MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 28668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013440	CGC	2	6	3954487	3954492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12502	NC_013440	CCCCT	2	10	3954504	3954513	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
12503	NC_013440	A	6	6	3954541	3954546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_013440	TCGA	2	8	3954595	3954602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12505	NC_013440	CGA	2	6	3954625	3954630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_013440	GTTC	2	8	3954709	3954716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12507	NC_013440	ACC	2	6	3954766	3954771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12508	NC_013440	ACG	2	6	3955831	3955836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_013440	GTC	2	6	3955865	3955870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_013440	AG	4	8	3955950	3955957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_013440	AGA	2	6	3956945	3956950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_013440	GAT	2	6	3957039	3957044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_013440	ACA	2	6	3957052	3957057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_013440	TGT	2	6	3957164	3957169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_013440	CCCG	2	8	3957208	3957215	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12516	NC_013440	GCG	2	6	3957271	3957276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_013440	GC	3	6	3957291	3957296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12518	NC_013440	GC	4	8	3957320	3957327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12519	NC_013440	TCG	2	6	3957328	3957333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_013440	ACC	2	6	3957357	3957362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12521	NC_013440	CTT	2	6	3957437	3957442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_013440	GCG	2	6	3957443	3957448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_013440	AGG	2	6	3957452	3957457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_013440	TCGA	2	8	3957479	3957486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12525	NC_013440	GTC	2	6	3957575	3957580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_013440	CGAAG	2	10	3957603	3957612	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12527	NC_013440	GTG	2	6	3957641	3957646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_013440	GC	3	6	3957680	3957685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12529	NC_013440	CTC	2	6	3958007	3958012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12530	NC_013440	GT	3	6	3958035	3958040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_013440	AGG	2	6	3958057	3958062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_013440	AGG	2	6	3958091	3958096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_013440	ATC	2	6	3959413	3959418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_013440	ACGA	2	8	3959496	3959503	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12535	NC_013440	CCA	2	6	3959606	3959611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12536	NC_013440	CCACG	2	10	3959623	3959632	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12537	NC_013440	TCG	2	6	3959635	3959640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_013440	TACCG	2	10	3959694	3959703	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12539	NC_013440	ACCG	2	8	3959706	3959713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12540	NC_013440	GTC	2	6	3959775	3959780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_013440	ATCGA	2	10	3959797	3959806	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12542	NC_013440	CTC	2	6	3959825	3959830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_013440	GCTCCT	2	12	3959852	3959863	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12544	NC_013440	CG	3	6	3959877	3959882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12545	NC_013440	CTC	2	6	3959892	3959897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12546	NC_013440	CG	3	6	3959976	3959981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12547	NC_013440	GGA	2	6	3960047	3960052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_013440	GCT	2	6	3960215	3960220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_013440	GCA	2	6	3960286	3960291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12550	NC_013440	CGG	2	6	3960337	3960342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_013440	CAG	2	6	3960387	3960392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_013440	GAAG	2	8	3960485	3960492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_013440	CCG	2	6	3960515	3960520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12554	NC_013440	GAG	2	6	3960531	3960536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_013440	CAC	2	6	3960930	3960935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12556	NC_013440	GCA	2	6	3960965	3960970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12557	NC_013440	CGC	2	6	3961024	3961029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12558	NC_013440	TCG	2	6	3961078	3961083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_013440	GGC	2	6	3961155	3961160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_013440	CGC	2	6	3961173	3961178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12561	NC_013440	CCG	2	6	3961203	3961208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12562	NC_013440	CCTGCG	2	12	3961220	3961231	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12563	NC_013440	CGGCG	2	10	3961289	3961298	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12564	NC_013440	TCT	2	6	3961348	3961353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_013440	GCC	2	6	3961371	3961376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12566	NC_013440	GC	3	6	3961391	3961396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12567	NC_013440	CTT	2	6	3961415	3961420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12568	NC_013440	CGG	2	6	3961421	3961426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12569	NC_013440	CG	3	6	3961432	3961437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12570	NC_013440	CTG	2	6	3961440	3961445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_013440	GCT	2	6	3961508	3961513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_013440	CGC	2	6	3961520	3961525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12573	NC_013440	CG	4	8	3961559	3961566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12574	NC_013440	GC	3	6	3961589	3961594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12575	NC_013440	CG	4	8	3961604	3961611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12576	NC_013440	CGC	2	6	3961622	3961627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12577	NC_013440	GC	3	6	3961626	3961631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12578	NC_013440	GCC	2	6	3961689	3961694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12579	NC_013440	GC	5	10	3961715	3961724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12580	NC_013440	GAA	2	6	3961746	3961751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_013440	CTG	2	6	3961761	3961766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12582	NC_013440	AACG	2	8	3961794	3961801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12583	NC_013440	CAGT	2	8	3961842	3961849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12584	NC_013440	GCT	2	6	3963294	3963299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12585	NC_013440	ACT	2	6	3963372	3963377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12587	NC_013440	CCAC	2	8	3963465	3963472	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12588	NC_013440	GC	3	6	3963473	3963478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12589	NC_013440	CAG	2	6	3963494	3963499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12592	NC_013440	CCG	2	6	3963594	3963599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12594	NC_013440	CGC	2	6	3963616	3963621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12595	NC_013440	GCG	2	6	3963627	3963632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12596	NC_013440	CTC	2	6	3963668	3963673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12597	NC_013440	CGC	2	6	3963685	3963690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12598	NC_013440	GCGCG	2	10	3963781	3963790	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12599	NC_013440	CGC	2	6	3963814	3963819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12600	NC_013440	CG	3	6	3963821	3963826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12601	NC_013440	GTC	3	9	3963833	3963841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_013440	AACCCA	2	12	3965101	3965112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12603	NC_013440	CTG	2	6	3965958	3965963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12604	NC_013440	GGC	2	6	3965989	3965994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12605	NC_013440	GCC	2	6	3966038	3966043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12606	NC_013440	TCG	2	6	3966055	3966060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12607	NC_013440	AC	5	10	3966115	3966124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12608	NC_013440	GAA	2	6	3967104	3967109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_013440	AGA	2	6	3967138	3967143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_013440	CG	3	6	3967156	3967161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12611	NC_013440	GCG	2	6	3967167	3967172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_013440	CTG	2	6	3967855	3967860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_013440	CGG	2	6	3972320	3972325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12614	NC_013440	CTG	2	6	3973324	3973329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12615	NC_013440	ATGG	2	8	3973382	3973389	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12617	NC_013440	GTG	2	6	3973990	3973995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_013440	TTGC	2	8	3974001	3974008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12619	NC_013440	GCA	2	6	3975073	3975078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12620	NC_013440	CT	3	6	3975089	3975094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12621	NC_013440	AGT	2	6	3975132	3975137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_013440	CGA	2	6	3975142	3975147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12623	NC_013440	CACC	2	8	3975193	3975200	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12624	NC_013440	GCC	2	6	3975203	3975208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12625	NC_013440	CCG	2	6	3975211	3975216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12626	NC_013440	CGTC	2	8	3975266	3975273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12628	NC_013440	AGC	2	6	3975338	3975343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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