MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 8508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012029	TAA	2	6	1012903	1012908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_012029	GC	3	6	1012918	1012923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_012029	GA	4	8	1012952	1012959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_012029	GC	4	8	1012992	1012999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_012029	CCG	2	6	1013020	1013025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_012029	CGA	2	6	1013026	1013031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_012029	GGC	2	6	1014121	1014126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_012029	T	6	6	1014202	1014207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_012029	CCG	2	6	1014211	1014216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_012029	ACCG	2	8	1014219	1014226	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_012029	TCC	2	6	1015069	1015074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_012029	GAT	2	6	1015105	1015110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_012029	CAA	2	6	1015146	1015151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_012029	GT	3	6	1015166	1015171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_012029	ACT	2	6	1015174	1015179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_012029	TGT	2	6	1015195	1015200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_012029	TCT	2	6	1015263	1015268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_012029	TC	3	6	1015715	1015720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_012029	TAT	2	6	1015773	1015778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_012029	AGC	2	6	1015791	1015796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_012029	TGAAT	2	10	1015806	1015815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_012029	TCTGGA	2	12	1015840	1015851	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3023	NC_012029	AGC	2	6	1017150	1017155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_012029	GCA	2	6	1017206	1017211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_012029	ATCCT	2	10	1017619	1017628	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3026	NC_012029	TGAC	2	8	1017658	1017665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_012029	GA	3	6	1017730	1017735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_012029	CACTA	2	10	1017776	1017785	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3029	NC_012029	CCAC	2	8	1017872	1017879	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3030	NC_012029	AATGA	2	10	1017885	1017894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_012029	CGG	2	6	1018173	1018178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_012029	GTTC	2	8	1018197	1018204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_012029	GCCG	2	8	1018316	1018323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_012029	GTGA	2	8	1018345	1018352	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_012029	GCG	2	6	1018365	1018370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_012029	CCGA	2	8	1018372	1018379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_012029	GCCG	2	8	1018389	1018396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_012029	TCGC	2	8	1018413	1018420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_012029	CGCT	2	8	1018423	1018430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_012029	CT	3	6	1018429	1018434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_012029	TC	3	6	1018456	1018461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_012029	TTCG	2	8	1018464	1018471	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_012029	GCCG	2	8	1018480	1018487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_012029	ACC	2	6	1018537	1018542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_012029	GC	3	6	1018544	1018549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_012029	CGA	2	6	1018618	1018623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_012029	TCG	2	6	1018633	1018638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_012029	CGA	3	9	1018640	1018648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_012029	CCAAC	2	10	1018752	1018761	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3050	NC_012029	GAC	2	6	1018777	1018782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_012029	GTC	2	6	1022117	1022122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_012029	GTG	2	6	1026733	1026738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_012029	CGA	2	6	1026766	1026771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_012029	CAG	2	6	1026780	1026785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_012029	GAC	2	6	1026811	1026816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_012029	GAC	2	6	1027322	1027327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_012029	GCA	2	6	1027381	1027386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_012029	TACA	2	8	1028486	1028493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_012029	ATTTC	2	10	1028538	1028547	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3060	NC_012029	CGG	2	6	1028591	1028596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_012029	TG	3	6	1028640	1028645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_012029	GTT	2	6	1028648	1028653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_012029	GGC	2	6	1028654	1028659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_012029	CGC	2	6	1028729	1028734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_012029	ATT	2	6	1028772	1028777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_012029	TA	3	6	1028778	1028783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_012029	CGC	2	6	1028790	1028795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_012029	GTC	2	6	1028838	1028843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_012029	AACG	2	8	1028844	1028851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_012029	CGA	2	6	1028890	1028895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_012029	T	6	6	1030537	1030542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_012029	CGT	2	6	1030592	1030597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_012029	GCC	2	6	1032921	1032926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_012029	T	6	6	1032939	1032944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_012029	CCG	2	6	1032948	1032953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_012029	CGA	2	6	1033780	1033785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_012029	T	6	6	1034091	1034096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_012029	CGA	2	6	1035670	1035675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_012029	CG	3	6	1036054	1036059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_012029	GTC	2	6	1036093	1036098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_012029	GCC	2	6	1036113	1036118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_012029	CG	4	8	1037520	1037527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_012029	CGAA	2	8	1037616	1037623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_012029	GC	3	6	1037640	1037645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_012029	AT	3	6	1037707	1037712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_012029	CTC	2	6	1037713	1037718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_012029	ACC	2	6	1037749	1037754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_012029	CAA	2	6	1037765	1037770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_012029	ACC	2	6	1037799	1037804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_012029	AC	3	6	1039621	1039626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_012029	CGT	2	6	1039650	1039655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_012029	TGT	2	6	1039662	1039667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_012029	GCG	2	6	1041136	1041141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_012029	TCGC	2	8	1041174	1041181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3095	NC_012029	CAAC	2	8	1041273	1041280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_012029	TTC	2	6	1042973	1042978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_012029	TGAC	2	8	1043014	1043021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3098	NC_012029	CCA	2	6	1043037	1043042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_012029	TCG	2	6	1043057	1043062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_012029	TGT	2	6	1043096	1043101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_012029	CAT	2	6	1043155	1043160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_012029	ATT	2	6	1043186	1043191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_012029	ATA	2	6	1043336	1043341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_012029	GGT	2	6	1043398	1043403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_012029	GGT	2	6	1043418	1043423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_012029	GGT	2	6	1043438	1043443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_012029	TGC	2	6	1043476	1043481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_012029	AG	3	6	1043494	1043499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_012029	AG	3	6	1043533	1043538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_012029	A	6	6	1045238	1045243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_012029	CCCG	2	8	1045253	1045260	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3112	NC_012029	GAG	2	6	1045348	1045353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_012029	TGG	2	6	1045401	1045406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_012029	CCG	2	6	1046637	1046642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_012029	CT	3	6	1047669	1047674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_012029	CGAG	2	8	1047726	1047733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_012029	TTA	2	6	1050479	1050484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_012029	AGCC	2	8	1050498	1050505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_012029	CGA	2	6	1052232	1052237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_012029	TGA	2	6	1052282	1052287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_012029	TAG	2	6	1052409	1052414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_012029	AT	3	6	1052415	1052420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_012029	AT	3	6	1052426	1052431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_012029	ATCGA	2	10	1052501	1052510	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3125	NC_012029	ATCG	2	8	1052536	1052543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_012029	GCC	2	6	1052589	1052594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_012029	CGACGT	2	12	1054748	1054759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_012029	GTC	2	6	1054761	1054766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_012029	CAG	2	6	1055851	1055856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_012029	CGT	2	6	1055858	1055863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_012029	GCG	2	6	1057081	1057086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_012029	TGTCG	2	10	1057136	1057145	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3133	NC_012029	CAG	2	6	1057492	1057497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_012029	AGCA	2	8	1057534	1057541	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3135	NC_012029	TCA	2	6	1057616	1057621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_012029	CA	3	6	1057620	1057625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3137	NC_012029	CT	3	6	1057647	1057652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3139	NC_012029	GGC	2	6	1058666	1058671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3141	NC_012029	AGCG	2	8	1061870	1061877	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3142	NC_012029	CGTT	2	8	1062863	1062870	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3146	NC_012029	GT	4	8	1062941	1062948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3153	NC_012029	AAT	2	6	1063589	1063594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3162	NC_012029	GTG	2	6	1072189	1072194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3175	NC_012029	CGA	2	6	1076938	1076943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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