MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 10112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_011852	CAG	2	6	2077533	2077538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9502	NC_011852	TTG	2	6	2077549	2077554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9503	NC_011852	A	6	6	2078518	2078523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9504	NC_011852	ATTA	2	8	2078532	2078539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_011852	AGA	2	6	2078574	2078579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9506	NC_011852	TA	3	6	2078605	2078610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9507	NC_011852	GAA	2	6	2079055	2079060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9508	NC_011852	A	6	6	2079072	2079077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9509	NC_011852	T	6	6	2079137	2079142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9510	NC_011852	TAAC	2	8	2079153	2079160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9511	NC_011852	ATT	2	6	2079178	2079183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9512	NC_011852	AT	3	6	2079187	2079192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_011852	AT	3	6	2079196	2079201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9514	NC_011852	A	6	6	2079211	2079216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9515	NC_011852	TTA	2	6	2079217	2079222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9516	NC_011852	TGA	2	6	2079278	2079283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_011852	AGTAG	2	10	2079300	2079309	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9518	NC_011852	TAT	2	6	2079348	2079353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9519	NC_011852	TA	3	6	2079364	2079369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9520	NC_011852	AAT	2	6	2079387	2079392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9521	NC_011852	ATTT	2	8	2079419	2079426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9522	NC_011852	AGC	2	6	2080198	2080203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9523	NC_011852	GTT	2	6	2080232	2080237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9524	NC_011852	ATT	2	6	2080255	2080260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9525	NC_011852	TA	3	6	2085510	2085515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9526	NC_011852	CGCT	2	8	2085624	2085631	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9527	NC_011852	A	6	6	2087502	2087507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9528	NC_011852	CAT	2	6	2087536	2087541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9529	NC_011852	ATAG	2	8	2087600	2087607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9530	NC_011852	TAA	2	6	2087621	2087626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9531	NC_011852	T	6	6	2087637	2087642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9532	NC_011852	TGAT	2	8	2087697	2087704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9533	NC_011852	TAA	2	6	2089511	2089516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9534	NC_011852	AG	3	6	2089520	2089525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9535	NC_011852	TTATG	2	10	2089573	2089582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9536	NC_011852	TAGA	2	8	2089599	2089606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9537	NC_011852	T	6	6	2092448	2092453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9538	NC_011852	TAA	2	6	2092455	2092460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9539	NC_011852	GA	3	6	2093214	2093219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9540	NC_011852	ATA	2	6	2093425	2093430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9541	NC_011852	CTTT	2	8	2093456	2093463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9542	NC_011852	TAA	2	6	2093512	2093517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9543	NC_011852	CAT	2	6	2093556	2093561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9544	NC_011852	TTTAT	2	10	2095087	2095096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9545	NC_011852	GAA	2	6	2095097	2095102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9546	NC_011852	AAT	2	6	2095119	2095124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9547	NC_011852	T	6	6	2095173	2095178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9548	NC_011852	AACT	2	8	2095200	2095207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9549	NC_011852	A	8	8	2095216	2095223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9550	NC_011852	CAA	2	6	2095323	2095328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9551	NC_011852	TTCCC	2	10	2097629	2097638	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9552	NC_011852	AATT	2	8	2097676	2097683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9553	NC_011852	C	6	6	2097715	2097720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9554	NC_011852	CGG	2	6	2097742	2097747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9555	NC_011852	ATT	2	6	2097753	2097758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9556	NC_011852	A	6	6	2099273	2099278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9557	NC_011852	TTTTA	2	10	2099297	2099306	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9558	NC_011852	AAC	2	6	2099313	2099318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9559	NC_011852	CTA	2	6	2099923	2099928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9561	NC_011852	GATA	2	8	2101413	2101420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9562	NC_011852	AAAAT	2	10	2101421	2101430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9563	NC_011852	GA	3	6	2101527	2101532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9564	NC_011852	CAC	2	6	2101611	2101616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9565	NC_011852	ATT	2	6	2101666	2101671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9566	NC_011852	A	7	7	2101677	2101683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9567	NC_011852	TAAAA	2	10	2103199	2103208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9568	NC_011852	AC	3	6	2103858	2103863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9569	NC_011852	A	6	6	2103864	2103869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9570	NC_011852	TGA	2	6	2104896	2104901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9572	NC_011852	GT	3	6	2105020	2105025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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9574	NC_011852	TTG	2	6	2105045	2105050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9576	NC_011852	GT	3	6	2105066	2105071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9577	NC_011852	GTT	2	6	2106264	2106269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9583	NC_011852	TTG	2	6	2106834	2106839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9585	NC_011852	A	6	6	2107225	2107230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9603	NC_011852	A	7	7	2109421	2109427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9604	NC_011852	GTC	2	6	2109501	2109506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9612	NC_011852	ATA	2	6	2109707	2109712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9613	NC_011852	GTA	2	6	2109805	2109810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9614	NC_011852	T	11	11	2109829	2109839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9615	NC_011852	CT	3	6	2109841	2109846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9616	NC_011852	AAAT	2	8	2112392	2112399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9621	NC_011852	ACT	2	6	2119400	2119405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9622	NC_011852	T	7	7	2119412	2119418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9623	NC_011852	ATA	2	6	2119432	2119437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9624	NC_011852	GTTG	2	8	2119464	2119471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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9630	NC_011852	TTAG	2	8	2121000	2121007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9631	NC_011852	T	7	7	2121043	2121049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9936	NC_011852	AGA	2	6	2215903	2215908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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