MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 8508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012029	CG	3	6	854356	854361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2502	NC_012029	TGC	2	6	854365	854370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_012029	GC	3	6	854369	854374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2504	NC_012029	TGCT	2	8	854406	854413	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2505	NC_012029	CCCGC	4	20	854450	854469	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2506	NC_012029	GA	3	6	854527	854532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_012029	GCT	2	6	854586	854591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_012029	CACCG	2	10	854623	854632	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2509	NC_012029	GTG	2	6	856745	856750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_012029	TGC	2	6	856765	856770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_012029	TTG	2	6	856784	856789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_012029	ACC	2	6	857209	857214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_012029	AGT	2	6	857260	857265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_012029	TTA	2	6	858263	858268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_012029	CGG	2	6	858279	858284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_012029	ACG	2	6	858299	858304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_012029	CGT	2	6	858318	858323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_012029	GGT	2	6	858797	858802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_012029	GGC	2	6	858817	858822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_012029	CGC	2	6	858826	858831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_012029	CGC	2	6	861954	861959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2522	NC_012029	GTG	3	9	865594	865602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_012029	GGT	2	6	865606	865611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_012029	TCGG	2	8	865632	865639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2525	NC_012029	GTG	2	6	865716	865721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_012029	GCG	2	6	865769	865774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_012029	GTC	2	6	865775	865780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_012029	GTG	2	6	865787	865792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_012029	CCA	2	6	865811	865816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_012029	CGG	2	6	865873	865878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_012029	CGG	2	6	865916	865921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_012029	CGG	2	6	865927	865932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_012029	GAA	2	6	867130	867135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_012029	CCG	2	6	867142	867147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2535	NC_012029	CGA	2	6	867155	867160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_012029	TGTC	2	8	867172	867179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2537	NC_012029	AGC	2	6	867261	867266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_012029	TA	3	6	867308	867313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_012029	AC	4	8	867320	867327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_012029	CGTT	2	8	867380	867387	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2541	NC_012029	CGTTC	2	10	867389	867398	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2542	NC_012029	GC	3	6	867406	867411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2543	NC_012029	CGA	2	6	868994	868999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_012029	CCGG	2	8	869002	869009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2545	NC_012029	CGG	2	6	869030	869035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_012029	GGA	2	6	869061	869066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_012029	GAG	2	6	871725	871730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_012029	CGA	2	6	871741	871746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_012029	CGA	3	9	872933	872941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_012029	CTA	2	6	872964	872969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_012029	TTG	2	6	872976	872981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_012029	CGA	2	6	875522	875527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_012029	CGG	2	6	875540	875545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_012029	GCT	2	6	875549	875554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_012029	CGA	2	6	875581	875586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_012029	CGG	2	6	875634	875639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_012029	TTCG	2	8	875794	875801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2558	NC_012029	CGT	2	6	875817	875822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_012029	TGGG	2	8	876255	876262	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_012029	CGC	2	6	876332	876337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2561	NC_012029	CTC	2	6	876345	876350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_012029	ACCCA	2	10	877916	877925	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2563	NC_012029	CCG	2	6	878529	878534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2564	NC_012029	GC	3	6	878546	878551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2565	NC_012029	ACG	2	6	881750	881755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_012029	CCG	2	6	881789	881794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2567	NC_012029	CCAC	2	8	881873	881880	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2568	NC_012029	CGA	2	6	882460	882465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_012029	A	6	6	882923	882928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_012029	GAC	2	6	882959	882964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_012029	GCA	2	6	882970	882975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_012029	CGC	2	6	885995	886000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2573	NC_012029	GTT	2	6	886829	886834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_012029	CGG	2	6	887258	887263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_012029	AAT	2	6	887776	887781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_012029	TA	3	6	887797	887802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_012029	CAT	2	6	887818	887823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2579	NC_012029	GGGCCG	2	12	888297	888308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2582	NC_012029	CGT	2	6	889587	889592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2584	NC_012029	AT	3	6	889680	889685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_012029	CGC	2	6	889748	889753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2587	NC_012029	GA	3	6	890786	890791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_012029	GA	3	6	891444	891449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_012029	GTG	2	6	891454	891459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_012029	ACGG	2	8	891510	891517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2591	NC_012029	TCG	3	9	891550	891558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_012029	TATT	2	8	892755	892762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_012029	CGG	2	6	892791	892796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_012029	TCGC	2	8	892837	892844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2595	NC_012029	CCG	2	6	892872	892877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2596	NC_012029	ACG	2	6	894479	894484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2598	NC_012029	GAG	2	6	894523	894528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_012029	GC	3	6	894543	894548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2600	NC_012029	CCT	2	6	894598	894603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2601	NC_012029	CGGCG	2	10	894673	894682	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2602	NC_012029	GCGCC	2	10	894690	894699	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2603	NC_012029	CTC	2	6	894716	894721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_012029	GC	4	8	894745	894752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2605	NC_012029	TCG	4	12	894786	894797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_012029	ACC	2	6	894798	894803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_012029	CGC	2	6	894817	894822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2608	NC_012029	GTC	2	6	895789	895794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_012029	CGT	2	6	895809	895814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_012029	GGT	2	6	895829	895834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_012029	GAGT	2	8	895840	895847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_012029	CGG	2	6	896139	896144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_012029	CTT	2	6	896147	896152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_012029	CTC	2	6	896155	896160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_012029	CGG	2	6	897172	897177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_012029	GGA	2	6	897184	897189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_012029	ACCGAG	2	12	897227	897238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_012029	ACG	2	6	897274	897279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_012029	TAC	2	6	899269	899274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_012029	AC	3	6	900070	900075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2621	NC_012029	ACC	2	6	900100	900105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2622	NC_012029	ACC	2	6	901072	901077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2623	NC_012029	GCT	2	6	901143	901148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_012029	AAC	2	6	901180	901185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_012029	GCG	2	6	901196	901201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_012029	ATA	2	6	901302	901307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_012029	A	6	6	901483	901488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_012029	TTG	2	6	901512	901517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_012029	TAA	2	6	901519	901524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_012029	CTG	2	6	901686	901691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_012029	ATAA	2	8	901760	901767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_012029	GA	3	6	901790	901795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2634	NC_012029	AGTT	2	8	901809	901816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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