MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 8508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012029	GC	4	8	1884175	1884182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6002	NC_012029	ACG	2	6	1884188	1884193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_012029	CGA	3	9	1884677	1884685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_012029	CGAC	2	8	1884997	1885004	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_012029	GCC	2	6	1885426	1885431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_012029	CGC	2	6	1885457	1885462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_012029	CG	3	6	1885476	1885481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_012029	GCG	2	6	1885505	1885510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_012029	CTC	2	6	1885777	1885782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_012029	GCAC	2	8	1886138	1886145	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_012029	CGG	2	6	1886165	1886170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_012029	CGG	2	6	1887786	1887791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_012029	GGCGAG	2	12	1887796	1887807	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6014	NC_012029	TCG	2	6	1888795	1888800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_012029	CGA	2	6	1889441	1889446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_012029	CCG	2	6	1889474	1889479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_012029	CGA	2	6	1889487	1889492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_012029	GCCG	2	8	1890949	1890956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_012029	CCG	2	6	1890988	1890993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_012029	CGC	2	6	1891011	1891016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_012029	CCG	2	6	1891952	1891957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_012029	CTC	2	6	1891965	1891970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_012029	CGC	2	6	1891988	1891993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_012029	TCCG	2	8	1892011	1892018	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_012029	GGC	2	6	1892928	1892933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_012029	TAA	2	6	1893050	1893055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_012029	GGAG	2	8	1893106	1893113	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_012029	CCT	2	6	1894305	1894310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_012029	CCGCGA	2	12	1895010	1895021	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_012029	GA	4	8	1895041	1895048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_012029	GA	3	6	1896222	1896227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_012029	AAC	2	6	1896237	1896242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_012029	CTT	2	6	1896257	1896262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_012029	GA	3	6	1896280	1896285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_012029	GTC	2	6	1897991	1897996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_012029	TCGG	2	8	1898043	1898050	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6037	NC_012029	TCT	2	6	1898096	1898101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_012029	CGAC	2	8	1901426	1901433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_012029	TA	3	6	1901445	1901450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_012029	CCA	2	6	1901455	1901460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_012029	GGA	2	6	1901501	1901506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_012029	GTAG	2	8	1902163	1902170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_012029	GGT	2	6	1903493	1903498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_012029	GGT	2	6	1905816	1905821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_012029	GGC	2	6	1905849	1905854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_012029	GCC	2	6	1906447	1906452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_012029	GA	3	6	1906496	1906501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_012029	GA	3	6	1906511	1906516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_012029	GA	3	6	1906526	1906531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_012029	GACC	2	8	1906545	1906552	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_012029	GA	3	6	1906556	1906561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_012029	TA	3	6	1907844	1907849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_012029	CGA	2	6	1907893	1907898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_012029	GT	3	6	1907902	1907907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_012029	ACC	2	6	1910386	1910391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6056	NC_012029	CGG	2	6	1911047	1911052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_012029	CCGT	2	8	1911085	1911092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_012029	TAACC	2	10	1913712	1913721	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6059	NC_012029	GGT	2	6	1914811	1914816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_012029	GCG	2	6	1914872	1914877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_012029	CCG	2	6	1915547	1915552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_012029	GCG	2	6	1915570	1915575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_012029	CCG	2	6	1915577	1915582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_012029	CGAC	2	8	1915616	1915623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_012029	TTC	2	6	1916588	1916593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_012029	GA	4	8	1916623	1916630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_012029	AGT	2	6	1916645	1916650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_012029	GCG	2	6	1916664	1916669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_012029	AGCGGG	2	12	1916676	1916687	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6070	NC_012029	GTT	2	6	1916700	1916705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_012029	GTT	2	6	1916708	1916713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_012029	TCC	2	6	1916762	1916767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_012029	GCC	2	6	1916807	1916812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_012029	CCGCA	2	10	1916838	1916847	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6075	NC_012029	GC	4	8	1916993	1917000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_012029	CGC	2	6	1917026	1917031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_012029	CGA	2	6	1917064	1917069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_012029	CGC	2	6	1918496	1918501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_012029	GT	3	6	1918515	1918520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_012029	CGC	2	6	1918553	1918558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_012029	TC	3	6	1920238	1920243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_012029	CGA	2	6	1920262	1920267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_012029	ATCC	2	8	1921244	1921251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6084	NC_012029	ATCG	2	8	1921272	1921279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_012029	TCG	2	6	1922198	1922203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_012029	ACG	2	6	1922207	1922212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6090	NC_012029	CGG	2	6	1925263	1925268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_012029	GACGC	2	10	1925316	1925325	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6092	NC_012029	GACGC	2	10	1925334	1925343	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6093	NC_012029	GAT	2	6	1925347	1925352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6095	NC_012029	CT	3	6	1925390	1925395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_012029	CGG	2	6	1925399	1925404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_012029	CGT	2	6	1925409	1925414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_012029	GGT	2	6	1925448	1925453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_012029	GCG	2	6	1926257	1926262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_012029	ACG	2	6	1926288	1926293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_012029	CG	3	6	1926292	1926297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_012029	TAT	2	6	1926355	1926360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_012029	CCGT	2	8	1928640	1928647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_012029	GTCGT	2	10	1928658	1928667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6105	NC_012029	GTCC	2	8	1928692	1928699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_012029	ACCGG	2	10	1928705	1928714	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6107	NC_012029	TGTTCG	2	12	1928716	1928727	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6108	NC_012029	TCG	2	6	1928781	1928786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_012029	AGA	2	6	1929981	1929986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_012029	GA	3	6	1929985	1929990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_012029	CCG	2	6	1930343	1930348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_012029	AC	3	6	1930391	1930396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_012029	CA	3	6	1930397	1930402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_012029	TCGT	2	8	1930456	1930463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6115	NC_012029	CGG	2	6	1930499	1930504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6117	NC_012029	TC	3	6	1930583	1930588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_012029	TCGC	2	8	1930591	1930598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6119	NC_012029	TCCG	2	8	1930600	1930607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_012029	CCG	2	6	1931392	1931397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6121	NC_012029	GCGG	2	8	1931398	1931405	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6122	NC_012029	CGT	2	6	1931424	1931429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6125	NC_012029	CGG	2	6	1932475	1932480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_012029	GGCT	2	8	1932492	1932499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6127	NC_012029	CGA	2	6	1932516	1932521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6129	NC_012029	GTC	2	6	1934369	1934374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6131	NC_012029	ATCGA	2	10	1934432	1934441	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6263	NC_012029	ACA	2	6	1984295	1984300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6271	NC_012029	TCGT	2	8	1986610	1986617	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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