MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013158	GCCGA	2	10	1332459	1332468	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3002	NC_013158	A	6	6	1332468	1332473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_013158	CCT	2	6	1332890	1332895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_013158	GTT	2	6	1333906	1333911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_013158	CCG	2	6	1333943	1333948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_013158	ACT	2	6	1333989	1333994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_013158	GGC	2	6	1336460	1336465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_013158	GACA	2	8	1336516	1336523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_013158	GAC	2	6	1338903	1338908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_013158	AAC	2	6	1338942	1338947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_013158	ATA	2	6	1339034	1339039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_013158	GT	3	6	1339111	1339116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_013158	TA	4	8	1340967	1340974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_013158	AATG	2	8	1340990	1340997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_013158	GAC	2	6	1341029	1341034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_013158	CGT	2	6	1341070	1341075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_013158	GT	3	6	1341746	1341751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_013158	CGA	2	6	1341805	1341810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_013158	CAG	2	6	1341845	1341850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_013158	GGC	2	6	1342658	1342663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_013158	TCT	2	6	1342741	1342746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_013158	AG	4	8	1344969	1344976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_013158	GT	3	6	1347210	1347215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_013158	CTA	2	6	1347292	1347297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_013158	CAGT	2	8	1347316	1347323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_013158	ACA	2	6	1347329	1347334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_013158	AT	3	6	1347407	1347412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_013158	CT	3	6	1347452	1347457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_013158	TGA	2	6	1347483	1347488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_013158	CAG	2	6	1347491	1347496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_013158	GTC	2	6	1347515	1347520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_013158	GAC	2	6	1347529	1347534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_013158	GAG	2	6	1347566	1347571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_013158	GCT	2	6	1347611	1347616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_013158	CTA	2	6	1347629	1347634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_013158	GTC	2	6	1347650	1347655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_013158	TGG	2	6	1347696	1347701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_013158	CTGA	2	8	1349300	1349307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_013158	GGT	2	6	1349330	1349335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_013158	TTGGT	2	10	1351358	1351367	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_013158	CAG	2	6	1351456	1351461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_013158	CTCG	2	8	1351468	1351475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_013158	GCTC	2	8	1351480	1351487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_013158	GGC	2	6	1351504	1351509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_013158	CGC	2	6	1351513	1351518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_013158	CCG	2	6	1351540	1351545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_013158	CTG	2	6	1351552	1351557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_013158	TGG	2	6	1351635	1351640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_013158	CG	3	6	1351662	1351667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_013158	GAGC	2	8	1351688	1351695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3051	NC_013158	AGCG	2	8	1351698	1351705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3052	NC_013158	TGA	2	6	1351776	1351781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_013158	CGGC	2	8	1352226	1352233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_013158	TAC	2	6	1352438	1352443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_013158	ATA	2	6	1352457	1352462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_013158	GCC	2	6	1352482	1352487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_013158	CTC	2	6	1352503	1352508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_013158	CTG	2	6	1352512	1352517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_013158	CGC	2	6	1352537	1352542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_013158	TG	3	6	1355332	1355337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_013158	AT	3	6	1355976	1355981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_013158	TCAATT	2	12	1356003	1356014	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3063	NC_013158	AGC	2	6	1356043	1356048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_013158	AT	3	6	1356897	1356902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_013158	GTG	3	9	1356949	1356957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_013158	ACG	2	6	1357071	1357076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_013158	TTCG	2	8	1357117	1357124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3068	NC_013158	GAT	2	6	1357907	1357912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_013158	TG	3	6	1358004	1358009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_013158	TGT	2	6	1358462	1358467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_013158	CGGG	2	8	1360756	1360763	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3072	NC_013158	GCG	2	6	1361218	1361223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_013158	GTC	2	6	1361458	1361463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_013158	GACC	2	8	1363393	1363400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_013158	CTC	2	6	1363424	1363429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_013158	GCG	2	6	1364444	1364449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_013158	CGGT	2	8	1364454	1364461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3078	NC_013158	GCC	2	6	1364849	1364854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3079	NC_013158	CG	3	6	1364857	1364862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_013158	CGC	2	6	1365501	1365506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_013158	CGC	2	6	1365517	1365522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_013158	CGC	2	6	1365546	1365551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_013158	ACG	2	6	1365804	1365809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_013158	TCG	2	6	1366846	1366851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_013158	GTC	2	6	1366861	1366866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_013158	GAG	2	6	1367710	1367715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_013158	CTC	2	6	1367792	1367797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_013158	CGA	2	6	1367921	1367926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_013158	CTAAA	2	10	1368005	1368014	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3090	NC_013158	GCC	2	6	1368032	1368037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_013158	CGC	2	6	1368580	1368585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_013158	TGGG	2	8	1368599	1368606	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_013158	AC	3	6	1369877	1369882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_013158	TGGA	2	8	1369886	1369893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_013158	AG	3	6	1369902	1369907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_013158	GAT	2	6	1369916	1369921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_013158	TGT	2	6	1369970	1369975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_013158	TG	3	6	1371280	1371285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_013158	GGT	2	6	1371286	1371291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_013158	GA	3	6	1371297	1371302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_013158	AAT	2	6	1371340	1371345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_013158	TCTT	2	8	1371355	1371362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_013158	TAGA	2	8	1371385	1371392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_013158	TTA	2	6	1371397	1371402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_013158	AAT	2	6	1371416	1371421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_013158	TGA	2	6	1371464	1371469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_013158	TGA	2	6	1371511	1371516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_013158	CCA	2	6	1371531	1371536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_013158	TCG	2	6	1371589	1371594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_013158	CGC	3	9	1373166	1373174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_013158	ATCC	2	8	1373531	1373538	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_013158	TAC	2	6	1373563	1373568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_013158	CCAG	2	8	1373620	1373627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_013158	CGTG	2	8	1375751	1375758	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_013158	GCT	2	6	1375793	1375798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_013158	GGC	2	6	1376324	1376329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_013158	CCACC	2	10	1376399	1376408	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3118	NC_013158	C	6	6	1376407	1376412	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3119	NC_013158	GCT	2	6	1376452	1376457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_013158	CG	3	6	1376458	1376463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_013158	TCA	2	6	1376491	1376496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_013158	ACG	2	6	1376507	1376512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_013158	GA	3	6	1376527	1376532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_013158	GA	3	6	1376553	1376558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_013158	CTA	2	6	1376848	1376853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_013158	CGG	2	6	1377920	1377925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_013158	GTC	2	6	1377928	1377933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_013158	CGG	3	9	1377953	1377961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_013158	CACC	2	8	1377976	1377983	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3130	NC_013158	TCGA	2	8	1378013	1378020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_013158	TGC	2	6	1378632	1378637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_013158	AGG	2	6	1378693	1378698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_013158	GC	3	6	1378730	1378735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3134	NC_013158	CCG	2	6	1381247	1381252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3143	NC_013158	CTTG	2	8	1383422	1383429	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3144	NC_013158	GA	3	6	1383510	1383515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_013158	CT	3	6	1383522	1383527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3241	NC_013158	TGCT	2	8	1418823	1418830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3244	NC_013158	AT	4	8	1419065	1419072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_013158	TCG	2	6	1419175	1419180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3247	NC_013158	GAC	2	6	1419215	1419220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3248	NC_013158	TCG	2	6	1428520	1428525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3252	NC_013158	TCC	3	9	1428745	1428753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3253	NC_013158	TTC	2	6	1428807	1428812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_013158	GGT	2	6	1428819	1428824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3256	NC_013158	CAC	2	6	1429375	1429380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3260	NC_013158	CGAG	2	8	1430825	1430832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3262	NC_013158	TTGG	2	8	1439035	1439042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3274	NC_013158	ATC	2	6	1440453	1440458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3392	NC_013158	CCAT	2	8	1501089	1501096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3393	NC_013158	GGCG	2	8	1501573	1501580	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3394	NC_013158	AGC	2	6	1501603	1501608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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