MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 10112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011852	CTG	2	6	954801	954806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_011852	A	6	6	954886	954891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_011852	ATT	2	6	955528	955533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_011852	T	6	6	956887	956892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011852	A	6	6	956903	956908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011852	AAAGAA	2	12	956977	956988	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_011852	A	7	7	957001	957007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_011852	TAT	2	6	957018	957023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_011852	TA	3	6	957755	957760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_011852	AAAT	2	8	957761	957768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_011852	A	6	6	957791	957796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011852	T	8	8	957800	957807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_011852	AATT	2	8	957820	957827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011852	A	6	6	957851	957856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_011852	TAA	2	6	957864	957869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_011852	CTA	2	6	957894	957899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_011852	A	6	6	959837	959842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011852	TTTGT	2	10	959878	959887	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_011852	AGG	2	6	959903	959908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_011852	TATT	2	8	959915	959922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_011852	T	6	6	959932	959937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_011852	ATT	2	6	959987	959992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_011852	ATT	2	6	960050	960055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_011852	T	6	6	960070	960075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_011852	TGA	2	6	960134	960139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_011852	ATC	2	6	960155	960160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_011852	GTC	2	6	960166	960171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4029	NC_011852	AGTA	2	8	963340	963347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011852	TTA	2	6	963362	963367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_011852	TTA	2	6	963382	963387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011852	T	6	6	963396	963401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_011852	ATCT	2	8	963411	963418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_011852	AG	3	6	963430	963435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_011852	CAT	2	6	963891	963896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_011852	AAAT	2	8	963910	963917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_011852	TTA	2	6	963918	963923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_011852	TTA	2	6	963952	963957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_011852	TGG	2	6	963959	963964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011852	ATTC	2	8	965003	965010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_011852	TCT	2	6	965115	965120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_011852	TTTTAT	2	12	966484	966495	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011852	TTG	2	6	966522	966527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011852	TATT	2	8	966530	966537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011852	AATC	2	8	966544	966551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4046	NC_011852	T	7	7	966561	966567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011852	TACA	2	8	966628	966635	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_011852	GAG	2	6	966664	966669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_011852	TA	3	6	967685	967690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_011852	CTA	2	6	967691	967696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_011852	AT	3	6	968577	968582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_011852	TAG	2	6	969556	969561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_011852	TGTT	2	8	969578	969585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011852	ATT	2	6	969675	969680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_011852	TGT	2	6	969681	969686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_011852	TAAGA	2	10	969699	969708	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_011852	AAAGT	2	10	969728	969737	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_011852	T	7	7	970609	970615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_011852	AT	3	6	970987	970992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_011852	TGT	2	6	971027	971032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_011852	AAT	2	6	971036	971041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011852	CAAA	2	8	971065	971072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_011852	TTC	2	6	971206	971211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_011852	AGC	2	6	971245	971250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_011852	AGC	2	6	971260	971265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_011852	TTC	2	6	971343	971348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_011852	TA	3	6	971369	971374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011852	ATT	2	6	971417	971422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_011852	TGA	2	6	971455	971460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_011852	GTT	2	6	971513	971518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_011852	AGT	2	6	971521	971526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_011852	TTA	3	9	971532	971540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_011852	TTGG	2	8	971544	971551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_011852	CAA	2	6	971667	971672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4077	NC_011852	AGT	2	6	971791	971796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4079	NC_011852	AT	3	6	971901	971906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_011852	AATGCA	2	12	971963	971974	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4088	NC_011852	TGT	2	6	972185	972190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_011852	TATTC	2	10	972236	972245	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4090	NC_011852	TTA	2	6	972272	972277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4092	NC_011852	GAA	2	6	972330	972335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4095	NC_011852	TA	3	6	972424	972429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_011852	ATA	2	6	972487	972492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_011852	GA	3	6	972542	972547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_011852	T	6	6	972656	972661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_011852	A	6	6	972664	972669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_011852	CACAC	2	10	972703	972712	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4103	NC_011852	TGT	2	6	972723	972728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_011852	AGT	2	6	972731	972736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_011852	CGT	2	6	972751	972756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_011852	T	6	6	972759	972764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_011852	TG	3	6	972791	972796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_011852	TTG	2	6	972802	972807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_011852	T	7	7	972882	972888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_011852	GGC	2	6	972959	972964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_011852	AGGA	2	8	972995	973002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_011852	GCTT	2	8	973004	973011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_011852	ACG	2	6	973075	973080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4117	NC_011852	G	6	6	973299	973304	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_011852	TGAA	2	8	973328	973335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_011852	TGA	2	6	973366	973371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_011852	ACATT	2	10	973394	973403	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4121	NC_011852	AGA	2	6	973416	973421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011852	CAG	2	6	973442	973447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_011852	AGGG	2	8	973586	973593	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011852	GGA	2	6	973633	973638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_011852	CGAAGG	2	12	973643	973654	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4126	NC_011852	GAA	2	6	973894	973899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_011852	AAG	2	6	973922	973927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_011852	TGC	2	6	973970	973975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_011852	GTC	2	6	973982	973987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_011852	TTG	2	6	974043	974048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_011852	TCGG	2	8	974057	974064	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_011852	GGA	2	6	974095	974100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_011852	TCA	2	6	974120	974125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_011852	AC	3	6	974146	974151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4135	NC_011852	CGA	2	6	974177	974182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4137	NC_011852	CCT	2	6	974455	974460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4409	NC_011852	A	7	7	1070304	1070310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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