	6	4195233	4195238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13083	NC_013440	GCG	2	6	4195288	4195293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_013440	A	8	8	4195339	4195346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_013440	GCGA	2	8	4195349	4195356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13086	NC_013440	CG	3	6	4195362	4195367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13089	NC_013440	GCG	2	6	4195850	4195855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_013440	TGC	3	9	4195893	4195901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13095	NC_013440	AG	3	6	4200210	4200215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_013440	GT	3	6	4200306	4200311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_013440	GT	3	6	4200318	4200323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_013440	T	7	7	4200505	4200511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_013440	TCG	2	6	4200519	4200524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13101	NC_013440	TCA	2	6	4200602	4200607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_013440	GCG	3	9	4200627	4200635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_013440	CTTTC	2	10	4201694	4201703	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13104	NC_013440	AGG	2	6	4203302	4203307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13106	NC_013440	GC	3	6	4207208	4207213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13107	NC_013440	GGC	2	6	4207221	4207226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13109	NC_013440	CGG	2	6	4215659	4215664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_013440	GTCT	2	8	4218989	4218996	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13111	NC_013440	GCC	2	6	4222299	4222304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13112	NC_013440	GCT	2	6	4222310	4222315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_013440	CG	4	8	4222417	4222424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13114	NC_013440	CG	3	6	4222453	4222458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13115	NC_013440	CCCG	2	8	4224203	4224210	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13116	NC_013440	GGT	2	6	4224211	4224216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_013440	CGG	2	6	4224233	4224238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_013440	GC	3	6	4224242	4224247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13119	NC_013440	CG	3	6	4224261	4224266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13120	NC_013440	G	6	6	4224266	4224271	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_013440	GCT	2	6	4224307	4224312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_013440	CCGGG	2	10	4224314	4224323	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13123	NC_013440	TGA	2	6	4224338	4224343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_013440	ATGCG	2	10	4224426	4224435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13125	NC_013440	AG	3	6	4224451	4224456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_013440	ACGC	2	8	4224457	4224464	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_013440	GC	3	6	4224463	4224468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13128	NC_013440	CGCGC	2	10	4224547	4224556	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13129	NC_013440	CG	3	6	4224594	4224599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13130	NC_013440	GCC	2	6	4225938	4225943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13132	NC_013440	A	7	7	4225982	4225988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13134	NC_013440	CGC	2	6	4226042	4226047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13243	NC_013440	GGAGA	2	10	4258359	4258368	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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13245	NC_013440	GCG	2	6	4258700	4258705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13246	NC_013440	CGAG	2	8	4258707	4258714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13247	NC_013440	CGGCGC	2	12	4258726	4258737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13248	NC_013440	CG	3	6	4258744	4258749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13249	NC_013440	TGC	2	6	4258802	4258807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13250	NC_013440	CG	3	6	4258832	4258837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13251	NC_013440	GGC	3	9	4260164	4260172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13254	NC_013440	TGGATA	2	12	4260251	4260262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13255	NC_013440	GTC	2	6	4260316	4260321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13257	NC_013440	GC	3	6	4260409	4260414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13258	NC_013440	CGTG	2	8	4260479	4260486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13259	NC_013440	TCC	2	6	4260565	4260570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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