MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 10112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011852	TA	3	6	819605	819610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_011852	T	6	6	819622	819627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_011852	CAA	2	6	819658	819663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_011852	A	7	7	819715	819721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_011852	TA	3	6	819722	819727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_011852	TCT	2	6	819731	819736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_011852	TAT	2	6	819737	819742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_011852	ATT	2	6	819782	819787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_011852	AGT	2	6	820434	820439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_011852	ATT	2	6	820465	820470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_011852	A	6	6	820491	820496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_011852	TTGAT	2	10	820497	820506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_011852	TA	3	6	820518	820523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_011852	AATT	2	8	820549	820556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_011852	TAA	2	6	820578	820583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_011852	A	6	6	820606	820611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_011852	A	6	6	820655	820660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3519	NC_011852	CTT	2	6	820700	820705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3523	NC_011852	ATT	2	6	820829	820834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_011852	TTA	2	6	820839	820844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_011852	TTATT	2	10	820890	820899	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_011852	TAT	2	6	820916	820921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3530	NC_011852	AC	3	6	821084	821089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_011852	AGTT	2	8	821169	821176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_011852	TTG	2	6	821196	821201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3542	NC_011852	A	6	6	821561	821566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_011852	TCAA	2	8	821589	821596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_011852	TTA	2	6	821609	821614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_011852	AATC	2	8	821624	821631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3552	NC_011852	A	7	7	821905	821911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3563	NC_011852	ATG	2	6	822586	822591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_011852	T	6	6	822602	822607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3569	NC_011852	TAA	2	6	826159	826164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_011852	AT	3	6	826228	826233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3603	NC_011852	T	6	6	829702	829707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_011852	ATA	2	6	829729	829734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_011852	TTTG	2	8	829777	829784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3608	NC_011852	CAAT	2	8	832116	832123	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3610	NC_011852	A	6	6	832134	832139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_011852	TGC	2	6	832183	832188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_011852	CCTG	2	8	832216	832223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_011852	AT	3	6	832297	832302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_011852	CTAT	2	8	832326	832333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_011852	GTA	2	6	832336	832341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3618	NC_011852	ATTT	2	8	834042	834049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_011852	ATTT	2	8	834135	834142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_011852	ATTT	2	8	834688	834695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3622	NC_011852	C	6	6	836886	836891	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3623	NC_011852	GAT	2	6	836922	836927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3629	NC_011852	GGTAAA	2	12	839461	839472	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3631	NC_011852	GAT	2	6	839598	839603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_011852	CGAA	2	8	839609	839616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3633	NC_011852	AGA	2	6	839667	839672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_011852	AGC	2	6	839690	839695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3635	NC_011852	AAT	2	6	839707	839712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_011852	TTGA	2	8	839812	839819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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