MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 chromosome

Total Repeats: 8977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013202	CT	3	6	1114932	1114937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_013202	GTCG	2	8	1114946	1114953	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_013202	CGC	2	6	1114975	1114980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_013202	CTC	2	6	1120236	1120241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_013202	ACGC	2	8	1120251	1120258	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_013202	TCGC	2	8	1120283	1120290	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_013202	TCC	2	6	1120300	1120305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_013202	GGGA	2	8	1120321	1120328	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_013202	CGC	2	6	1120355	1120360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_013202	GC	3	6	1120418	1120423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_013202	TCC	2	6	1120450	1120455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_013202	GC	3	6	1120459	1120464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_013202	ACCC	2	8	1120477	1120484	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3514	NC_013202	CT	3	6	1120485	1120490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_013202	AGCG	2	8	1121187	1121194	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_013202	GGGT	2	8	1121211	1121218	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_013202	GA	3	6	1121913	1121918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_013202	GGT	2	6	1121931	1121936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_013202	CCG	2	6	1122001	1122006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_013202	AGT	2	6	1122254	1122259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013202	TGC	2	6	1123518	1123523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_013202	TCGG	2	8	1123531	1123538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_013202	GACG	2	8	1123550	1123557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_013202	TTC	2	6	1123619	1123624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_013202	CG	3	6	1123659	1123664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_013202	CGG	2	6	1123680	1123685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_013202	GTG	2	6	1123709	1123714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013202	CGG	2	6	1123750	1123755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_013202	TAA	2	6	1124842	1124847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013202	AGTGAA	2	12	1124865	1124876	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013202	GCC	2	6	1124881	1124886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_013202	GAG	2	6	1124928	1124933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_013202	CGT	2	6	1124939	1124944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_013202	ACGG	2	8	1124950	1124957	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3535	NC_013202	ACG	2	6	1126811	1126816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_013202	TGT	2	6	1127932	1127937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_013202	AAG	2	6	1127981	1127986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013202	TA	3	6	1128029	1128034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013202	AG	3	6	1128095	1128100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_013202	GCT	2	6	1128145	1128150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_013202	TCGGT	2	10	1128180	1128189	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3542	NC_013202	ACG	2	6	1128201	1128206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_013202	CT	3	6	1128246	1128251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_013202	AAC	2	6	1128272	1128277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_013202	GT	3	6	1128325	1128330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_013202	GGA	2	6	1128358	1128363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_013202	TTA	2	6	1128379	1128384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_013202	T	6	6	1128413	1128418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_013202	GAG	2	6	1128493	1128498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_013202	TATG	2	8	1128594	1128601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013202	GTT	2	6	1128605	1128610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_013202	TGTT	2	8	1128625	1128632	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_013202	CAA	2	6	1128677	1128682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_013202	CGC	2	6	1128776	1128781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_013202	TA	3	6	1128782	1128787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_013202	AG	3	6	1128821	1128826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013202	TC	3	6	1128860	1128865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_013202	TCG	2	6	1128871	1128876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_013202	GAC	2	6	1128942	1128947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_013202	CGGTC	2	10	1128991	1129000	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3561	NC_013202	TCC	2	6	1129135	1129140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_013202	ATA	2	6	1129175	1129180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_013202	ACA	2	6	1129211	1129216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_013202	CGA	2	6	1129223	1129228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_013202	TCG	2	6	1129254	1129259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_013202	TC	3	6	1129300	1129305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_013202	CT	3	6	1129333	1129338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_013202	GA	3	6	1129383	1129388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_013202	GAC	2	6	1129411	1129416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_013202	GTCG	2	8	1129433	1129440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_013202	CTG	2	6	1129454	1129459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_013202	CCA	2	6	1129476	1129481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_013202	CTGC	2	8	1129501	1129508	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_013202	GA	3	6	1129610	1129615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_013202	TCG	2	6	1129623	1129628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_013202	TCG	2	6	1129634	1129639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_013202	GT	3	6	1129776	1129781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_013202	A	6	6	1129840	1129845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_013202	TAGC	2	8	1129849	1129856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3580	NC_013202	TTC	2	6	1129857	1129862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_013202	TAT	2	6	1129906	1129911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_013202	ACG	2	6	1129918	1129923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_013202	TGGG	2	8	1131830	1131837	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_013202	CGC	2	6	1131850	1131855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_013202	GTC	2	6	1131857	1131862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_013202	CGAC	2	8	1131906	1131913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_013202	TG	3	6	1131985	1131990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_013202	CGC	2	6	1136181	1136186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_013202	AGC	2	6	1136217	1136222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_013202	GCCC	2	8	1136224	1136231	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3591	NC_013202	TTC	2	6	1136240	1136245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_013202	GTA	2	6	1136298	1136303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_013202	GGA	2	6	1137547	1137552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_013202	TCGC	2	8	1137679	1137686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_013202	GT	3	6	1137852	1137857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_013202	GTT	2	6	1138819	1138824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_013202	CCA	2	6	1139486	1139491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_013202	GA	3	6	1140620	1140625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_013202	CTG	2	6	1140645	1140650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_013202	GTC	2	6	1140653	1140658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_013202	CAGA	2	8	1140659	1140666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_013202	GTC	2	6	1141909	1141914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_013202	GCC	2	6	1143050	1143055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_013202	CGTC	2	8	1143056	1143063	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_013202	TCG	2	6	1143076	1143081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_013202	TCGGA	2	10	1143088	1143097	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3607	NC_013202	CTC	2	6	1144042	1144047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_013202	TGG	2	6	1144070	1144075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_013202	TCG	2	6	1144078	1144083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_013202	GCC	2	6	1144084	1144089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_013202	GCCG	2	8	1144115	1144122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_013202	CGC	2	6	1144129	1144134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_013202	CGA	2	6	1145089	1145094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_013202	CCGT	2	8	1145095	1145102	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_013202	CAGCG	2	10	1146895	1146904	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3616	NC_013202	CCT	2	6	1146928	1146933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_013202	CGC	2	6	1148446	1148451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_013202	GGTA	2	8	1150796	1150803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_013202	TTG	2	6	1150833	1150838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_013202	GCA	2	6	1150901	1150906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_013202	ACG	2	6	1150983	1150988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_013202	GAC	2	6	1151046	1151051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_013202	GTC	2	6	1151073	1151078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_013202	TTG	2	6	1151089	1151094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_013202	CAG	2	6	1151145	1151150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_013202	CGG	2	6	1151171	1151176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_013202	ACG	2	6	1151188	1151193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_013202	ATC	2	6	1151199	1151204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_013202	CGG	2	6	1151232	1151237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_013202	CGC	2	6	1151243	1151248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_013202	TCG	2	6	1151336	1151341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_013202	CCG	2	6	1151557	1151562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3633	NC_013202	TCAGA	2	10	1151615	1151624	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3636	NC_013202	GCC	2	6	1151819	1151824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3644	NC_013202	TCA	2	6	1156334	1156339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3661	NC_013202	CTG	2	6	1161187	1161192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3754	NC_013202	GCT	2	6	1181307	1181312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3756	NC_013202	ACTC	2	8	1181363	1181370	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3757	NC_013202	CG	3	6	1181387	1181392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3761	NC_013202	AGT	2	6	1182733	1182738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3762	NC_013202	CGG	2	6	1182768	1182773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3763	NC_013202	CGG	2	6	1183213	1183218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3764	NC_013202	AACG	2	8	1185419	1185426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3870	NC_013202	CGGT	2	8	1230384	1230391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3888	NC_013202	GAAA	2	8	1231566	1231573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3889	NC_013202	AGT	2	6	1231589	1231594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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