MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 plasmid pHbal01

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012983	TTC	2	6	4095	4100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012983	TG	3	6	5299	5304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012983	AAAT	2	8	10215	10222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012983	ATT	2	6	10229	10234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012983	TCA	2	6	10236	10241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012983	ATT	2	6	10249	10254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012983	AAG	2	6	12174	12179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012983	AT	3	6	13128	13133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012983	AGG	2	6	16101	16106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012983	GCA	2	6	16123	16128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012983	CTGC	2	8	16162	16169	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012983	GTTG	2	8	16277	16284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012983	TCT	2	6	16311	16316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012983	A	6	6	16335	16340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012983	CTT	2	6	16931	16936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012983	T	6	6	16935	16940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012983	CAT	2	6	16955	16960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012983	AT	3	6	16991	16996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012983	A	6	6	17013	17018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012983	TTGA	2	8	17986	17993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012983	AGTTTT	2	12	19964	19975	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012983	TTA	2	6	20821	20826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012983	CCTC	2	8	20861	20868	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_012983	AAT	2	6	20869	20874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012983	TCAG	2	8	22970	22977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012983	ATC	2	6	22979	22984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012983	GT	3	6	22992	22997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012983	ATC	2	6	23138	23143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012983	T	7	7	23193	23199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012983	A	6	6	23261	23266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012983	A	6	6	23320	23325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012983	CTG	2	6	23502	23507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012983	AGC	2	6	23584	23589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012983	AAT	2	6	23634	23639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012983	A	6	6	23695	23700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012983	AC	3	6	23718	23723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012983	GT	3	6	23969	23974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012983	AAAT	2	8	23982	23989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012983	AC	3	6	24043	24048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012983	AAACA	2	10	24056	24065	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012983	T	6	6	24084	24089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012983	TCCT	2	8	24147	24154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012983	CAA	2	6	25454	25459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012983	AAG	2	6	25467	25472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012983	TA	3	6	25542	25547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012983	ACAT	2	8	25577	25584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012983	TA	3	6	25616	25621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012983	CATATA	2	12	25624	25635	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012983	AC	3	6	25649	25654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012983	AT	3	6	25655	25660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012983	TCG	2	6	25708	25713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012983	AG	3	6	25773	25778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012983	TGC	2	6	27068	27073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012983	AAC	2	6	27079	27084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012983	CTT	2	6	27109	27114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012983	TAA	2	6	27130	27135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012983	CAT	2	6	29493	29498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012983	TGC	2	6	30492	30497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012983	AT	3	6	32246	32251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012983	GAT	2	6	32303	32308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012983	GCA	2	6	32310	32315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012983	TAT	2	6	33942	33947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012983	TATC	2	8	33959	33966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012983	TTTA	2	8	37065	37072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012983	GGTTG	2	10	37125	37134	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012983	GGC	2	6	38298	38303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012983	TTGA	2	8	38316	38323	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012983	GTT	2	6	38382	38387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012983	TC	3	6	39566	39571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012983	AAC	2	6	39593	39598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012983	TGGAAT	2	12	39655	39666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012983	A	6	6	40953	40958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012983	GAT	2	6	40979	40984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012983	CAGG	2	8	41241	41248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012983	CTT	2	6	44927	44932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012983	TCG	2	6	44944	44949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012983	T	6	6	44990	44995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012983	GGT	2	6	45001	45006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012983	A	7	7	45085	45091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012983	TTTA	2	8	45111	45118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012983	AG	3	6	45155	45160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012983	TAGA	2	8	45194	45201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012983	TGTC	2	8	52314	52321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012983	ATC	2	6	52370	52375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012983	AT	3	6	52376	52381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012983	TAGT	2	8	52466	52473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012983	T	6	6	52527	52532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012983	TGG	2	6	52560	52565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012983	TC	3	6	52573	52578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012983	A	7	7	52592	52598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012983	T	6	6	52759	52764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012983	GTT	2	6	53708	53713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012983	AT	3	6	53751	53756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012983	TGGT	2	8	56143	56150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012983	ACTCA	2	10	57247	57256	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_012983	ACTG	2	8	57270	57277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012983	ATACC	2	10	57316	57325	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_012983	TCT	2	6	58886	58891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012983	T	6	6	58899	58904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012983	A	8	8	58919	58926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012983	GGGA	2	8	58994	59001	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012983	AGGG	2	8	61698	61705	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012983	GC	3	6	61728	61733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012983	CTG	2	6	61756	61761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012983	AGAT	2	8	61825	61832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012983	TTC	2	6	61898	61903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012983	ATC	2	6	62614	62619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012983	AG	3	6	62630	62635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012983	TAGA	2	8	64091	64098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012983	TTG	2	6	64117	64122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012983	TGG	2	6	64211	64216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012983	AAT	2	6	64218	64223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012983	CCTA	2	8	72586	72593	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012983	A	7	7	72593	72599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012983	ATT	2	6	72647	72652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012983	TGC	2	6	72656	72661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012983	AAT	2	6	72665	72670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012983	GCTTTA	2	12	72687	72698	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_012983	CAT	2	6	72716	72721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012983	GCT	2	6	72810	72815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012983	ACG	2	6	78120	78125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012983	TGA	2	6	78169	78174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012983	ATT	2	6	78177	78182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012983	TCAT	2	8	78235	78242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012983	TCT	2	6	78291	78296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012983	AAAT	2	8	78298	78305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012983	ATCA	2	8	79727	79734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012983	TGG	2	6	80447	80452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012983	T	7	7	80568	80574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012983	TTTG	2	8	80636	80643	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012983	TG	3	6	80642	80647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012983	CAG	2	6	80666	80671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012983	ATC	2	6	82432	82437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012983	ATA	2	6	83312	83317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012983	GAAA	2	8	84485	84492	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.