MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 10112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011852	AC	3	6	365628	365633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_011852	GT	3	6	365637	365642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011852	AC	3	6	365664	365669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_011852	GT	3	6	365673	365678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_011852	CTT	2	6	365697	365702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_011852	AT	3	6	365737	365742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_011852	CAAAA	2	10	365750	365759	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1508	NC_011852	T	7	7	365788	365794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_011852	AT	3	6	367918	367923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_011852	TAGA	2	8	369319	369326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_011852	ATG	2	6	369368	369373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011852	A	6	6	371012	371017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011852	GAAA	2	8	371030	371037	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_011852	TGT	2	6	371048	371053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011852	TA	3	6	371058	371063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_011852	TAG	2	6	371082	371087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_011852	CAATAT	2	12	371107	371118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1518	NC_011852	AATATC	2	12	371129	371140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1519	NC_011852	AC	3	6	371147	371152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_011852	GT	3	6	371156	371161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_011852	TTTAA	2	10	371220	371229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011852	T	6	6	371238	371243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011852	AC	3	6	371252	371257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_011852	GT	3	6	371261	371266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_011852	TAT	2	6	371274	371279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_011852	AGACT	2	10	372800	372809	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1530	NC_011852	A	6	6	374764	374769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1534	NC_011852	AGA	2	6	379111	379116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011852	A	6	6	379181	379186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1539	NC_011852	GGTT	2	8	379587	379594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_011852	GGTT	2	8	379696	379703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1543	NC_011852	A	8	8	379852	379859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011852	A	6	6	383046	383051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011852	AAC	2	6	383054	383059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_011852	TAG	2	6	384162	384167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1548	NC_011852	TATTT	2	10	384217	384226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011852	TA	4	8	384377	384384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1551	NC_011852	AGT	2	6	384399	384404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1554	NC_011852	TAAA	2	8	384772	384779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_011852	CAC	2	6	384795	384800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_011852	AACC	2	8	384883	384890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_011852	TAA	2	6	384950	384955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_011852	TAG	2	6	385021	385026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1562	NC_011852	T	6	6	385113	385118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1564	NC_011852	TG	3	6	386715	386720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011852	A	7	7	389158	389164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1567	NC_011852	TAA	2	6	389214	389219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011852	AT	3	6	389223	389228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011852	A	6	6	389240	389245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_011852	T	6	6	389265	389270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1575	NC_011852	TTAT	2	8	390885	390892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011852	A	8	8	390898	390905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1586	NC_011852	ATG	2	6	395417	395422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1602	NC_011852	GAA	2	6	402456	402461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1604	NC_011852	TAT	2	6	402512	402517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011852	TGT	2	6	402571	402576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1612	NC_011852	TTTAT	2	10	403746	403755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_011852	TGT	2	6	403761	403766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1623	NC_011852	T	6	6	404047	404052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_011852	AGC	2	6	404067	404072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_011852	TATTGG	2	12	404151	404162	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1627	NC_011852	TGCTAT	2	12	404187	404198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1629	NC_011852	CAA	2	6	404298	404303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_011852	GAAG	2	8	404319	404326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_011852	TGT	2	6	404367	404372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_011852	GAT	2	6	404512	404517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1634	NC_011852	TGA	2	6	404541	404546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_011852	CAAGGC	2	12	404554	404565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1639	NC_011852	CTATTG	2	12	404627	404638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1913	NC_011852	CTT	2	6	460671	460676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_011852	CAA	2	6	460728	460733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1915	NC_011852	A	6	6	460823	460828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_011852	TTTA	2	8	460854	460861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1926	NC_011852	CAAAA	2	10	465014	465023	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1935	NC_011852	AAC	2	6	466162	466167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1945	NC_011852	GT	3	6	467462	467467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1946	NC_011852	CAT	2	6	467473	467478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1961	NC_011852	ACA	2	6	474983	474988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1962	NC_011852	ATA	2	6	475001	475006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1963	NC_011852	AAT	2	6	475833	475838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1964	NC_011852	A	6	6	475839	475844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_011852	CT	3	6	475871	475876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1966	NC_011852	TTTA	2	8	475877	475884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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