MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 8508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012029	ATC	2	6	2564533	2564538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_012029	ACCA	2	8	2564563	2564570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8003	NC_012029	CCG	2	6	2566870	2566875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_012029	AGCG	2	8	2566892	2566899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8005	NC_012029	CCGG	2	8	2568401	2568408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8006	NC_012029	GTG	2	6	2568427	2568432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_012029	GCG	2	6	2568442	2568447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_012029	GCC	2	6	2568459	2568464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_012029	GGA	2	6	2568474	2568479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_012029	TGA	2	6	2568500	2568505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_012029	GTG	2	6	2568559	2568564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_012029	CGG	2	6	2568604	2568609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_012029	GGGA	2	8	2568617	2568624	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_012029	GACG	2	8	2568629	2568636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8015	NC_012029	GGC	2	6	2568638	2568643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_012029	GGT	2	6	2569953	2569958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_012029	T	6	6	2570671	2570676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_012029	TA	3	6	2570693	2570698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_012029	ATCG	2	8	2570719	2570726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8020	NC_012029	GCG	2	6	2570732	2570737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_012029	CA	3	6	2570753	2570758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8022	NC_012029	AGA	2	6	2570773	2570778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_012029	ACA	2	6	2570784	2570789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_012029	ACAG	2	8	2570794	2570801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8025	NC_012029	TCA	2	6	2570822	2570827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_012029	CGA	2	6	2570879	2570884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_012029	AT	3	6	2570930	2570935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_012029	CTC	2	6	2570956	2570961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8029	NC_012029	CCGT	2	8	2573919	2573926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8030	NC_012029	CGG	2	6	2574212	2574217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_012029	CGC	2	6	2574251	2574256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8032	NC_012029	ACA	2	6	2574257	2574262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_012029	TCG	2	6	2574286	2574291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_012029	GCG	2	6	2574294	2574299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_012029	CTC	2	6	2574333	2574338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8036	NC_012029	GC	4	8	2574362	2574369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_012029	CGA	2	6	2574520	2574525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_012029	GAGGG	2	10	2574529	2574538	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_012029	TCC	2	6	2574580	2574585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_012029	C	6	6	2574584	2574589	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8041	NC_012029	CG	3	6	2574601	2574606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8042	NC_012029	GAGGG	2	10	2574625	2574634	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_012029	CCG	3	9	2574674	2574682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8044	NC_012029	TC	3	6	2575883	2575888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8045	NC_012029	GCA	2	6	2575889	2575894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_012029	G	6	6	2576856	2576861	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_012029	GACGC	2	10	2576893	2576902	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8048	NC_012029	CCCG	2	8	2577518	2577525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8049	NC_012029	GTC	2	6	2578379	2578384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_012029	CGG	2	6	2578801	2578806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_012029	ACG	2	6	2578821	2578826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_012029	CGC	2	6	2578847	2578852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8053	NC_012029	CTG	2	6	2578854	2578859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_012029	ACC	2	6	2578886	2578891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_012029	CGTC	2	8	2580100	2580107	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8056	NC_012029	ACTC	2	8	2580136	2580143	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8057	NC_012029	GAA	2	6	2580159	2580164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_012029	CCG	2	6	2580200	2580205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8059	NC_012029	CGA	2	6	2580209	2580214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_012029	CGA	3	9	2580221	2580229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_012029	CGT	2	6	2580231	2580236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_012029	GGT	2	6	2580252	2580257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_012029	CGA	2	6	2580275	2580280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_012029	CGC	2	6	2580302	2580307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8065	NC_012029	GAT	2	6	2580312	2580317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_012029	CTTCG	2	10	2580327	2580336	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8067	NC_012029	TC	3	6	2580386	2580391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8068	NC_012029	GTC	2	6	2580404	2580409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_012029	CGGC	2	8	2580411	2580418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8070	NC_012029	CCCG	2	8	2583509	2583516	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8071	NC_012029	GTCG	2	8	2583966	2583973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8072	NC_012029	CCG	2	6	2583998	2584003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8073	NC_012029	ACGG	2	8	2585278	2585285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8074	NC_012029	CGG	2	6	2588360	2588365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_012029	TCG	2	6	2590764	2590769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_012029	AGA	2	6	2590804	2590809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_012029	CG	3	6	2592071	2592076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8078	NC_012029	TCG	2	6	2592100	2592105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_012029	GCT	2	6	2592142	2592147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_012029	GGT	3	9	2593086	2593094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_012029	GCG	2	6	2593107	2593112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_012029	GTC	2	6	2593119	2593124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_012029	GAAGC	2	10	2593126	2593135	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8084	NC_012029	CGGT	2	8	2593163	2593170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_012029	GTC	2	6	2598322	2598327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_012029	ACC	2	6	2598525	2598530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8087	NC_012029	AATA	2	8	2598581	2598588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_012029	GAT	2	6	2598604	2598609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_012029	CCG	2	6	2598624	2598629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8090	NC_012029	GT	3	6	2598661	2598666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_012029	CGG	2	6	2598680	2598685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_012029	CGT	2	6	2598686	2598691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_012029	CGG	2	6	2598692	2598697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_012029	CGGTCG	2	12	2598722	2598733	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_012029	GTC	2	6	2598742	2598747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_012029	CGGT	2	8	2598754	2598761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8097	NC_012029	GCC	2	6	2598774	2598779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8098	NC_012029	TCG	2	6	2601569	2601574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_012029	GGC	2	6	2601599	2601604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_012029	CGA	2	6	2601614	2601619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_012029	CGA	2	6	2601657	2601662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_012029	GGA	2	6	2601664	2601669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_012029	GTC	2	6	2601693	2601698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_012029	GCGCC	2	10	2601699	2601708	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8105	NC_012029	CGG	2	6	2601721	2601726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8108	NC_012029	CG	3	6	2601793	2601798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8109	NC_012029	CCG	2	6	2601846	2601851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8110	NC_012029	AG	3	6	2601908	2601913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_012029	GTAC	2	8	2602351	2602358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8112	NC_012029	GTTC	2	8	2602432	2602439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8113	NC_012029	AACG	2	8	2602455	2602462	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8114	NC_012029	GCT	2	6	2602470	2602475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8116	NC_012029	GCCA	2	8	2603932	2603939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8117	NC_012029	TGT	2	6	2603960	2603965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_012029	TCC	2	6	2603971	2603976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8119	NC_012029	ATCG	2	8	2604034	2604041	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8120	NC_012029	GTT	2	6	2605426	2605431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_012029	CG	3	6	2605471	2605476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8122	NC_012029	GTCCGC	2	12	2605545	2605556	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_012029	CGC	2	6	2605576	2605581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8124	NC_012029	CGT	2	6	2605598	2605603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_012029	GATT	2	8	2607433	2607440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_012029	TA	3	6	2607477	2607482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_012029	AT	3	6	2607488	2607493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_012029	GCC	2	6	2607621	2607626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8129	NC_012029	CGA	2	6	2607628	2607633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8131	NC_012029	AC	3	6	2607644	2607649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8134	NC_012029	TCG	2	6	2607729	2607734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8250	NC_012029	TCGCT	2	10	2647128	2647137	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8251	NC_012029	GACC	2	8	2647139	2647146	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8252	NC_012029	CGA	2	6	2647147	2647152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8254	NC_012029	CGA	2	6	2647180	2647185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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