MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 2138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012028	AAT	2	6	493129	493134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_012028	AAT	2	6	493160	493165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_012028	ACC	3	9	497759	497767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2004	NC_012028	AC	3	6	497768	497773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2005	NC_012028	T	6	6	497846	497851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_012028	TTTA	2	8	497879	497886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_012028	GAAA	2	8	502763	502770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_012028	ATA	2	6	502805	502810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_012028	AACA	2	8	502851	502858	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2010	NC_012028	GTG	2	6	502938	502943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_012028	ACC	2	6	503047	503052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_012028	CGA	2	6	503078	503083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_012028	AGG	2	6	503104	503109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_012028	CGT	2	6	503144	503149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_012028	GAA	2	6	503182	503187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_012028	GAG	2	6	503252	503257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_012028	GAC	2	6	503284	503289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_012028	GAC	2	6	504752	504757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_012028	TA	3	6	504834	504839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_012028	AC	3	6	504967	504972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2021	NC_012028	CGC	2	6	504988	504993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2022	NC_012028	GTCT	2	8	506415	506422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2023	NC_012028	TGCG	2	8	506543	506550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2024	NC_012028	AAG	2	6	506657	506662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_012028	TCG	2	6	506708	506713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_012028	AGT	2	6	506746	506751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_012028	TCGG	2	8	506781	506788	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2028	NC_012028	GTC	2	6	506808	506813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2029	NC_012028	CGAC	2	8	506834	506841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2030	NC_012028	ACC	2	6	506852	506857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2031	NC_012028	GAC	2	6	506864	506869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_012028	ACCA	2	8	506895	506902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2033	NC_012028	ATC	2	6	506904	506909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_012028	CGA	2	6	506943	506948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_012028	GTA	2	6	507131	507136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_012028	CTTT	2	8	508469	508476	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2037	NC_012028	ATTCT	2	10	508479	508488	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2038	NC_012028	TTA	2	6	508526	508531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_012028	TGG	2	6	508563	508568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_012028	TGA	2	6	508569	508574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_012028	ATCT	2	8	508582	508589	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2042	NC_012028	TTCT	2	8	508605	508612	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2043	NC_012028	CTTT	2	8	508625	508632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2044	NC_012028	CA	3	6	508695	508700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2045	NC_012028	TC	3	6	508864	508869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2046	NC_012028	CAA	2	6	508922	508927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_012028	TTG	2	6	508947	508952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_012028	ACT	2	6	508975	508980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2049	NC_012028	CAGT	2	8	508996	509003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2050	NC_012028	TC	3	6	509042	509047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2051	NC_012028	CG	3	6	509143	509148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2052	NC_012028	AATG	2	8	509163	509170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_012028	GTG	2	6	509196	509201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_012028	AACACG	2	12	509430	509441	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_012028	TCA	3	9	509509	509517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_012028	CTC	2	6	509613	509618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2057	NC_012028	GTTC	2	8	509678	509685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2058	NC_012028	GA	3	6	509710	509715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_012028	TTCG	2	8	509806	509813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2060	NC_012028	CTG	2	6	509841	509846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2061	NC_012028	TCG	2	6	509847	509852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_012028	TCA	2	6	509863	509868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_012028	GTG	2	6	510033	510038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_012028	ATG	2	6	510141	510146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_012028	TCG	2	6	510169	510174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2066	NC_012028	CGC	2	6	510186	510191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2067	NC_012028	GCGAT	2	10	510194	510203	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2068	NC_012028	TTGA	2	8	510219	510226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_012028	GAT	2	6	510227	510232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_012028	CGT	2	6	510420	510425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2071	NC_012028	CCG	2	6	510453	510458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2072	NC_012028	CCG	2	6	510535	510540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2073	NC_012028	AGT	2	6	510553	510558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_012028	TG	3	6	511659	511664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_012028	TGC	2	6	511912	511917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2076	NC_012028	TCC	2	6	511927	511932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2077	NC_012028	TAAA	2	8	513291	513298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_012028	ATG	2	6	513307	513312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2079	NC_012028	TC	3	6	513450	513455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2080	NC_012028	GAT	2	6	513498	513503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2081	NC_012028	GACT	2	8	513509	513516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2082	NC_012028	GTT	2	6	513528	513533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2083	NC_012028	TCT	2	6	513668	513673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2084	NC_012028	GATT	2	8	513678	513685	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2085	NC_012028	CA	3	6	513686	513691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2086	NC_012028	CCCGG	2	10	513768	513777	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2087	NC_012028	GCT	3	9	513922	513930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2088	NC_012028	TCT	2	6	513965	513970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2089	NC_012028	CAG	2	6	514841	514846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2090	NC_012028	CTA	2	6	514874	514879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2091	NC_012028	GAAG	2	8	514984	514991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2092	NC_012028	GCA	2	6	515016	515021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2093	NC_012028	TGG	2	6	515022	515027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_012028	TGT	2	6	515079	515084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_012028	T	6	6	515095	515100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2096	NC_012028	TTA	2	6	515112	515117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_012028	TGC	2	6	515270	515275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2098	NC_012028	CAA	2	6	515312	515317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2099	NC_012028	GAA	2	6	515407	515412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_012028	CA	3	6	515457	515462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2101	NC_012028	TGT	2	6	515473	515478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_012028	TCG	2	6	515482	515487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2103	NC_012028	GCAC	2	8	517698	517705	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2104	NC_012028	AAT	2	6	517712	517717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_012028	TAC	2	6	519545	519550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2106	NC_012028	TA	3	6	519571	519576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_012028	GTTA	2	8	519622	519629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_012028	CGG	2	6	519641	519646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2109	NC_012028	CGA	2	6	519658	519663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2110	NC_012028	GTA	2	6	520817	520822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_012028	TCA	2	6	520849	520854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2112	NC_012028	TGC	2	6	520893	520898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2113	NC_012028	TTC	2	6	520926	520931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2114	NC_012028	GAA	2	6	521002	521007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_012028	ACG	2	6	521048	521053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_012028	CAGA	2	8	521061	521068	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2117	NC_012028	GAC	2	6	521139	521144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2118	NC_012028	TCG	2	6	521868	521873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_012028	CAG	2	6	521893	521898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2120	NC_012028	CA	3	6	521917	521922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2121	NC_012028	CGT	2	6	521970	521975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2122	NC_012028	AT	3	6	522013	522018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_012028	CAA	2	6	522035	522040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2124	NC_012028	ACA	2	6	522061	522066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2125	NC_012028	GTC	2	6	522067	522072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2126	NC_012028	CAGC	2	8	523284	523291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2127	NC_012028	GA	3	6	523351	523356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_012028	TGA	3	9	523360	523368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_012028	TTG	2	6	523404	523409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_012028	GATCA	2	10	523420	523429	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2131	NC_012028	GC	3	6	523473	523478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2132	NC_012028	ATG	2	6	525730	525735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_012028	CA	3	6	525750	525755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2134	NC_012028	TA	3	6	525821	525826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_012028	TAC	2	6	525859	525864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_012028	GAAG	2	8	525880	525887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2137	NC_012028	TTCAA	2	10	525895	525904	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2138	NC_012028	CAA	7	21	525914	525934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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