MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 8508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012029	GTG	2	6	1760552	1760557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_012029	TAT	2	6	1760561	1760566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_012029	GC	4	8	1762307	1762314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_012029	CGG	2	6	1762332	1762337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_012029	CG	3	6	1762353	1762358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_012029	CCCG	2	8	1762368	1762375	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5507	NC_012029	CCCG	2	8	1762444	1762451	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5508	NC_012029	CGC	2	6	1762453	1762458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_012029	CGCC	2	8	1762468	1762475	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5510	NC_012029	CGC	2	6	1762502	1762507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_012029	TC	3	6	1762564	1762569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_012029	ATC	2	6	1762571	1762576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_012029	ATAC	2	8	1762581	1762588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5514	NC_012029	TGT	2	6	1763960	1763965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_012029	TCG	2	6	1763989	1763994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_012029	CGA	2	6	1764037	1764042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_012029	CAA	2	6	1764146	1764151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_012029	CCG	2	6	1764158	1764163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_012029	AGT	2	6	1764665	1764670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_012029	CCTTC	2	10	1764711	1764720	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5521	NC_012029	A	6	6	1764782	1764787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_012029	ACG	3	9	1765246	1765254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_012029	AG	3	6	1765284	1765289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_012029	ACG	2	6	1765356	1765361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_012029	GAT	2	6	1765379	1765384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_012029	CCG	2	6	1765404	1765409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_012029	CTG	2	6	1765603	1765608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_012029	GAA	2	6	1765614	1765619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_012029	CGA	2	6	1765651	1765656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_012029	TGA	2	6	1765682	1765687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_012029	CT	3	6	1765699	1765704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_012029	CGA	2	6	1765786	1765791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_012029	GCC	2	6	1765794	1765799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5534	NC_012029	ATC	2	6	1765811	1765816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_012029	CCA	2	6	1765831	1765836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_012029	AG	3	6	1765838	1765843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_012029	GA	3	6	1765855	1765860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_012029	CAA	2	6	1765862	1765867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_012029	CGAT	2	8	1765891	1765898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5540	NC_012029	ACC	2	6	1765915	1765920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_012029	AAAC	2	8	1765934	1765941	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5542	NC_012029	ACC	2	6	1765951	1765956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_012029	CAGA	2	8	1765986	1765993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_012029	CAG	2	6	1768613	1768618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_012029	GGCT	2	8	1768625	1768632	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_012029	GAGG	2	8	1769335	1769342	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_012029	GAA	2	6	1770123	1770128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_012029	CAG	2	6	1770174	1770179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_012029	TCA	2	6	1770193	1770198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_012029	AGGT	2	8	1770243	1770250	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_012029	AATA	2	8	1770278	1770285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_012029	AGT	2	6	1771569	1771574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_012029	AACTT	2	10	1771589	1771598	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5554	NC_012029	TGG	2	6	1771633	1771638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_012029	ATC	2	6	1771643	1771648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_012029	TC	3	6	1771647	1771652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_012029	CAA	2	6	1771721	1771726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_012029	TGC	2	6	1771755	1771760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_012029	GCT	2	6	1771811	1771816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_012029	CGG	2	6	1772002	1772007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_012029	CTC	2	6	1772013	1772018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_012029	CTC	2	6	1772064	1772069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5563	NC_012029	CGCC	2	8	1772080	1772087	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5564	NC_012029	CCG	2	6	1772088	1772093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_012029	GGGC	2	8	1772095	1772102	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5566	NC_012029	GAC	2	6	1772103	1772108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_012029	ATG	2	6	1772158	1772163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_012029	ACG	2	6	1772173	1772178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_012029	CGT	3	9	1772187	1772195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_012029	ACGA	2	8	1772310	1772317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5571	NC_012029	CGCT	2	8	1772386	1772393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5572	NC_012029	GTC	2	6	1772413	1772418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_012029	CTT	2	6	1772463	1772468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_012029	GCG	2	6	1772505	1772510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_012029	GCAA	2	8	1772542	1772549	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5576	NC_012029	GATC	2	8	1772552	1772559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5577	NC_012029	GAC	2	6	1772667	1772672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_012029	GT	3	6	1772879	1772884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_012029	GTC	2	6	1772904	1772909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_012029	TTAG	2	8	1772990	1772997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_012029	TGCT	2	8	1773004	1773011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5582	NC_012029	GAGT	2	8	1774207	1774214	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_012029	CGG	2	6	1774231	1774236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5585	NC_012029	TCCG	2	8	1774271	1774278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5586	NC_012029	TC	3	6	1774283	1774288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5587	NC_012029	GAC	2	6	1774380	1774385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_012029	ATCCAG	2	12	1774518	1774529	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_012029	ATTCA	2	10	1774555	1774564	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5590	NC_012029	GCT	2	6	1774574	1774579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_012029	GGC	2	6	1774648	1774653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5593	NC_012029	ACC	3	9	1774786	1774794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5595	NC_012029	TCGA	2	8	1774870	1774877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5596	NC_012029	GTT	2	6	1774893	1774898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_012029	CGA	2	6	1774920	1774925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_012029	ACG	2	6	1774935	1774940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_012029	CGG	2	6	1775113	1775118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_012029	TCG	3	9	1775150	1775158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_012029	TC	3	6	1775166	1775171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_012029	GGC	2	6	1775177	1775182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5606	NC_012029	GA	3	6	1775384	1775389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_012029	ACGG	2	8	1775393	1775400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5608	NC_012029	GCTGTC	2	12	1775412	1775423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_012029	GGC	2	6	1775424	1775429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_012029	GCC	2	6	1775435	1775440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_012029	CACT	2	8	1775457	1775464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_012029	TCGG	2	8	1775477	1775484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5613	NC_012029	AGCA	2	8	1776661	1776668	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5614	NC_012029	CTAA	2	8	1776675	1776682	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5615	NC_012029	TTC	2	6	1776703	1776708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_012029	CG	3	6	1776715	1776720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5620	NC_012029	GCCG	2	8	1776970	1776977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5621	NC_012029	CA	3	6	1776981	1776986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_012029	CTCG	2	8	1777008	1777015	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5623	NC_012029	TCG	2	6	1777040	1777045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5625	NC_012029	TCG	2	6	1777112	1777117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5627	NC_012029	GTCGAG	2	12	1777180	1777191	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5628	NC_012029	CGC	2	6	1777227	1777232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5630	NC_012029	CGT	2	6	1777362	1777367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5758	NC_012029	CGCT	2	8	1818330	1818337	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5762	NC_012029	CGAC	2	8	1818485	1818492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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