MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013158	ATC	2	6	2924320	2924325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_013158	GGT	2	6	2924333	2924338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_013158	TGT	2	6	2924379	2924384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_013158	AAT	2	6	2924396	2924401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_013158	GC	3	6	2925688	2925693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7006	NC_013158	CAC	2	6	2925701	2925706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7007	NC_013158	TCAA	2	8	2925745	2925752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7008	NC_013158	ATT	2	6	2926812	2926817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_013158	CGG	2	6	2927293	2927298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_013158	TAA	2	6	2928026	2928031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_013158	GTG	2	6	2928032	2928037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_013158	CGT	2	6	2928042	2928047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_013158	CGA	2	6	2928054	2928059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_013158	CGG	2	6	2928799	2928804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_013158	GCG	2	6	2929798	2929803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_013158	CGT	2	6	2929806	2929811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_013158	GTC	3	9	2932578	2932586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_013158	T	6	6	2932619	2932624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_013158	GA	3	6	2932634	2932639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_013158	GCC	2	6	2937230	2937235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_013158	GCC	2	6	2940540	2940545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_013158	GAC	2	6	2940639	2940644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_013158	TCC	2	6	2940765	2940770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_013158	TAT	2	6	2940797	2940802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_013158	TCG	2	6	2940804	2940809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_013158	CCGA	2	8	2940820	2940827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7027	NC_013158	CAGG	2	8	2940852	2940859	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7028	NC_013158	AAG	2	6	2940896	2940901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_013158	A	6	6	2940957	2940962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_013158	ATAA	2	8	2940978	2940985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_013158	GGA	2	6	2947950	2947955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_013158	CAT	2	6	2947956	2947961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_013158	CAG	2	6	2947962	2947967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_013158	TTCTG	2	10	2948061	2948070	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7035	NC_013158	GTA	2	6	2948079	2948084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_013158	CTCC	2	8	2948103	2948110	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7037	NC_013158	GA	3	6	2948192	2948197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_013158	CT	3	6	2948227	2948232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7039	NC_013158	GAC	2	6	2948236	2948241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_013158	TCCGT	2	10	2948249	2948258	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7041	NC_013158	AG	3	6	2950461	2950466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_013158	AAG	2	6	2950471	2950476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_013158	GAC	2	6	2950495	2950500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_013158	TCT	2	6	2951703	2951708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_013158	TTC	2	6	2953864	2953869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_013158	TGC	2	6	2953888	2953893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_013158	TGC	2	6	2954701	2954706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_013158	CCG	2	6	2954733	2954738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_013158	GT	3	6	2954770	2954775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_013158	CCG	2	6	2954776	2954781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7051	NC_013158	TC	3	6	2954783	2954788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7052	NC_013158	TGCC	2	8	2954869	2954876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_013158	GAC	2	6	2957084	2957089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_013158	TCG	2	6	2957099	2957104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_013158	CTC	2	6	2957127	2957132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7056	NC_013158	GCGA	2	8	2957158	2957165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7057	NC_013158	CTCG	2	8	2957174	2957181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7058	NC_013158	GCTCT	2	10	2957222	2957231	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7059	NC_013158	ACG	2	6	2957241	2957246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_013158	CGT	2	6	2957257	2957262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_013158	CGA	2	6	2957271	2957276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_013158	ATTG	2	8	2957286	2957293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_013158	TCT	2	6	2957323	2957328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_013158	AT	3	6	2957357	2957362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_013158	GT	3	6	2957376	2957381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_013158	CGAA	2	8	2958388	2958395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7067	NC_013158	ATCG	2	8	2958460	2958467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7068	NC_013158	GTT	2	6	2958789	2958794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_013158	C	6	6	2958819	2958824	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7070	NC_013158	CTGT	2	8	2959119	2959126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7071	NC_013158	GGC	2	6	2959186	2959191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_013158	CGAC	2	8	2959211	2959218	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7073	NC_013158	TCC	2	6	2959219	2959224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7074	NC_013158	CTG	2	6	2960042	2960047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_013158	GTC	2	6	2961586	2961591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_013158	CTAT	2	8	2961606	2961613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7077	NC_013158	AGTC	2	8	2961634	2961641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7078	NC_013158	CCG	2	6	2961739	2961744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7079	NC_013158	GGA	2	6	2961756	2961761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_013158	AGTC	2	8	2962386	2962393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7081	NC_013158	CCG	2	6	2962396	2962401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7082	NC_013158	C	6	6	2962456	2962461	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7083	NC_013158	GTG	2	6	2962472	2962477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_013158	AC	3	6	2964214	2964219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7085	NC_013158	TAA	2	6	2964226	2964231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_013158	CGA	2	6	2964297	2964302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7087	NC_013158	GTC	2	6	2966069	2966074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_013158	AGG	2	6	2966101	2966106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_013158	TTA	2	6	2966107	2966112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_013158	AGAT	2	8	2966118	2966125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_013158	ACG	2	6	2967397	2967402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_013158	TAAT	2	8	2968604	2968611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_013158	CGA	2	6	2968623	2968628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_013158	GCCG	3	12	2968679	2968690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7095	NC_013158	AGTA	2	8	2969491	2969498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_013158	TA	3	6	2969497	2969502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_013158	GGC	2	6	2970716	2970721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7098	NC_013158	TCG	2	6	2970734	2970739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_013158	GCCC	2	8	2970757	2970764	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7100	NC_013158	ACCG	2	8	2970773	2970780	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7101	NC_013158	CGA	2	6	2970790	2970795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_013158	CCG	2	6	2970828	2970833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_013158	GCCG	2	8	2970934	2970941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7104	NC_013158	CCGG	2	8	2970996	2971003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7105	NC_013158	TC	3	6	2971009	2971014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7106	NC_013158	TCA	2	6	2971036	2971041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_013158	TTA	2	6	2971043	2971048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_013158	TGG	2	6	2973055	2973060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_013158	GGT	2	6	2973645	2973650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_013158	GACGGC	2	12	2973710	2973721	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_013158	TG	3	6	2974984	2974989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_013158	AGA	2	6	2974994	2974999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_013158	CCG	2	6	2975067	2975072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_013158	GCG	2	6	2976558	2976563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_013158	GTG	2	6	2979661	2979666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_013158	CGAG	2	8	2979676	2979683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7117	NC_013158	ACC	2	6	2981638	2981643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7118	NC_013158	GC	3	6	2981691	2981696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7119	NC_013158	CGA	2	6	2981700	2981705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_013158	CT	3	6	2982299	2982304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7121	NC_013158	CGT	2	6	2983905	2983910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_013158	TA	3	6	2983920	2983925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_013158	CGG	2	6	2983942	2983947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_013158	CCA	2	6	2983977	2983982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7125	NC_013158	GCAG	2	8	2983995	2984002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7126	NC_013158	GATC	2	8	2984006	2984013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7127	NC_013158	CGG	2	6	2984019	2984024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_013158	TCG	2	6	2984025	2984030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_013158	GTT	2	6	2984031	2984036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7131	NC_013158	CAC	2	6	2986680	2986685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.