MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 10112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011852	ATA	2	6	224292	224297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011852	GTGG	2	8	224309	224316	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011852	AAAC	2	8	224375	224382	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_011852	GGA	2	6	224399	224404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011852	TAA	2	6	224449	224454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011852	TCA	2	6	224496	224501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011852	GGC	2	6	224521	224526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_011852	AAT	2	6	224600	224605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011852	AGT	2	6	224647	224652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011852	GAT	2	6	224687	224692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011852	AAAAT	2	10	224724	224733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011852	G	6	6	224782	224787	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011852	ATA	2	6	224862	224867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011852	AACG	2	8	224881	224888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_011852	TTAA	2	8	224918	224925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011852	GCA	2	6	224973	224978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_011852	GA	3	6	224997	225002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011852	CAG	2	6	225063	225068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_011852	GCT	2	6	225071	225076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_011852	TAG	2	6	225081	225086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011852	CAG	2	6	225135	225140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_011852	GCT	2	6	225143	225148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_011852	CAG	2	6	225189	225194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_011852	CAG	2	6	225225	225230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_011852	CAG	2	6	225261	225266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011852	CAG	2	6	225342	225347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_011852	CAG	2	6	225387	225392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_011852	GCT	2	6	225395	225400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_011852	CAG	2	6	225441	225446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_011852	AG	3	6	225504	225509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011852	CAG	2	6	225774	225779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_011852	CAG	2	6	225846	225851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_011852	CAG	2	6	225873	225878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_011852	CTG	2	6	225909	225914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_011852	GAT	2	6	225956	225961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011852	GGC	2	6	226037	226042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_011852	AAT	2	6	226070	226075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011852	AAC	2	6	226133	226138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_011852	TAA	2	6	226222	226227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011852	TTG	2	6	226263	226268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011852	GA	3	6	226365	226370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011852	AAC	2	6	226410	226415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_011852	TGA	2	6	226423	226428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011852	TTC	2	6	226568	226573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_011852	ATG	2	6	226581	226586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011852	ATCT	2	8	226819	226826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_011852	AAT	2	6	226922	226927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011852	GCA	2	6	227021	227026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_011852	GGT	2	6	227072	227077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_011852	GT	3	6	227076	227081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011852	CGG	2	6	227095	227100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_011852	GTG	2	6	227123	227128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011852	AG	4	8	227272	227279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011852	TGC	2	6	227305	227310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_011852	AAC	2	6	227311	227316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_011852	TAA	3	9	227543	227551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011852	TG	3	6	227592	227597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011852	TGCT	2	8	228552	228559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_011852	CAATT	2	10	228581	228590	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_011852	AAT	2	6	228610	228615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011852	ATT	2	6	228622	228627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011852	ATT	2	6	228634	228639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011852	TGG	2	6	231287	231292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011852	A	6	6	233293	233298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011852	TGG	2	6	233305	233310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011852	TAG	2	6	233314	233319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011852	ATT	2	6	233365	233370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011852	AGTG	2	8	233472	233479	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011852	TAT	2	6	234188	234193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011852	TC	3	6	234312	234317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_011852	CTT	2	6	234344	234349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_011852	AAAGAT	2	12	234386	234397	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011852	TCG	2	6	234400	234405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_011852	ATT	2	6	234442	234447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011852	CGA	2	6	234463	234468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_011852	AGA	2	6	234475	234480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011852	CGC	2	6	234483	234488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_011852	ATGT	2	8	234502	234509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011852	GAT	2	6	234601	234606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011852	T	6	6	234724	234729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_011852	AGA	2	6	234801	234806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_011852	TG	3	6	234838	234843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011852	GTG	2	6	234851	234856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011852	CGG	2	6	234894	234899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_011852	TTAA	2	8	234943	234950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011852	ATC	2	6	235011	235016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_011852	ATGTG	2	10	235019	235028	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011852	AGGTAG	2	12	235034	235045	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011852	TAAT	2	8	235057	235064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011852	TAT	2	6	235072	235077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011852	TTAA	2	8	236562	236569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011852	T	6	6	237982	237987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011852	ATG	2	6	238031	238036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011852	TAG	2	6	238105	238110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011852	TAT	2	6	238134	238139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011852	AT	3	6	238148	238153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011852	TAA	2	6	238174	238179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011852	ATTA	2	8	241411	241418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011852	TA	3	6	249165	249170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011852	TCA	2	6	249912	249917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_011852	CTA	2	6	253422	253427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_011852	AAT	2	6	253932	253937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011852	T	6	6	256651	256656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011852	TAA	2	6	256673	256678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011852	AGA	2	6	256726	256731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011852	A	7	7	257066	257072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011852	CAG	2	6	257148	257153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_011852	CTA	2	6	257876	257881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_011852	TTA	2	6	257888	257893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011852	TTA	2	6	257913	257918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011852	ATA	2	6	257929	257934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011852	TTC	2	6	259865	259870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_011852	CAA	2	6	259884	259889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_011852	T	8	8	259907	259914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011852	A	7	7	259921	259927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011852	TA	3	6	259961	259966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011852	GGGT	2	8	259975	259982	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011852	GTG	2	6	260014	260019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011852	ACCC	2	8	260027	260034	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1120	NC_011852	TTC	2	6	260513	260518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_011852	CT	3	6	260573	260578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_011852	AAATT	2	10	260588	260597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011852	TA	3	6	260641	260646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011852	TA	3	6	260664	260669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011852	ATTT	2	8	262752	262759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011852	ACG	2	6	262815	262820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_011852	A	6	6	265336	265341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011852	AAG	2	6	265343	265348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011852	GGAG	2	8	265421	265428	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_011852	TTA	2	6	265445	265450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011852	CT	4	8	265471	265478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_011852	TC	4	8	265510	265517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_011852	GA	3	6	265528	265533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011852	CAT	2	6	265538	265543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_011852	TCC	2	6	266814	266819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_011852	A	8	8	266888	266895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_011852	A	6	6	266922	266927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_011852	A	7	7	266942	266948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_011852	TAT	2	6	304637	304642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1264	NC_011852	TA	3	6	307334	307339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_011852	TAA	2	6	307372	307377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_011852	AC	3	6	307387	307392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1267	NC_011852	GT	3	6	307396	307401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_011852	T	6	6	308306	308311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_011852	T	6	6	308339	308344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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