MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 2138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012028	CAA	2	6	110746	110751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_012028	CCA	2	6	110803	110808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_012028	TCG	2	6	110836	110841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_012028	ACTG	2	8	110882	110889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
505	NC_012028	GAC	2	6	110894	110899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_012028	ACG	2	6	110962	110967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_012028	GGT	2	6	113207	113212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012028	TTAG	2	8	114265	114272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012028	TGCT	2	8	114279	114286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_012028	GAGT	2	8	115482	115489	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012028	CGG	2	6	115506	115511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_012028	CCG	3	9	115516	115524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_012028	TCCG	2	8	115546	115553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
514	NC_012028	TC	3	6	115558	115563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_012028	TCC	2	6	115669	115674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_012028	GTC	2	6	115678	115683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_012028	CTT	2	6	115693	115698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_012028	ACG	2	6	115732	115737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_012028	ACT	2	6	115744	115749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_012028	TCC	2	6	115763	115768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_012028	GTAG	2	8	115780	115787	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012028	G	6	6	115787	115792	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012028	CCG	2	6	116068	116073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_012028	GCT	2	6	116190	116195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_012028	TCGTT	2	10	116250	116259	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
526	NC_012028	AGGA	2	8	116311	116318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012028	TCA	2	6	116339	116344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_012028	CAC	2	6	116439	116444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_012028	GCC	2	6	116466	116471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_012028	CTT	2	6	116541	116546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_012028	TCT	2	6	116549	116554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_012028	ATTGT	2	10	116578	116587	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012028	CGA	2	6	116637	116642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_012028	CCA	2	6	116654	116659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_012028	CGG	2	6	116816	116821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_012028	GCT	2	6	116828	116833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_012028	AAGCG	2	10	116932	116941	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
538	NC_012028	C	6	6	117123	117128	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
539	NC_012028	AGC	2	6	117195	117200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_012028	TGAAT	2	10	117210	117219	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012028	TCTGGA	2	12	117244	117255	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
542	NC_012028	AGC	2	6	118554	118559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_012028	GCA	2	6	118610	118615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_012028	CAAC	2	8	118693	118700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_012028	GAT	2	6	118703	118708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012028	ACC	2	6	118716	118721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_012028	GCA	2	6	118738	118743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_012028	CCG	2	6	118759	118764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_012028	GGC	2	6	118847	118852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_012028	AAGC	2	8	118885	118892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_012028	CCT	2	6	119019	119024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_012028	GAC	2	6	119045	119050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_012028	CAC	2	6	119071	119076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_012028	ACT	2	6	119116	119121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_012028	AGT	2	6	120778	120783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012028	GTTT	2	8	120804	120811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012028	GAA	2	6	120818	120823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012028	CGG	2	6	120830	120835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_012028	AATA	2	8	120853	120860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012028	ATT	2	6	120868	120873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012028	TA	3	6	120924	120929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012028	TA	3	6	121006	121011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012028	ATCG	2	8	122460	122467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_012028	CCG	2	6	126700	126705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_012028	CGG	2	6	127551	127556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_012028	AAATT	2	10	127561	127570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012028	GACG	2	8	127582	127589	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
568	NC_012028	CCG	2	6	129750	129755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_012028	TCG	2	6	129760	129765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_012028	CGT	2	6	129787	129792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_012028	A	6	6	129814	129819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012028	CCG	2	6	131890	131895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_012028	CGAT	2	8	131940	131947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
574	NC_012028	CGC	2	6	131981	131986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_012028	GAC	2	6	132973	132978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_012028	GGGCC	2	10	133040	133049	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
577	NC_012028	CAC	2	6	133080	133085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_012028	GAC	2	6	133094	133099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_012028	GTC	2	6	133124	133129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_012028	GCGTCG	2	12	133137	133148	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_012028	GTC	2	6	133154	133159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_012028	GTA	2	6	133191	133196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012028	CT	3	6	133197	133202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_012028	GAC	2	6	133238	133243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_012028	GGT	2	6	133357	133362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012028	GTC	2	6	133383	133388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_012028	CGGGG	2	10	133463	133472	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
588	NC_012028	GGA	2	6	135282	135287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012028	GGA	2	6	135308	135313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012028	GGGA	2	8	135338	135345	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012028	G	6	6	135445	135450	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012028	TG	3	6	135475	135480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012028	CGG	2	6	135486	135491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_012028	CAC	2	6	135507	135512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_012028	GC	3	6	135525	135530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
596	NC_012028	CAA	2	6	135589	135594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_012028	GCC	2	6	135601	135606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_012028	GGTC	2	8	135607	135614	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_012028	ACG	2	6	135646	135651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_012028	CGT	2	6	135679	135684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_012028	TTCG	2	8	135692	135699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_012028	CCGGAT	2	12	135703	135714	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_012028	TC	3	6	135737	135742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_012028	AC	3	6	135745	135750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_012028	TCCA	2	8	135773	135780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_012028	TCG	2	6	135825	135830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_012028	CCCGG	2	10	135862	135871	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
608	NC_012028	AG	3	6	137165	137170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012028	TC	3	6	138057	138062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_012028	GA	3	6	138469	138474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012028	CGA	2	6	138480	138485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_012028	ACCG	2	8	138486	138493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
613	NC_012028	GCTGTC	2	12	138497	138508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_012028	GGC	3	9	138509	138517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_012028	GCC	2	6	138519	138524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_012028	CTGG	2	8	138560	138567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
617	NC_012028	AGCA	2	8	139744	139751	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
618	NC_012028	CTAA	2	8	139758	139765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_012028	CG	3	6	139846	139851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_012028	AGCA	2	8	140047	140054	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
621	NC_012028	CG	3	6	140180	140185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_012028	CAG	2	6	140214	140219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_012028	CTA	2	6	140346	140351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_012028	TCA	2	6	140548	140553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_012028	TCA	2	6	140564	140569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_012028	GCC	2	6	140616	140621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_012028	AAAT	2	8	140634	140641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012028	TTCA	2	8	140643	140650	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_012028	CAT	2	6	140747	140752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_012028	ATA	2	6	140823	140828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_012028	CGG	2	6	141560	141565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_012028	CGGT	2	8	141589	141596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
633	NC_012028	GTC	2	6	141611	141616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_012028	CTT	2	6	141622	141627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_012028	T	6	6	141626	141631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_012028	GACC	2	8	141643	141650	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
637	NC_012028	CGC	2	6	141658	141663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_012028	CTCCG	2	10	141670	141679	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
639	NC_012028	GCTC	2	8	141681	141688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
640	NC_012028	GC	4	8	141751	141758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
641	NC_012028	GTTT	2	8	141801	141808	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
642	NC_012028	GCG	2	6	141823	141828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_012028	CGC	2	6	141836	141841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_012028	TCT	2	6	141930	141935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_012028	TCA	2	6	141966	141971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_012028	CAG	2	6	141977	141982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_012028	TGT	2	6	142002	142007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
648	NC_012028	CAG	2	6	142019	142024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_012028	ATG	2	6	142052	142057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
650	NC_012028	GAA	2	6	142113	142118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
651	NC_012028	GCG	2	6	142139	142144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_012028	CTG	2	6	142233	142238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_012028	GT	3	6	142242	142247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
654	NC_012028	CCT	2	6	142266	142271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
655	NC_012028	CA	3	6	142292	142297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
656	NC_012028	ACA	2	6	143307	143312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_012028	AT	3	6	145794	145799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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659	NC_012028	GCT	2	6	147127	147132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_012028	GTT	2	6	147571	147576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
662	NC_012028	TCA	2	6	148319	148324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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664	NC_012028	AGT	2	6	150142	150147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
665	NC_012028	CTG	2	6	150176	150181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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667	NC_012028	CT	3	6	150649	150654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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669	NC_012028	C	6	6	151374	151379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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672	NC_012028	GCT	2	6	151485	151490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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674	NC_012028	CCG	2	6	151960	151965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
675	NC_012028	GAG	2	6	151970	151975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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679	NC_012028	TCG	2	6	154392	154397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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682	NC_012028	CGG	2	6	154470	154475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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912	NC_012028	GACT	2	8	193501	193508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
913	NC_012028	TCG	2	6	193509	193514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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919	NC_012028	TGCT	2	8	193626	193633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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921	NC_012028	CGG	2	6	194853	194858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
922	NC_012028	CCG	3	9	194863	194871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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924	NC_012028	TC	3	6	194905	194910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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932	NC_012028	CGG	2	6	197713	197718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
933	NC_012028	GGA	2	6	197763	197768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
934	NC_012028	CT	3	6	197780	197785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
935	NC_012028	TCT	2	6	197792	197797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
936	NC_012028	TAC	2	6	197805	197810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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938	NC_012028	TCCG	2	8	199580	199587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
939	NC_012028	TCAG	2	8	199608	199615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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943	NC_012028	TCG	2	6	199965	199970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
944	NC_012028	TGA	2	6	200004	200009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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946	NC_012028	GGA	2	6	202824	202829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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962	NC_012028	CCG	2	6	204717	204722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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975	NC_012028	CGG	2	6	206671	206676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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981	NC_012028	GC	4	8	206849	206856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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