MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 8508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012029	ATCGT	2	10	1183301	1183310	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3502	NC_012029	TC	3	6	1183608	1183613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_012029	TCG	2	6	1184818	1184823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_012029	CGT	2	6	1184824	1184829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_012029	TCGA	2	8	1184833	1184840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_012029	CA	3	6	1184847	1184852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_012029	GAC	2	6	1186274	1186279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_012029	GTA	2	6	1186282	1186287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_012029	CAG	2	6	1188265	1188270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_012029	CCG	2	6	1188275	1188280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_012029	TC	3	6	1188384	1188389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_012029	CCG	2	6	1188429	1188434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_012029	ACG	3	9	1188884	1188892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_012029	AAG	2	6	1188909	1188914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_012029	GCCC	2	8	1188917	1188924	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3516	NC_012029	CGT	2	6	1190491	1190496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_012029	AAG	2	6	1190513	1190518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_012029	GGC	2	6	1190551	1190556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_012029	TGT	2	6	1193460	1193465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_012029	GCG	2	6	1193476	1193481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_012029	CG	3	6	1194666	1194671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_012029	TCTG	2	8	1195151	1195158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_012029	CTG	2	6	1195161	1195166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_012029	CAG	2	6	1196086	1196091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_012029	CG	3	6	1196138	1196143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_012029	CTCC	2	8	1196207	1196214	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3527	NC_012029	CCG	2	6	1196215	1196220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_012029	TTC	2	6	1196256	1196261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_012029	TAT	2	6	1196273	1196278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_012029	AC	3	6	1196285	1196290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_012029	GGT	2	6	1201621	1201626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_012029	CGG	2	6	1201644	1201649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_012029	CGG	2	6	1201673	1201678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_012029	ACC	2	6	1203476	1203481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_012029	ACCG	2	8	1203491	1203498	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_012029	GTCGA	2	10	1203500	1203509	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3537	NC_012029	TGAA	2	8	1203549	1203556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_012029	TA	3	6	1203574	1203579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_012029	CGG	2	6	1204304	1204309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_012029	ACC	2	6	1205009	1205014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_012029	A	6	6	1205021	1205026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_012029	TCG	2	6	1205028	1205033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_012029	GAG	2	6	1205049	1205054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_012029	ACG	2	6	1205074	1205079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_012029	ACCG	2	8	1205085	1205092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_012029	TCG	2	6	1206615	1206620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_012029	CGA	2	6	1206665	1206670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_012029	GAC	2	6	1206701	1206706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_012029	ACC	2	6	1206730	1206735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_012029	CCCG	2	8	1207715	1207722	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3551	NC_012029	AAC	2	6	1208521	1208526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_012029	TCGA	2	8	1208547	1208554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_012029	TTG	2	6	1208577	1208582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_012029	ACGAT	2	10	1208586	1208595	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3555	NC_012029	CGA	4	12	1208613	1208624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_012029	TAAA	2	8	1208632	1208639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_012029	AGT	2	6	1208681	1208686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_012029	CGG	2	6	1208713	1208718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_012029	GCC	2	6	1208723	1208728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_012029	CG	3	6	1208740	1208745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_012029	AG	3	6	1208760	1208765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_012029	GC	3	6	1208791	1208796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_012029	CGA	2	6	1208805	1208810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_012029	CGA	2	6	1208817	1208822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_012029	GCTGT	2	10	1208840	1208849	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3566	NC_012029	GCGG	2	8	1208850	1208857	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3567	NC_012029	CGG	3	9	1208878	1208886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_012029	GCC	2	6	1208888	1208893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_012029	AGC	2	6	1208909	1208914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_012029	GCGA	2	8	1208915	1208922	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_012029	TAT	2	6	1209067	1209072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_012029	TCG	2	6	1209073	1209078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_012029	CTCGA	2	10	1210394	1210403	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3574	NC_012029	GTA	2	6	1210441	1210446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_012029	GCG	2	6	1210481	1210486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_012029	TCG	2	6	1210502	1210507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_012029	GCG	2	6	1210534	1210539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_012029	GAC	2	6	1210586	1210591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_012029	CCG	2	6	1211042	1211047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_012029	AG	3	6	1211072	1211077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_012029	CCT	2	6	1211109	1211114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_012029	ACG	2	6	1211149	1211154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_012029	GCG	2	6	1213560	1213565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_012029	CGT	2	6	1214906	1214911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_012029	CT	3	6	1216047	1216052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_012029	TC	4	8	1216056	1216063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_012029	CT	3	6	1216065	1216070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_012029	CG	3	6	1218103	1218108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_012029	CGT	2	6	1218112	1218117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_012029	CCG	2	6	1218121	1218126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_012029	TCG	2	6	1218146	1218151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_012029	CGA	2	6	1218773	1218778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_012029	CGT	2	6	1220457	1220462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_012029	TG	3	6	1220522	1220527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_012029	TGTT	2	8	1220553	1220560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_012029	CCA	2	6	1220568	1220573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_012029	CGA	2	6	1220581	1220586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_012029	GCTC	2	8	1220672	1220679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_012029	CGT	2	6	1220745	1220750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_012029	TA	3	6	1220774	1220779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_012029	TGT	2	6	1220782	1220787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_012029	CTG	2	6	1220788	1220793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_012029	AC	3	6	1220812	1220817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_012029	CA	3	6	1220820	1220825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_012029	AT	3	6	1220848	1220853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_012029	TCG	2	6	1220963	1220968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_012029	CTGTCT	2	12	1222136	1222147	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_012029	CGG	2	6	1222174	1222179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_012029	CGG	2	6	1222184	1222189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_012029	TCC	2	6	1222438	1222443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_012029	GACT	2	8	1222559	1222566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_012029	GAC	2	6	1222585	1222590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_012029	ATC	2	6	1222622	1222627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_012029	GAC	2	6	1222637	1222642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_012029	GC	3	6	1222659	1222664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_012029	AAG	2	6	1222768	1222773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_012029	ATT	2	6	1222859	1222864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_012029	TAGT	2	8	1222870	1222877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_012029	GACG	2	8	1222890	1222897	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_012029	GT	3	6	1223986	1223991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_012029	AAG	2	6	1224027	1224032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_012029	GA	3	6	1224042	1224047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_012029	T	6	6	1224089	1224094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_012029	TGT	2	6	1224107	1224112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_012029	CCCGG	2	10	1224201	1224210	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3626	NC_012029	CGG	2	6	1224244	1224249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_012029	TGAG	2	8	1224298	1224305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_012029	ATA	2	6	1224355	1224360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_012029	TAT	2	6	1224370	1224375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_012029	TGG	2	6	1224385	1224390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_012029	TCA	2	6	1224506	1224511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_012029	ACCC	2	8	1224541	1224548	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3633	NC_012029	GTT	2	6	1224561	1224566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3635	NC_012029	GTCA	2	8	1225159	1225166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3636	NC_012029	CGC	2	6	1225177	1225182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3640	NC_012029	CACG	2	8	1226424	1226431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3657	NC_012029	TCGA	2	8	1228380	1228387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3664	NC_012029	CGAT	2	8	1228644	1228651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3748	NC_012029	GGATG	2	10	1261335	1261344	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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3753	NC_012029	TAT	2	6	1262699	1262704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3756	NC_012029	ATC	2	6	1262864	1262869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3757	NC_012029	TATTT	2	10	1262870	1262879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3758	NC_012029	ATAC	2	8	1262925	1262932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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