MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013158	CGA	2	6	705418	705423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_013158	GGC	2	6	707390	707395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_013158	ACC	2	6	709071	709076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_013158	ACG	2	6	709091	709096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_013158	TA	3	6	709123	709128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013158	CGGCCG	2	12	709158	709169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_013158	GGC	2	6	710461	710466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_013158	TTCCC	2	10	710476	710485	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1509	NC_013158	AGC	2	6	710516	710521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_013158	TC	3	6	711318	711323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_013158	AACCGA	2	12	711860	711871	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_013158	CGAC	2	8	714392	714399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_013158	CGAC	2	8	714401	714408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_013158	GGTCG	2	10	714410	714419	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1515	NC_013158	CCGG	2	8	714426	714433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_013158	CG	3	6	714490	714495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_013158	GT	3	6	714515	714520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013158	CGGT	2	8	719663	719670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_013158	TAT	2	6	719714	719719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013158	AC	3	6	719782	719787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_013158	ATC	2	6	719832	719837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_013158	CCG	2	6	719871	719876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_013158	CCG	2	6	719979	719984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_013158	CTT	2	6	719991	719996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_013158	CCG	2	6	720066	720071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_013158	TTCG	2	8	720088	720095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_013158	CCG	2	6	720143	720148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_013158	CG	3	6	720189	720194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_013158	CGC	2	6	720198	720203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_013158	GAA	2	6	720206	720211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013158	GCGA	2	8	720213	720220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_013158	ACGA	2	8	720232	720239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_013158	TCGC	2	8	720271	720278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_013158	TCG	2	6	720438	720443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_013158	AGT	2	6	720444	720449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013158	CGCC	2	8	720511	720518	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1537	NC_013158	CTC	2	6	720544	720549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_013158	CGT	2	6	720571	720576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_013158	AGA	2	6	720577	720582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_013158	ATA	2	6	720665	720670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013158	AT	3	6	720673	720678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013158	CCT	2	6	720698	720703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_013158	CGC	2	6	720743	720748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_013158	C	6	6	720797	720802	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1545	NC_013158	GTCCG	2	10	720808	720817	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1546	NC_013158	TTC	2	6	724176	724181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_013158	GA	3	6	724231	724236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_013158	GGA	2	6	724270	724275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013158	GAC	2	6	724424	724429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_013158	CGC	2	6	724443	724448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_013158	CCGAA	2	10	724467	724476	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1552	NC_013158	CGA	2	6	724522	724527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_013158	CG	3	6	724529	724534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_013158	CCAT	2	8	724541	724548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_013158	GTC	2	6	725247	725252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_013158	GGT	2	6	725284	725289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_013158	ACTG	2	8	725291	725298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_013158	GCGG	2	8	725316	725323	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_013158	GCCGC	2	10	725646	725655	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1560	NC_013158	GGACG	2	10	726211	726220	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1561	NC_013158	CGA	3	9	726221	726229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_013158	TCGA	2	8	726755	726762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_013158	A	6	6	726780	726785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_013158	TG	3	6	726808	726813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013158	CCG	2	6	726822	726827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_013158	CCG	2	6	726836	726841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_013158	GTTC	2	8	730019	730026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_013158	CG	3	6	730029	730034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_013158	TATT	2	8	730067	730074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013158	CCG	2	6	730080	730085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_013158	TGC	2	6	732509	732514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_013158	AGTC	2	8	734658	734665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1573	NC_013158	GCTC	2	8	734679	734686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_013158	CAG	2	6	736989	736994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_013158	CGT	2	6	737027	737032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_013158	GGC	2	6	737035	737040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_013158	CCG	2	6	737078	737083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_013158	TGA	2	6	737114	737119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_013158	CGC	2	6	737145	737150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_013158	CGG	2	6	737202	737207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_013158	AGG	2	6	737228	737233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_013158	CGG	2	6	738746	738751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_013158	ACC	2	6	738771	738776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_013158	C	6	6	739274	739279	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1585	NC_013158	GTC	2	6	739299	739304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_013158	GGTCG	2	10	740355	740364	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1587	NC_013158	GAG	2	6	740413	740418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_013158	CGG	2	6	740432	740437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_013158	GTT	3	9	740458	740466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_013158	GTGG	2	8	742979	742986	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_013158	CGAG	2	8	743030	743037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_013158	AGG	2	6	743653	743658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_013158	AC	3	6	743672	743677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_013158	TCG	2	6	747135	747140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_013158	TC	3	6	747156	747161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_013158	ACC	2	6	747173	747178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_013158	GGC	2	6	747179	747184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_013158	CAG	2	6	747196	747201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_013158	ACA	2	6	747248	747253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_013158	GATG	2	8	748499	748506	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_013158	TGGC	2	8	748507	748514	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_013158	TCC	2	6	748569	748574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_013158	GAC	2	6	749624	749629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_013158	CCGC	2	8	750122	750129	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1605	NC_013158	GAC	2	6	750547	750552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_013158	GC	3	6	751624	751629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_013158	CAGA	2	8	751668	751675	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_013158	TCGT	2	8	751687	751694	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_013158	TA	3	6	751762	751767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013158	AG	3	6	751782	751787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013158	AGGAC	2	10	752422	752431	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1612	NC_013158	GCG	2	6	753846	753851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_013158	TCG	2	6	753876	753881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_013158	GGT	2	6	754406	754411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013158	GTG	2	6	755189	755194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013158	GT	3	6	755220	755225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013158	A	6	6	755694	755699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013158	CGT	2	6	755705	755710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_013158	CGA	2	6	755724	755729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_013158	GCG	2	6	756033	756038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_013158	GCG	2	6	756079	756084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_013158	ACT	2	6	756119	756124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_013158	CGG	2	6	757172	757177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_013158	AAC	2	6	757180	757185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_013158	TC	3	6	757876	757881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_013158	ACC	3	9	757895	757903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_013158	ACC	2	6	761110	761115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_013158	GGT	2	6	767788	767793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013158	TAC	2	6	767822	767827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_013158	GGC	2	6	767829	767834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_013158	TAC	2	6	767835	767840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_013158	CCG	2	6	767867	767872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_013158	TCCG	2	8	767993	768000	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_013158	TAA	2	6	768026	768031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_013158	CAT	2	6	768081	768086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1908	NC_013158	CAA	2	6	849399	849404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1996	NC_013158	CAG	2	6	885580	885585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1999	NC_013158	GCC	2	6	886045	886050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2000	NC_013158	CGAC	2	8	886121	886128	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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