MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 5445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013422	CG	3	6	2158788	2158793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_013422	TCA	2	6	2158797	2158802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_013422	ATC	2	6	2158814	2158819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_013422	ACG	3	9	2158875	2158883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_013422	ATG	2	6	2158912	2158917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_013422	GATC	2	8	2161795	2161802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4507	NC_013422	GAAG	2	8	2161947	2161954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_013422	TGA	2	6	2162002	2162007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_013422	TCA	2	6	2163271	2163276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_013422	A	8	8	2163345	2163352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_013422	TAGA	2	8	2163368	2163375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_013422	A	6	6	2163400	2163405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_013422	G	6	6	2163421	2163426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_013422	A	7	7	2163429	2163435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_013422	T	7	7	2163494	2163500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_013422	ATC	2	6	2166916	2166921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_013422	GAA	2	6	2167393	2167398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_013422	GAT	2	6	2167604	2167609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_013422	T	6	6	2167652	2167657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_013422	AAC	2	6	2167675	2167680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_013422	TGGC	2	8	2168534	2168541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4522	NC_013422	GAG	2	6	2168608	2168613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_013422	CA	3	6	2168900	2168905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_013422	T	6	6	2168939	2168944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_013422	GCA	2	6	2169017	2169022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_013422	GCG	2	6	2169723	2169728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_013422	C	8	8	2169761	2169768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4528	NC_013422	C	6	6	2169771	2169776	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4529	NC_013422	G	6	6	2169785	2169790	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_013422	G	6	6	2169840	2169845	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_013422	CTT	2	6	2169857	2169862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_013422	C	7	7	2169879	2169885	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4533	NC_013422	GTCC	2	8	2173396	2173403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_013422	AAAT	2	8	2173485	2173492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_013422	TTCG	2	8	2173502	2173509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4536	NC_013422	CAAG	2	8	2173540	2173547	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_013422	TAT	2	6	2173574	2173579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_013422	ATT	2	6	2173581	2173586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_013422	CG	4	8	2174019	2174026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_013422	A	8	8	2174040	2174047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_013422	T	7	7	2174072	2174078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_013422	GGT	2	6	2174214	2174219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_013422	ATC	2	6	2174245	2174250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_013422	G	6	6	2174274	2174279	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_013422	TGC	2	6	2174287	2174292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_013422	GC	3	6	2174297	2174302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_013422	GCAG	2	8	2175267	2175274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4548	NC_013422	TGATTT	2	12	2175289	2175300	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_013422	AAC	2	6	2175333	2175338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_013422	C	7	7	2175421	2175427	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4551	NC_013422	CTCA	2	8	2175460	2175467	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_013422	GAT	2	6	2175508	2175513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4558	NC_013422	A	6	6	2178684	2178689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_013422	CA	3	6	2178752	2178757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4560	NC_013422	GGC	2	6	2178772	2178777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4562	NC_013422	A	6	6	2181912	2181917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_013422	AAT	2	6	2185123	2185128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_013422	GTT	2	6	2185248	2185253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4566	NC_013422	AAT	2	6	2188056	2188061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_013422	TCGAA	2	10	2188173	2188182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4568	NC_013422	TAG	2	6	2188232	2188237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_013422	A	7	7	2188245	2188251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_013422	TGA	2	6	2188702	2188707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_013422	TA	3	6	2189146	2189151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_013422	AAG	2	6	2189159	2189164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4580	NC_013422	GC	3	6	2189465	2189470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4581	NC_013422	CCAG	2	8	2190755	2190762	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4582	NC_013422	CCACG	2	10	2193429	2193438	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4583	NC_013422	T	6	6	2193544	2193549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4586	NC_013422	ATA	2	6	2198015	2198020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4589	NC_013422	GCA	2	6	2198862	2198867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4592	NC_013422	GC	3	6	2198953	2198958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_013422	CGC	2	6	2199007	2199012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4595	NC_013422	CCA	2	6	2199196	2199201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_013422	AC	3	6	2199233	2199238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_013422	CGC	2	6	2199263	2199268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_013422	CGA	2	6	2199378	2199383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_013422	GCA	2	6	2199393	2199398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_013422	TCC	2	6	2199436	2199441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_013422	TGAT	2	8	2199447	2199454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_013422	CAA	2	6	2202437	2202442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_013422	ATTG	2	8	2202557	2202564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_013422	GCG	2	6	2202973	2202978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_013422	GCAA	2	8	2203036	2203043	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4606	NC_013422	AAC	2	6	2204189	2204194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_013422	GCTTT	2	10	2204559	2204568	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4609	NC_013422	GCG	2	6	2204584	2204589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_013422	AGAAA	2	10	2204594	2204603	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_013422	ATG	2	6	2205668	2205673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4614	NC_013422	TCG	2	6	2205750	2205755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_013422	T	6	6	2205781	2205786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4622	NC_013422	GACAA	2	10	2211597	2211606	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4623	NC_013422	GAAC	2	8	2211611	2211618	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4624	NC_013422	CGT	2	6	2211702	2211707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_013422	A	8	8	2211727	2211734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_013422	T	6	6	2212561	2212566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_013422	TGA	3	9	2212620	2212628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_013422	TAAA	2	8	2215836	2215843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_013422	TTGA	2	8	2218334	2218341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_013422	TGC	2	6	2218349	2218354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_013422	CCG	2	6	2218361	2218366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4633	NC_013422	TGGCA	2	10	2218558	2218567	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4634	NC_013422	CA	3	6	2218594	2218599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4757	NC_013422	A	7	7	2275727	2275733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4760	NC_013422	TCT	2	6	2286846	2286851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4762	NC_013422	A	7	7	2288595	2288601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4763	NC_013422	A	6	6	2288622	2288627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4764	NC_013422	AGACAA	2	12	2290024	2290035	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4765	NC_013422	GATC	2	8	2290078	2290085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4766	NC_013422	TCA	2	6	2290099	2290104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4767	NC_013422	GAC	2	6	2290132	2290137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4768	NC_013422	GAAC	2	8	2290147	2290154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4769	NC_013422	CAA	2	6	2290159	2290164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4772	NC_013422	GGA	2	6	2290356	2290361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4777	NC_013422	G	6	6	2291160	2291165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4778	NC_013422	ATC	2	6	2291220	2291225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4782	NC_013422	GTGAA	2	10	2291332	2291341	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4783	NC_013422	TTGT	2	8	2291365	2291372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4802	NC_013422	C	6	6	2292876	2292881	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4803	NC_013422	GCGT	2	8	2293005	2293012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4874	NC_013422	AAGC	2	8	2298110	2298117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4875	NC_013422	TAA	2	6	2298140	2298145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4878	NC_013422	AAT	2	6	2303561	2303566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4879	NC_013422	CAT	2	6	2303579	2303584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4880	NC_013422	CAGC	2	8	2306041	2306048	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4881	NC_013422	TTTCTA	2	12	2306084	2306095	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4882	NC_013422	CCGG	2	8	2312013	2312020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4883	NC_013422	ATC	2	6	2312046	2312051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4885	NC_013422	TAC	2	6	2312080	2312085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4886	NC_013422	CAT	2	6	2313775	2313780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4887	NC_013422	CCG	3	9	2313844	2313852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4889	NC_013422	GC	3	6	2313909	2313914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4890	NC_013422	GTT	2	6	2314085	2314090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4891	NC_013422	TGCA	2	8	2314121	2314128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4892	NC_013422	TCG	2	6	2314203	2314208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4893	NC_013422	GCA	2	6	2314228	2314233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4894	NC_013422	ATC	2	6	2314260	2314265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4895	NC_013422	ATCC	2	8	2314349	2314356	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4896	NC_013422	A	7	7	2316524	2316530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4897	NC_013422	GC	3	6	2316544	2316549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4898	NC_013422	AAACA	2	10	2316820	2316829	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4899	NC_013422	AC	3	6	2316835	2316840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4900	NC_013422	GC	3	6	2316865	2316870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4903	NC_013422	ATC	2	6	2316951	2316956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4908	NC_013422	TCA	3	9	2320474	2320482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4909	NC_013422	GAA	2	6	2320515	2320520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4910	NC_013422	ATCT	2	8	2323756	2323763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4911	NC_013422	AAC	2	6	2323802	2323807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4912	NC_013422	CTC	2	6	2326805	2326810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4927	NC_013422	CG	3	6	2331473	2331478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4928	NC_013422	CG	3	6	2331487	2331492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4933	NC_013422	AAACG	2	10	2337450	2337459	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4934	NC_013422	A	7	7	2338295	2338301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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