MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 10112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_011852	CTG	2	6	484166	484171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_011852	CTG	2	6	484246	484251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_011852	ACC	2	6	484275	484280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2006	NC_011852	TTAA	2	8	484303	484310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_011852	CGTT	2	8	484340	484347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2009	NC_011852	GTT	2	6	484502	484507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_011852	T	6	6	484510	484515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_011852	TTTA	2	8	484617	484624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_011852	ATTTT	2	10	484654	484663	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_011852	TTTAA	2	10	484675	484684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_011852	TAT	2	6	484775	484780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_011852	ACC	2	6	484791	484796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2019	NC_011852	GTTT	2	8	485002	485009	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2023	NC_011852	ACC	2	6	485157	485162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2024	NC_011852	CTTG	2	8	485206	485213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2137	NC_011852	CAT	2	6	511437	511442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2138	NC_011852	ATC	2	6	511567	511572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2139	NC_011852	ACA	2	6	511615	511620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2140	NC_011852	CAA	2	6	511634	511639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2141	NC_011852	TCA	2	6	511763	511768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2142	NC_011852	GTT	2	6	511778	511783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2143	NC_011852	TCA	2	6	511784	511789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2144	NC_011852	ATC	3	9	511879	511887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2145	NC_011852	AG	3	6	512078	512083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2146	NC_011852	CAA	2	6	512166	512171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2147	NC_011852	TAA	2	6	512172	512177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2148	NC_011852	ACACC	2	10	512193	512202	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2149	NC_011852	TGG	2	6	512271	512276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2151	NC_011852	AATA	2	8	512345	512352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2152	NC_011852	GAA	2	6	512441	512446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2153	NC_011852	GTTTCA	2	12	512455	512466	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2155	NC_011852	CAT	2	6	512619	512624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2156	NC_011852	GTC	2	6	512674	512679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2157	NC_011852	GCC	2	6	512772	512777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2158	NC_011852	CAC	2	6	512828	512833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2160	NC_011852	GCTC	2	8	512863	512870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2161	NC_011852	ACG	2	6	512949	512954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2163	NC_011852	CAG	2	6	513062	513067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2165	NC_011852	TGT	2	6	513137	513142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2170	NC_011852	A	6	6	513381	513386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2171	NC_011852	ATT	2	6	513417	513422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2172	NC_011852	TATT	2	8	515588	515595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2185	NC_011852	CAA	2	6	524561	524566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2268	NC_011852	ACC	2	6	541796	541801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2269	NC_011852	TTC	2	6	541905	541910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2270	NC_011852	CAAG	2	8	541911	541918	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2271	NC_011852	TGCT	2	8	541984	541991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2272	NC_011852	GTTT	2	8	542010	542017	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2413	NC_011852	AAAC	2	8	562598	562605	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2414	NC_011852	ATC	2	6	562622	562627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2416	NC_011852	ATG	2	6	562715	562720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2451	NC_011852	CTG	2	6	565599	565604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2452	NC_011852	CCT	2	6	565614	565619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2453	NC_011852	GCC	2	6	565680	565685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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