MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 8508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012029	T	6	6	1362611	1362616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_012029	ACG	2	6	1362661	1362666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_012029	TCGC	2	8	1362676	1362683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_012029	CTG	2	6	1362712	1362717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_012029	CGG	3	9	1362734	1362742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_012029	CGA	2	6	1362753	1362758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_012029	GAGC	2	8	1362761	1362768	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_012029	CGA	2	6	1362772	1362777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_012029	ACG	2	6	1362820	1362825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_012029	GGA	2	6	1362865	1362870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_012029	GGC	2	6	1363275	1363280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_012029	T	6	6	1363300	1363305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_012029	TCC	2	6	1363316	1363321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_012029	GCCA	2	8	1363323	1363330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_012029	CCG	2	6	1363345	1363350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_012029	GCG	3	9	1366449	1366457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_012029	GAG	2	6	1366493	1366498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_012029	GAG	2	6	1366531	1366536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_012029	TCGCGG	2	12	1366571	1366582	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_012029	CGG	2	6	1366589	1366594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_012029	GCG	2	6	1366600	1366605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_012029	CTC	2	6	1366612	1366617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_012029	CTC	2	6	1366645	1366650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_012029	CGG	2	6	1366655	1366660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_012029	GCTG	2	8	1366664	1366671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4026	NC_012029	TCG	3	9	1366679	1366687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_012029	CGG	2	6	1367377	1367382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_012029	ATG	2	6	1367397	1367402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_012029	GCC	2	6	1367413	1367418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_012029	GAC	2	6	1367437	1367442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_012029	AGC	2	6	1367490	1367495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_012029	CGAA	2	8	1367519	1367526	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_012029	CGAA	2	8	1367546	1367553	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_012029	CGAA	2	8	1367573	1367580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_012029	CGT	2	6	1367615	1367620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_012029	ACT	2	6	1367623	1367628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_012029	TAC	2	6	1367653	1367658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_012029	GGT	2	6	1367665	1367670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_012029	CGTT	2	8	1367728	1367735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_012029	GAG	2	6	1367754	1367759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_012029	TTC	2	6	1367770	1367775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_012029	GAA	2	6	1367778	1367783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_012029	GAT	2	6	1367862	1367867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_012029	TG	3	6	1367872	1367877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_012029	TCA	2	6	1367885	1367890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_012029	CTG	2	6	1367928	1367933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_012029	CCT	2	6	1367934	1367939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_012029	CAGT	2	8	1367987	1367994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_012029	TAGC	2	8	1368020	1368027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_012029	CGG	2	6	1368086	1368091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_012029	CGGTC	2	10	1370947	1370956	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4052	NC_012029	GCG	2	6	1370993	1370998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_012029	GGC	2	6	1372012	1372017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_012029	GCCG	2	8	1372041	1372048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_012029	GAC	2	6	1372969	1372974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_012029	CGG	2	6	1373023	1373028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_012029	GGT	2	6	1373481	1373486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_012029	GAG	2	6	1373506	1373511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_012029	CA	3	6	1373599	1373604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_012029	GAT	2	6	1374225	1374230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_012029	CTA	2	6	1374303	1374308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_012029	AGCG	2	8	1374338	1374345	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_012029	GCG	2	6	1374387	1374392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_012029	TGG	2	6	1374397	1374402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_012029	CA	3	6	1374440	1374445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_012029	CGAA	2	8	1374446	1374453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4067	NC_012029	GTGAC	2	10	1374490	1374499	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4068	NC_012029	ACG	2	6	1374505	1374510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_012029	CAG	2	6	1374520	1374525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_012029	GAG	2	6	1374537	1374542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_012029	AAC	2	6	1374567	1374572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_012029	TCG	2	6	1374580	1374585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_012029	CGA	2	6	1374616	1374621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_012029	GCG	2	6	1374651	1374656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_012029	GAT	2	6	1374688	1374693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_012029	ATC	2	6	1374716	1374721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_012029	GGT	2	6	1374755	1374760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_012029	CGT	2	6	1374765	1374770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_012029	TTAC	2	8	1374801	1374808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_012029	GCGA	2	8	1374815	1374822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_012029	GAC	2	6	1374883	1374888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_012029	ACCG	2	8	1374898	1374905	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_012029	AAC	2	6	1374924	1374929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_012029	CCG	2	6	1374949	1374954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_012029	CGT	2	6	1375011	1375016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_012029	TCG	3	9	1375035	1375043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_012029	CGG	2	6	1375045	1375050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_012029	AGTG	2	8	1375081	1375088	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_012029	GAC	2	6	1376100	1376105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_012029	GCC	2	6	1376163	1376168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_012029	CAT	2	6	1376227	1376232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_012029	GGC	2	6	1376292	1376297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_012029	AAC	2	6	1376507	1376512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_012029	CGAC	2	8	1376839	1376846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_012029	GCTCT	2	10	1376854	1376863	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4096	NC_012029	GAC	2	6	1376879	1376884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_012029	GCCC	2	8	1376911	1376918	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4098	NC_012029	CGG	2	6	1377038	1377043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_012029	AGC	2	6	1377108	1377113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_012029	TCG	2	6	1377131	1377136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_012029	ACGA	2	8	1377163	1377170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4102	NC_012029	TCGA	2	8	1377181	1377188	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_012029	TCG	2	6	1377189	1377194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_012029	TCG	2	6	1377200	1377205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_012029	GCG	2	6	1377253	1377258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_012029	ACG	2	6	1377262	1377267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_012029	CGAA	2	8	1377310	1377317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_012029	CGT	2	6	1377321	1377326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_012029	GCGG	2	8	1377362	1377369	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_012029	TCG	2	6	1377468	1377473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_012029	CCGA	2	8	1377488	1377495	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_012029	CGG	2	6	1377500	1377505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_012029	ACC	2	6	1377572	1377577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_012029	GGT	2	6	1377601	1377606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_012029	CTT	2	6	1377620	1377625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_012029	CCA	2	6	1377699	1377704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_012029	GC	3	6	1377727	1377732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_012029	CTGA	2	8	1377794	1377801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_012029	CGCC	2	8	1377870	1377877	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4120	NC_012029	GTCC	2	8	1378682	1378689	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_012029	GTC	2	6	1378697	1378702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_012029	CGGG	2	8	1378737	1378744	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_012029	GC	3	6	1380908	1380913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_012029	GAG	2	6	1381325	1381330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_012029	CGAT	2	8	1381415	1381422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4126	NC_012029	GC	3	6	1381468	1381473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_012029	A	7	7	1381499	1381505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_012029	GT	3	6	1383490	1383495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_012029	GTT	2	6	1383498	1383503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_012029	GAC	2	6	1383536	1383541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_012029	CGG	2	6	1383542	1383547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_012029	AT	3	6	1383559	1383564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_012029	GCG	2	6	1383567	1383572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_012029	ACG	2	6	1383603	1383608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_012029	CGG	2	6	1383638	1383643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_012029	GTT	2	6	1385424	1385429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_012029	AT	3	6	1385476	1385481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_012029	GAG	2	6	1385547	1385552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_012029	GGC	2	6	1385761	1385766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_012029	GAGAA	2	10	1386719	1386728	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4148	NC_012029	TCC	2	6	1387676	1387681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4151	NC_012029	GACG	2	8	1389416	1389423	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4152	NC_012029	CGC	2	6	1389435	1389440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4172	NC_012029	CAA	2	6	1394471	1394476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4255	NC_012029	T	6	6	1415757	1415762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_012029	CGCGC	2	10	1417985	1417994	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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