MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 8508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_012029	CG	3	6	2374239	2374244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7502	NC_012029	TCG	2	6	2375061	2375066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_012029	GCGA	2	8	2375092	2375099	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7504	NC_012029	CTC	2	6	2375121	2375126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7505	NC_012029	TCG	2	6	2375205	2375210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_012029	CCGC	2	8	2376106	2376113	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7507	NC_012029	GAC	2	6	2376114	2376119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7508	NC_012029	CGA	2	6	2376129	2376134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7509	NC_012029	C	6	6	2376156	2376161	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7510	NC_012029	CGC	2	6	2376177	2376182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7511	NC_012029	GATC	2	8	2379552	2379559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7512	NC_012029	ACG	2	6	2379584	2379589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_012029	GTA	2	6	2379679	2379684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_012029	TAC	2	6	2380127	2380132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_012029	TCGCCT	2	12	2380147	2380158	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7516	NC_012029	TCG	2	6	2380163	2380168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_012029	GCC	2	6	2380178	2380183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7518	NC_012029	CAA	2	6	2380193	2380198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7519	NC_012029	GCTC	2	8	2380223	2380230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7520	NC_012029	GC	3	6	2380264	2380269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7521	NC_012029	ACC	2	6	2381218	2381223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7522	NC_012029	GAC	2	6	2384993	2384998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7523	NC_012029	AG	3	6	2384999	2385004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_012029	GGA	2	6	2385006	2385011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_012029	TCG	2	6	2385244	2385249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_012029	ATC	2	6	2385260	2385265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7527	NC_012029	CGGT	2	8	2385271	2385278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7528	NC_012029	GTT	2	6	2385280	2385285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_012029	CGGT	2	8	2385288	2385295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7530	NC_012029	GTT	2	6	2385297	2385302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_012029	CGT	2	6	2385650	2385655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_012029	GCC	2	6	2385662	2385667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7533	NC_012029	TCA	2	6	2385674	2385679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_012029	CGG	2	6	2387807	2387812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_012029	CCG	2	6	2388444	2388449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7536	NC_012029	GTTG	2	8	2389229	2389236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_012029	CCT	2	6	2390956	2390961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7538	NC_012029	AGT	2	6	2390967	2390972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_012029	GGC	2	6	2391041	2391046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_012029	GTG	2	6	2391068	2391073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_012029	CGC	2	6	2391084	2391089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7542	NC_012029	ACG	2	6	2391643	2391648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_012029	CTC	2	6	2392284	2392289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7544	NC_012029	CGAC	2	8	2393804	2393811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7545	NC_012029	TC	3	6	2397603	2397608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7546	NC_012029	CGG	2	6	2397639	2397644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_012029	CGA	2	6	2398711	2398716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7548	NC_012029	CGG	3	9	2398808	2398816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_012029	GGT	2	6	2400182	2400187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_012029	GA	3	6	2400192	2400197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_012029	CCT	2	6	2400522	2400527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7552	NC_012029	CGGC	2	8	2403304	2403311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7553	NC_012029	AT	3	6	2403317	2403322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_012029	T	6	6	2406169	2406174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_012029	TA	4	8	2406214	2406221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_012029	CGT	2	6	2406507	2406512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_012029	CGT	2	6	2406519	2406524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7558	NC_012029	CGA	2	6	2406534	2406539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_012029	CCG	2	6	2406545	2406550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7560	NC_012029	ACC	2	6	2406605	2406610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7561	NC_012029	CGC	2	6	2408720	2408725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7562	NC_012029	CCG	2	6	2408780	2408785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7563	NC_012029	ACC	2	6	2408793	2408798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7564	NC_012029	CCG	2	6	2409846	2409851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7565	NC_012029	GT	3	6	2410748	2410753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_012029	AAC	2	6	2410774	2410779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_012029	CAC	2	6	2410796	2410801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7568	NC_012029	CAC	2	6	2410851	2410856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7569	NC_012029	TG	3	6	2410867	2410872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_012029	TTCC	2	8	2410902	2410909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7571	NC_012029	CG	3	6	2412174	2412179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7572	NC_012029	CCA	2	6	2412180	2412185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7573	NC_012029	CGG	3	9	2413209	2413217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7574	NC_012029	ACG	2	6	2413249	2413254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_012029	AGCG	2	8	2414607	2414614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7576	NC_012029	CGGA	2	8	2414620	2414627	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7577	NC_012029	TCA	2	6	2414632	2414637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7578	NC_012029	TCG	2	6	2414643	2414648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7579	NC_012029	AATA	2	8	2414668	2414675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_012029	AG	3	6	2414676	2414681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_012029	CGA	2	6	2414683	2414688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7582	NC_012029	GAAC	2	8	2414714	2414721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7583	NC_012029	TCGA	2	8	2429182	2429189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7584	NC_012029	GA	3	6	2429188	2429193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_012029	CGGGA	2	10	2429209	2429218	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7586	NC_012029	GATCG	2	10	2429248	2429257	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7587	NC_012029	GGGA	2	8	2430497	2430504	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_012029	CCA	2	6	2430581	2430586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7589	NC_012029	CGA	2	6	2430587	2430592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7590	NC_012029	CGT	2	6	2430594	2430599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7591	NC_012029	GCAC	2	8	2430644	2430651	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7592	NC_012029	GTAGT	2	10	2430654	2430663	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_012029	CGAA	2	8	2430724	2430731	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7594	NC_012029	CG	3	6	2430771	2430776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7595	NC_012029	GAGC	2	8	2430790	2430797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7596	NC_012029	GACT	2	8	2430838	2430845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7597	NC_012029	ACTTC	2	10	2430862	2430871	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7598	NC_012029	TTCG	2	8	2430986	2430993	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7599	NC_012029	ACG	2	6	2431006	2431011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7600	NC_012029	ACCC	2	8	2431579	2431586	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7601	NC_012029	TCG	2	6	2431594	2431599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_012029	AG	3	6	2431612	2431617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_012029	GGC	2	6	2431618	2431623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7604	NC_012029	CGG	2	6	2434142	2434147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7605	NC_012029	CAG	2	6	2434179	2434184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7606	NC_012029	AAT	2	6	2435012	2435017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_012029	GA	3	6	2435031	2435036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_012029	GA	3	6	2435059	2435064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_012029	GTT	2	6	2435110	2435115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_012029	GAGCT	2	10	2435208	2435217	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7611	NC_012029	TCC	2	6	2435478	2435483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7612	NC_012029	CCG	2	6	2435496	2435501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7613	NC_012029	ACGG	2	8	2435600	2435607	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7614	NC_012029	A	6	6	2438344	2438349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_012029	TAC	2	6	2438443	2438448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7616	NC_012029	ACC	2	6	2438514	2438519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7617	NC_012029	CAC	2	6	2440091	2440096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7618	NC_012029	GAC	2	6	2440133	2440138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7619	NC_012029	CCGT	2	8	2440151	2440158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7620	NC_012029	GAGC	2	8	2440494	2440501	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7621	NC_012029	CGG	2	6	2440551	2440556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7622	NC_012029	CGG	2	6	2440605	2440610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7623	NC_012029	GCG	2	6	2440621	2440626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7624	NC_012029	CCGC	2	8	2440627	2440634	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7625	NC_012029	CGC	2	6	2440642	2440647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7626	NC_012029	GCC	2	6	2440669	2440674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7627	NC_012029	GGC	2	6	2440678	2440683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7628	NC_012029	GC	3	6	2440693	2440698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7629	NC_012029	GCT	2	6	2440745	2440750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7631	NC_012029	CGG	2	6	2442118	2442123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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