MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 10112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011852	CTG	2	6	700268	700273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_011852	CT	3	6	700394	700399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_011852	CTG	2	6	700457	700462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_011852	CAG	2	6	700493	700498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_011852	CAG	2	6	700565	700570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_011852	CTG	2	6	700592	700597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_011852	CTG	2	6	700682	700687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_011852	GTT	2	6	700845	700850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_011852	TTG	2	6	700928	700933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_011852	C	6	6	700939	700944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3011	NC_011852	TGGTTG	2	12	701106	701117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_011852	TGTT	2	8	701118	701125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_011852	GCC	2	6	701203	701208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_011852	TGA	2	6	701228	701233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_011852	TTA	2	6	701236	701241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_011852	AAC	2	6	701334	701339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_011852	CCAC	2	8	701413	701420	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3018	NC_011852	TAT	2	6	701432	701437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_011852	AGC	2	6	701457	701462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_011852	CAT	2	6	701465	701470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_011852	GTAC	2	8	701502	701509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_011852	CTTG	2	8	701557	701564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_011852	CAA	2	6	701615	701620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_011852	TGT	2	6	701634	701639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_011852	CAC	2	6	701675	701680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_011852	T	6	6	701710	701715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_011852	CAG	2	6	701717	701722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_011852	ACC	2	6	701730	701735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_011852	ACTT	2	8	701762	701769	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3030	NC_011852	C	6	6	701856	701861	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3031	NC_011852	GTT	2	6	701890	701895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_011852	GCG	2	6	701898	701903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_011852	ATT	2	6	701913	701918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_011852	ATT	2	6	701922	701927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_011852	ATC	2	6	701952	701957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_011852	CAATAG	2	12	702005	702016	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3037	NC_011852	ACA	2	6	702094	702099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_011852	CAG	2	6	702227	702232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_011852	CT	4	8	702289	702296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_011852	ACCAAT	2	12	702297	702308	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_011852	GAACTA	2	12	702337	702348	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3042	NC_011852	A	6	6	702381	702386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_011852	AATTTA	2	12	702418	702429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_011852	A	6	6	702445	702450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_011852	ACC	2	6	702529	702534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_011852	ATA	2	6	702580	702585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_011852	TAA	2	6	702606	702611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_011852	TTTA	2	8	702625	702632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_011852	A	19	19	702671	702689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_011852	AATAA	2	10	702711	702720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_011852	ATA	2	6	702757	702762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_011852	TAG	2	6	702808	702813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_011852	GAA	2	6	702873	702878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_011852	A	6	6	702898	702903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_011852	CAA	2	6	702904	702909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_011852	T	6	6	703001	703006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_011852	TAA	2	6	703023	703028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_011852	AAT	2	6	703037	703042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_011852	CTA	2	6	703061	703066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_011852	GTT	2	6	703106	703111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_011852	A	6	6	703737	703742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_011852	AAAAG	2	10	703747	703756	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_011852	ATT	2	6	703788	703793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_011852	AAG	2	6	705838	705843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_011852	T	7	7	705882	705888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_011852	AAT	2	6	705903	705908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_011852	TAT	3	9	705996	706004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_011852	ATGA	2	8	706021	706028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_011852	TTTA	2	8	706038	706045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_011852	AT	3	6	707071	707076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_011852	AT	3	6	707088	707093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_011852	AC	3	6	707105	707110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_011852	GT	3	6	707114	707119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_011852	AC	3	6	707156	707161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_011852	GT	3	6	707165	707170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_011852	CAT	2	6	707172	707177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3078	NC_011852	ACTGA	2	10	710547	710556	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3079	NC_011852	TAC	2	6	710570	710575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_011852	TG	3	6	710659	710664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_011852	GTC	2	6	711968	711973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_011852	CTA	2	6	711994	711999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_011852	GCC	2	6	712001	712006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_011852	TAA	2	6	712007	712012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_011852	AAT	2	6	712021	712026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_011852	A	7	7	714139	714145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_011852	TTG	2	6	714177	714182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_011852	A	8	8	714183	714190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_011852	AT	3	6	715823	715828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_011852	AG	3	6	715840	715845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_011852	ACC	2	6	715876	715881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_011852	A	6	6	715918	715923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_011852	AT	4	8	715930	715937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_011852	AAAT	2	8	717098	717105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_011852	T	7	7	717132	717138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_011852	TAC	2	6	717170	717175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_011852	TAC	2	6	717194	717199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_011852	AAT	2	6	718025	718030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_011852	ACA	2	6	719449	719454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_011852	TAT	2	6	719458	719463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_011852	TAA	2	6	719476	719481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_011852	TAT	2	6	719543	719548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_011852	TATTT	2	10	719563	719572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_011852	A	6	6	724094	724099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011852	A	6	6	724152	724157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_011852	TTA	2	6	724191	724196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_011852	CT	3	6	724239	724244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_011852	GAAA	2	8	724276	724283	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_011852	A	6	6	725772	725777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_011852	A	6	6	725803	725808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_011852	A	7	7	725822	725828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_011852	T	6	6	725829	725834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_011852	T	8	8	725866	725873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_011852	TC	3	6	725891	725896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_011852	AT	3	6	725923	725928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_011852	A	6	6	727586	727591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_011852	TAG	2	6	727689	727694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_011852	A	6	6	727697	727702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_011852	AAT	2	6	727720	727725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_011852	CTA	2	6	727747	727752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_011852	ATT	2	6	727758	727763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_011852	TACT	2	8	727772	727779	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3124	NC_011852	ATT	2	6	727791	727796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_011852	TA	3	6	727802	727807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_011852	TA	3	6	728649	728654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_011852	A	6	6	728654	728659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_011852	GCT	2	6	728687	728692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_011852	AT	3	6	728701	728706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_011852	GGGT	2	8	728727	728734	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_011852	CCA	2	6	728741	728746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_011852	TGG	2	6	728772	728777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_011852	ACCC	2	8	728784	728791	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3134	NC_011852	AAT	2	6	728808	728813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_011852	AAG	2	6	728846	728851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_011852	A	6	6	730231	730236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3138	NC_011852	ATA	2	6	730276	730281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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