MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013158	GATGC	2	10	479897	479906	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1002	NC_013158	ACG	2	6	479913	479918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_013158	ACC	2	6	479923	479928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_013158	GCC	2	6	479958	479963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_013158	CGT	2	6	479997	480002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_013158	CGA	2	6	480024	480029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_013158	CTGG	2	8	480046	480053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_013158	GTA	2	6	480094	480099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013158	AAC	2	6	480100	480105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_013158	CGA	2	6	480126	480131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_013158	GAGT	2	8	480148	480155	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_013158	AGG	2	6	480162	480167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013158	GCCA	2	8	480183	480190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_013158	GA	3	6	480214	480219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013158	CGG	2	6	480246	480251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_013158	TG	3	6	480252	480257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_013158	ACG	2	6	480287	480292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_013158	TC	3	6	480310	480315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_013158	GGA	2	6	481835	481840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013158	ACG	2	6	481865	481870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_013158	GCC	2	6	481888	481893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_013158	GA	3	6	481910	481915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013158	ACTT	2	8	484956	484963	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_013158	AG	3	6	484971	484976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013158	TGG	2	6	484998	485003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013158	ATC	2	6	485063	485068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_013158	TCG	2	6	485144	485149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_013158	GAC	2	6	485213	485218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_013158	GCG	2	6	485223	485228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_013158	GGAC	2	8	485241	485248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_013158	AAG	2	6	485295	485300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_013158	TGCA	2	8	486701	486708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_013158	CATC	2	8	486723	486730	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_013158	GCCA	2	8	486756	486763	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_013158	GTC	2	6	486769	486774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_013158	CCGC	2	8	486787	486794	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1037	NC_013158	TGAC	2	8	486880	486887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_013158	GAC	2	6	486896	486901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_013158	TGC	2	6	486948	486953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_013158	GGT	2	6	486986	486991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013158	CCGACA	2	12	489382	489393	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_013158	AAC	2	6	490758	490763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_013158	GTC	2	6	490769	490774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_013158	AGT	2	6	490796	490801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013158	CAG	2	6	490826	490831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_013158	AGC	2	6	490874	490879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013158	CAT	2	6	490888	490893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_013158	ACA	2	6	490902	490907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_013158	GGA	2	6	495017	495022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013158	CA	3	6	498387	498392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_013158	CCG	2	6	498403	498408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_013158	GTTG	2	8	499813	499820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_013158	CA	3	6	499828	499833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_013158	GAC	2	6	499855	499860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_013158	TA	3	6	504533	504538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_013158	TGAA	2	8	504546	504553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_013158	CGTCA	2	10	504568	504577	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1058	NC_013158	AAG	2	6	504608	504613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013158	CAGA	2	8	504674	504681	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_013158	GGC	2	6	505311	505316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_013158	ACG	2	6	506510	506515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_013158	ACG	2	6	507518	507523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_013158	AGG	2	6	508813	508818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_013158	GTG	2	6	511488	511493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_013158	GTG	2	6	511568	511573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013158	GAC	2	6	512000	512005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_013158	TCC	2	6	512028	512033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_013158	CCG	2	6	512133	512138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_013158	CGCCA	2	10	513449	513458	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1070	NC_013158	CGGA	2	8	513496	513503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_013158	CGC	2	6	513518	513523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_013158	ACG	2	6	513528	513533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_013158	CCG	2	6	513540	513545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_013158	CCG	2	6	516177	516182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_013158	CCA	2	6	518577	518582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_013158	TCGA	2	8	519135	519142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_013158	ACG	2	6	519147	519152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_013158	CGG	2	6	522308	522313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_013158	TC	3	6	522356	522361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_013158	CAT	2	6	523386	523391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_013158	CGT	2	6	523413	523418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013158	GCT	2	6	523998	524003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_013158	GGT	2	6	524019	524024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013158	CGA	2	6	524030	524035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_013158	GAT	2	6	524093	524098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_013158	TA	3	6	525523	525528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013158	TCA	2	6	525576	525581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_013158	CGA	2	6	525632	525637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_013158	GTA	2	6	525693	525698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_013158	TC	3	6	526276	526281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_013158	GGT	2	6	526299	526304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_013158	GA	3	6	526354	526359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013158	CAA	2	6	526366	526371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_013158	GAA	3	9	526410	526418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013158	AGCG	2	8	526502	526509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_013158	ATTC	2	8	526512	526519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_013158	GC	3	6	526523	526528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_013158	CG	3	6	526529	526534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_013158	GC	3	6	526535	526540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_013158	GGA	2	6	526543	526548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_013158	TCA	2	6	526627	526632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_013158	GA	3	6	526634	526639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013158	CT	3	6	526646	526651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_013158	AAT	2	6	527311	527316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013158	GCCA	2	8	527353	527360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_013158	GGA	2	6	527372	527377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013158	TCGG	2	8	527421	527428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_013158	CGT	2	6	527441	527446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_013158	GT	3	6	527473	527478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_013158	GTC	2	6	529110	529115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_013158	GGA	2	6	529135	529140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013158	TCC	2	6	529149	529154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_013158	CTG	2	6	529740	529745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_013158	TTC	2	6	529747	529752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_013158	TCGG	2	8	529762	529769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_013158	CCG	2	6	531379	531384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_013158	GAC	2	6	532321	532326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_013158	ATC	2	6	532368	532373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_013158	TGA	2	6	532431	532436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_013158	TTG	2	6	532514	532519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013158	GGA	2	6	532559	532564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013158	TGGT	2	8	532724	532731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013158	ACC	2	6	532756	532761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_013158	CA	3	6	532809	532814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_013158	CGA	2	6	533468	533473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_013158	A	6	6	536653	536658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013158	G	6	6	538188	538193	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_013158	GA	3	6	539594	539599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013158	TC	3	6	539607	539612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_013158	CGA	2	6	540690	540695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_013158	CCG	2	6	543637	543642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_013158	CAG	2	6	547163	547168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_013158	GGC	2	6	547169	547174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_013158	GCC	2	6	547617	547622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_013158	GTG	2	6	548714	548719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_013158	GAC	2	6	548762	548767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_013158	CGA	3	9	552496	552504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1143	NC_013158	ACC	2	6	552767	552772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1144	NC_013158	GCA	2	6	552894	552899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1153	NC_013158	AT	3	6	560366	560371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1253	NC_013158	GTCCCT	2	12	615315	615326	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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1255	NC_013158	TCG	2	6	616034	616039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1261	NC_013158	GT	4	8	622017	622024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_013158	ATA	2	6	622028	622033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_013158	CCAAG	2	10	622043	622052	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1264	NC_013158	CG	3	6	622062	622067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_013158	CGA	2	6	622078	622083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_013158	GCG	2	6	624187	624192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1267	NC_013158	TCCC	2	8	624913	624920	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1268	NC_013158	CGA	2	6	624958	624963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1270	NC_013158	GTA	2	6	625281	625286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1281	NC_013158	GA	3	6	630484	630489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1402	NC_013158	CCCG	2	8	659865	659872	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1403	NC_013158	CG	3	6	659902	659907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1405	NC_013158	TCA	2	6	661608	661613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1406	NC_013158	TTG	2	6	661619	661624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_013158	TAT	2	6	661719	661724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_013158	AGC	2	6	661808	661813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_013158	ACT	2	6	661962	661967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_013158	GTC	2	6	662052	662057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_013158	CG	3	6	662102	662107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1412	NC_013158	CGA	2	6	662128	662133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1414	NC_013158	GAG	2	6	662167	662172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_013158	AGCG	2	8	662195	662202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1416	NC_013158	TCGC	2	8	662209	662216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1417	NC_013158	GTA	2	6	662217	662222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1419	NC_013158	GGC	2	6	662270	662275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_013158	CGG	2	6	662344	662349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1422	NC_013158	CCG	2	6	662406	662411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1423	NC_013158	GAG	2	6	662418	662423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_013158	CGC	2	6	662485	662490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1425	NC_013158	CGGG	2	8	662519	662526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1426	NC_013158	AGC	2	6	663250	663255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1428	NC_013158	T	6	6	663680	663685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_013158	GTATC	2	10	663710	663719	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1432	NC_013158	CGG	2	6	666415	666420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1434	NC_013158	CGG	2	6	667589	667594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1435	NC_013158	CTT	2	6	667597	667602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1436	NC_013158	TCG	2	6	667612	667617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1437	NC_013158	AAC	2	6	669419	669424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1438	NC_013158	ACG	2	6	669483	669488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1440	NC_013158	TGC	2	6	669639	669644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_013158	CCA	2	6	670650	670655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1444	NC_013158	CCA	2	6	671258	671263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1445	NC_013158	GCG	2	6	671269	671274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1447	NC_013158	CAGG	2	8	674674	674681	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1449	NC_013158	ACT	2	6	674715	674720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_013158	CGT	2	6	674849	674854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_013158	TGATC	2	10	674858	674867	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1453	NC_013158	AAC	2	6	674900	674905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1454	NC_013158	TCG	2	6	674913	674918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1458	NC_013158	TGC	2	6	677929	677934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1497	NC_013158	GCCG	2	8	704304	704311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1499	NC_013158	CCG	2	6	705327	705332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1500	NC_013158	CGAC	2	8	705365	705372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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