MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 8508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012029	GTA	2	6	2073259	2073264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_012029	CTG	2	6	2073267	2073272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_012029	CGGT	2	8	2073297	2073304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6504	NC_012029	CG	3	6	2073321	2073326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6505	NC_012029	ACG	2	6	2073347	2073352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_012029	CGAC	2	8	2073357	2073364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6507	NC_012029	GTCG	2	8	2073370	2073377	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6508	NC_012029	CG	3	6	2073380	2073385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6509	NC_012029	CGA	2	6	2073391	2073396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_012029	GCG	2	6	2073431	2073436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_012029	CGACG	2	10	2073442	2073451	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6512	NC_012029	CGA	2	6	2073549	2073554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_012029	CGGT	2	8	2073650	2073657	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6514	NC_012029	GACCC	2	10	2074131	2074140	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6515	NC_012029	CGA	2	6	2074148	2074153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_012029	GCC	2	6	2074196	2074201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6517	NC_012029	GAG	2	6	2074261	2074266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_012029	CGT	2	6	2074323	2074328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_012029	AGC	2	6	2074330	2074335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_012029	GGTG	2	8	2074472	2074479	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_012029	CGA	2	6	2074495	2074500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_012029	AAT	2	6	2075463	2075468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_012029	GTAGG	2	10	2075540	2075549	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_012029	ACGG	2	8	2077781	2077788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6525	NC_012029	ACGT	2	8	2077827	2077834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6526	NC_012029	ATT	2	6	2077860	2077865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_012029	ATA	2	6	2077870	2077875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_012029	AGTC	2	8	2078235	2078242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6529	NC_012029	GAGC	2	8	2078566	2078573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6530	NC_012029	CGG	2	6	2078591	2078596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_012029	CGA	2	6	2078732	2078737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_012029	AG	3	6	2078743	2078748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_012029	TCGGT	2	10	2078754	2078763	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6534	NC_012029	TC	3	6	2078764	2078769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6535	NC_012029	TGC	2	6	2078819	2078824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_012029	GGC	2	6	2078843	2078848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_012029	CG	3	6	2078852	2078857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6538	NC_012029	CCG	2	6	2078897	2078902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_012029	TCG	2	6	2078905	2078910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_012029	GTC	2	6	2078922	2078927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_012029	CGA	2	6	2078958	2078963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_012029	GAC	2	6	2078964	2078969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_012029	ACG	2	6	2078995	2079000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_012029	TCT	2	6	2079054	2079059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_012029	GTC	2	6	2079065	2079070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_012029	TGA	2	6	2079097	2079102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_012029	TAT	2	6	2079112	2079117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_012029	AT	3	6	2079116	2079121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_012029	TAT	2	6	2079126	2079131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_012029	GATA	2	8	2080904	2080911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_012029	TAA	2	6	2080916	2080921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_012029	CGA	2	6	2080941	2080946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_012029	ATCG	2	8	2081003	2081010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6554	NC_012029	AC	3	6	2081049	2081054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6555	NC_012029	GTATG	2	10	2081055	2081064	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_012029	TGCT	2	8	2082183	2082190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6557	NC_012029	GAGT	2	8	2083386	2083393	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_012029	CGG	2	6	2083410	2083415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_012029	CCG	3	9	2083420	2083428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6560	NC_012029	TCCG	2	8	2083450	2083457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6561	NC_012029	TC	3	6	2083462	2083467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6562	NC_012029	CGT	2	6	2083567	2083572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_012029	GAC	2	6	2083616	2083621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_012029	CCT	2	6	2083654	2083659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6565	NC_012029	TGGT	2	8	2083698	2083705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_012029	ACG	2	6	2083734	2083739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_012029	GAA	2	6	2083757	2083762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_012029	CCT	2	6	2083773	2083778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6569	NC_012029	GAG	2	6	2083781	2083786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_012029	CGG	2	6	2083789	2083794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_012029	CCAG	2	8	2083842	2083849	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6572	NC_012029	AGT	2	6	2083869	2083874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_012029	CGGT	2	8	2083888	2083895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6574	NC_012029	TTCCGT	2	12	2083905	2083916	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_012029	T	6	6	2083916	2083921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_012029	TTC	2	6	2083940	2083945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_012029	AG	3	6	2083998	2084003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_012029	AGGTG	2	10	2084017	2084026	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_012029	CAGC	2	8	2084055	2084062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6580	NC_012029	CAA	2	6	2084076	2084081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_012029	TCC	2	6	2084087	2084092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6582	NC_012029	ACG	2	6	2084102	2084107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_012029	GAA	2	6	2084119	2084124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_012029	GAC	2	6	2085236	2085241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_012029	CCG	2	6	2085254	2085259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6586	NC_012029	CGCTC	2	10	2085286	2085295	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6587	NC_012029	GTT	2	6	2085378	2085383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_012029	T	6	6	2085382	2085387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_012029	AGCG	2	8	2085398	2085405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6590	NC_012029	CGAA	2	8	2085412	2085419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6591	NC_012029	GT	3	6	2089708	2089713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_012029	CGG	2	6	2090676	2090681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_012029	AGT	2	6	2090726	2090731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_012029	TAT	2	6	2090757	2090762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_012029	CGAT	2	8	2092279	2092286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6596	NC_012029	C	6	6	2093803	2093808	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6597	NC_012029	T	6	6	2093819	2093824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_012029	AC	3	6	2093844	2093849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6599	NC_012029	GC	3	6	2094430	2094435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6600	NC_012029	GCC	2	6	2094455	2094460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6601	NC_012029	CGG	2	6	2094492	2094497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_012029	GGA	2	6	2095437	2095442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_012029	CGG	2	6	2097324	2097329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_012029	GTTA	2	8	2097338	2097345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_012029	ACG	2	6	2097383	2097388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_012029	GCG	2	6	2099589	2099594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_012029	ATC	2	6	2099626	2099631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_012029	GATC	2	8	2099651	2099658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6609	NC_012029	TCC	2	6	2099663	2099668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6610	NC_012029	TTA	2	6	2099765	2099770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_012029	TTG	2	6	2099773	2099778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_012029	AC	3	6	2099789	2099794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6613	NC_012029	CGAA	2	8	2100920	2100927	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6614	NC_012029	AATT	2	8	2101012	2101019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_012029	AAT	2	6	2101083	2101088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_012029	AC	3	6	2101107	2101112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6617	NC_012029	GCT	2	6	2101127	2101132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_012029	GT	3	6	2101148	2101153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_012029	GT	3	6	2101180	2101185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_012029	CCA	2	6	2101233	2101238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6621	NC_012029	CGC	2	6	2101265	2101270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6622	NC_012029	CGT	2	6	2102973	2102978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_012029	CCGG	2	8	2103001	2103008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6624	NC_012029	AAAT	2	8	2104296	2104303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_012029	GCC	2	6	2105503	2105508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6626	NC_012029	CGCA	2	8	2105533	2105540	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_012029	CGC	3	9	2105542	2105550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6628	NC_012029	CA	3	6	2105607	2105612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6629	NC_012029	CGT	2	6	2105797	2105802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6630	NC_012029	TCGT	2	8	2105805	2105812	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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