MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 8508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012029	CCG	2	6	1482239	1482244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_012029	CGTC	2	8	1482269	1482276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_012029	CGA	2	6	1482868	1482873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_012029	ACG	2	6	1484156	1484161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_012029	CGGT	2	8	1484170	1484177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4506	NC_012029	CGG	2	6	1485706	1485711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_012029	CGACG	2	10	1485810	1485819	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4508	NC_012029	ACGTC	2	10	1485823	1485832	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4509	NC_012029	GGAC	2	8	1486234	1486241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4510	NC_012029	CGT	2	6	1486244	1486249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_012029	CT	3	6	1486270	1486275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_012029	TG	3	6	1488546	1488551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_012029	GCC	2	6	1488557	1488562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_012029	GA	3	6	1488563	1488568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_012029	GA	3	6	1490389	1490394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_012029	G	7	7	1491992	1491998	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_012029	TCCC	2	8	1492022	1492029	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4518	NC_012029	AC	3	6	1492236	1492241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_012029	GC	3	6	1494431	1494436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_012029	GCGG	2	8	1494464	1494471	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_012029	CGAC	2	8	1497436	1497443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_012029	TA	3	6	1497499	1497504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_012029	TA	3	6	1497588	1497593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_012029	CCCATT	2	12	1497594	1497605	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_012029	CGG	2	6	1497884	1497889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_012029	TCG	2	6	1497905	1497910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_012029	GCGT	2	8	1497972	1497979	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4528	NC_012029	CAA	2	6	1497988	1497993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_012029	CGA	2	6	1498366	1498371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_012029	GCT	2	6	1498402	1498407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_012029	TCA	2	6	1498411	1498416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_012029	TTG	2	6	1501345	1501350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_012029	TAG	2	6	1501357	1501362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_012029	CGTAC	2	10	1501451	1501460	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4535	NC_012029	GAG	2	6	1501505	1501510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_012029	CGGA	2	8	1501512	1501519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_012029	CGAC	2	8	1502212	1502219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_012029	GGA	2	6	1503243	1503248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_012029	CCG	2	6	1503266	1503271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4540	NC_012029	CGA	2	6	1503307	1503312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_012029	GAC	2	6	1503769	1503774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_012029	GTT	2	6	1505867	1505872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_012029	GAG	2	6	1507095	1507100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_012029	G	6	6	1507100	1507105	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_012029	GC	3	6	1507127	1507132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_012029	GAC	2	6	1508125	1508130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_012029	CT	3	6	1510553	1510558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_012029	ACGA	2	8	1515401	1515408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_012029	ACT	2	6	1515421	1515426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_012029	GCGA	2	8	1515457	1515464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_012029	CAA	2	6	1515487	1515492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_012029	CGAT	2	8	1517723	1517730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4553	NC_012029	CGA	2	6	1519551	1519556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_012029	CGG	2	6	1519559	1519564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_012029	TTG	2	6	1519659	1519664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_012029	GGC	2	6	1519682	1519687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_012029	GCCC	2	8	1519690	1519697	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4558	NC_012029	AATC	2	8	1519698	1519705	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_012029	CAA	2	6	1519772	1519777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_012029	GCC	2	6	1519835	1519840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_012029	CG	3	6	1521259	1521264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_012029	CCGTC	2	10	1521320	1521329	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4563	NC_012029	CGAC	2	8	1521356	1521363	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_012029	GCC	2	6	1521410	1521415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_012029	TCCG	2	8	1522343	1522350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_012029	CGA	2	6	1522376	1522381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_012029	ATCG	2	8	1523079	1523086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4568	NC_012029	ACTGT	2	10	1523099	1523108	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4569	NC_012029	GGC	2	6	1523211	1523216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_012029	CGA	2	6	1523231	1523236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_012029	TCGC	2	8	1523302	1523309	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_012029	GCTC	2	8	1523313	1523320	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_012029	TCG	2	6	1523346	1523351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_012029	ACCGC	2	10	1523382	1523391	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4575	NC_012029	CTC	2	6	1523404	1523409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_012029	TCG	2	6	1523417	1523422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_012029	GC	3	6	1523491	1523496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4578	NC_012029	TCG	2	6	1523521	1523526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_012029	CGC	2	6	1523557	1523562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_012029	GGC	2	6	1523644	1523649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_012029	CGAA	2	8	1523654	1523661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4582	NC_012029	GGC	2	6	1523674	1523679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_012029	TA	3	6	1523702	1523707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_012029	CT	3	6	1523719	1523724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4585	NC_012029	GTC	2	6	1525765	1525770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_012029	ATT	2	6	1525799	1525804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_012029	CGATA	2	10	1526612	1526621	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4588	NC_012029	TA	3	6	1526633	1526638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_012029	CTT	2	6	1527737	1527742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_012029	ACGT	2	8	1527781	1527788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4591	NC_012029	GGTC	2	8	1528003	1528010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_012029	TCG	2	6	1528018	1528023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_012029	CG	3	6	1528032	1528037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_012029	GCG	3	9	1528035	1528043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_012029	CGAT	2	8	1528123	1528130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4596	NC_012029	CGC	2	6	1528481	1528486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_012029	GA	3	6	1528569	1528574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_012029	AATC	2	8	1528611	1528618	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4599	NC_012029	CGT	2	6	1528636	1528641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_012029	TCGG	2	8	1530131	1530138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_012029	CG	3	6	1532303	1532308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_012029	CG	3	6	1532348	1532353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_012029	TTC	2	6	1533408	1533413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_012029	TCCC	2	8	1533422	1533429	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4605	NC_012029	GGC	2	6	1534555	1534560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_012029	GCC	2	6	1534623	1534628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_012029	CGC	2	6	1534634	1534639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_012029	CTC	2	6	1534642	1534647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_012029	AAC	2	6	1534661	1534666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_012029	AGC	2	6	1534687	1534692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_012029	GGT	2	6	1534706	1534711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_012029	AC	3	6	1534725	1534730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4613	NC_012029	GGC	2	6	1534743	1534748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_012029	TCA	2	6	1534784	1534789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_012029	CT	3	6	1534834	1534839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_012029	CCG	2	6	1534872	1534877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_012029	CT	3	6	1534878	1534883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4618	NC_012029	A	6	6	1534891	1534896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_012029	GGC	2	6	1534960	1534965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_012029	TGG	2	6	1535014	1535019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_012029	GCC	2	6	1535069	1535074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_012029	CT	3	6	1535105	1535110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_012029	GA	4	8	1535124	1535131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_012029	GGT	2	6	1535142	1535147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_012029	TCT	2	6	1535300	1535305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_012029	CTT	2	6	1535325	1535330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_012029	CA	3	6	1535404	1535409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_012029	ATAG	2	8	1535488	1535495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_012029	ACG	2	6	1535511	1535516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_012029	CCT	2	6	1535536	1535541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_012029	AAC	2	6	1535552	1535557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_012029	GAC	2	6	1535646	1535651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4635	NC_012029	CTC	2	6	1535886	1535891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4636	NC_012029	GTA	2	6	1535920	1535925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4759	NC_012029	TA	3	6	1566278	1566283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4760	NC_012029	TA	3	6	1566288	1566293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4761	NC_012029	AC	3	6	1566342	1566347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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