MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 10112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011852	AGGA	2	8	112344	112351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011852	AGAT	2	8	114253	114260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011852	ATA	2	6	114280	114285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011852	TGC	2	6	114294	114299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011852	A	6	6	114310	114315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011852	TGGG	2	8	116289	116296	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011852	A	7	7	116309	116315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011852	CCA	2	6	117140	117145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_011852	AGGATT	2	12	117164	117175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011852	CGA	2	6	117207	117212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011852	AGC	2	6	117253	117258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_011852	TCA	2	6	117477	117482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_011852	T	6	6	118509	118514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011852	GT	3	6	118515	118520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011852	ACCAAT	2	12	118653	118664	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011852	TA	3	6	118692	118697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011852	GAAC	2	8	118706	118713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
518	NC_011852	TGA	2	6	118725	118730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011852	ACA	2	6	118816	118821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_011852	AGT	2	6	118863	118868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011852	TTG	2	6	118869	118874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011852	TGC	2	6	118879	118884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_011852	AT	3	6	118911	118916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011852	GTG	2	6	118990	118995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011852	T	6	6	119006	119011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011852	AAT	2	6	124354	124359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011852	AAT	2	6	124453	124458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011852	TAAA	2	8	124466	124473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011852	AC	3	6	126974	126979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_011852	GT	3	6	126983	126988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011852	AAT	2	6	127013	127018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011852	AC	3	6	127032	127037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
533	NC_011852	GT	3	6	127041	127046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011852	AAC	2	6	127076	127081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_011852	T	7	7	130649	130655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011852	ATTA	2	8	132180	132187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011852	C	6	6	132193	132198	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
538	NC_011852	C	6	6	132202	132207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
539	NC_011852	G	6	6	132217	132222	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011852	TTA	2	6	133951	133956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011852	TAAT	2	8	133968	133975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011852	TAA	2	6	135261	135266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011852	TTA	2	6	137472	137477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011852	TTA	2	6	137495	137500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011852	T	6	6	137514	137519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011852	T	6	6	137631	137636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011852	GCT	2	6	138955	138960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_011852	TCCTT	2	10	139051	139060	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
549	NC_011852	CCG	2	6	139090	139095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_011852	ATT	2	6	139096	139101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011852	ACAAT	2	10	139117	139126	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
552	NC_011852	AC	3	6	140963	140968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_011852	GT	3	6	140972	140977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011852	ACA	2	6	140984	140989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011852	TCTAT	2	10	140996	141005	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
556	NC_011852	AC	3	6	141024	141029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_011852	GT	3	6	141033	141038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011852	TCA	2	6	141148	141153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_011852	T	6	6	142180	142185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011852	GT	3	6	142186	142191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011852	TAAA	2	8	142218	142225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011852	A	7	7	143233	143239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011852	C	6	6	143302	143307	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
564	NC_011852	G	6	6	143317	143322	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011852	CCA	2	6	144041	144046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_011852	TATT	2	8	144057	144064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011852	TAAA	2	8	145747	145754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011852	TTCTT	2	10	146410	146419	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
569	NC_011852	ATC	2	6	146421	146426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_011852	GGT	2	6	146440	146445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011852	TTCTT	2	10	146470	146479	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
572	NC_011852	ATC	2	6	146481	146486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_011852	TTCTT	2	10	146531	146540	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
574	NC_011852	ATC	2	6	146542	146547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_011852	GGT	2	6	146562	146567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011852	A	6	6	147666	147671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011852	A	6	6	147676	147681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011852	ATTA	2	8	147780	147787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011852	CAG	2	6	147863	147868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_011852	ATCA	2	8	147891	147898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
581	NC_011852	T	7	7	147900	147906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011852	TAAA	2	8	147938	147945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011852	CCCA	2	8	147979	147986	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
584	NC_011852	ATC	2	6	148050	148055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_011852	CTG	2	6	148104	148109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_011852	ACC	2	6	148170	148175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_011852	TTG	2	6	148193	148198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011852	TCG	2	6	148239	148244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_011852	T	9	9	148245	148253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011852	T	6	6	148298	148303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011852	CAT	2	6	148304	148309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011852	CAC	2	6	148371	148376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_011852	T	6	6	148397	148402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011852	AAT	2	6	148407	148412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011852	AAT	2	6	148480	148485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011852	GGA	2	6	148509	148514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011852	CCA	2	6	148678	148683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_011852	CAG	2	6	148739	148744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_011852	GTG	2	6	148758	148763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011852	ATC	2	6	148803	148808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_011852	TTTAC	2	10	148888	148897	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
602	NC_011852	ACT	2	6	148905	148910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_011852	CTT	2	6	148913	148918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011852	TAA	2	6	149015	149020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011852	CAA	2	6	149060	149065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_011852	TGG	2	6	149148	149153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011852	T	6	6	149226	149231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011852	AAATA	2	10	149244	149253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011852	CAG	2	6	149262	149267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_011852	A	7	7	149295	149301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011852	T	7	7	149494	149500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011852	TATT	2	8	150273	150280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011852	T	6	6	150290	150295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011852	TGA	2	6	150895	150900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011852	TCAA	2	8	150990	150997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_011852	AGA	2	6	151613	151618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011852	TGT	2	6	151628	151633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011852	TA	3	6	151670	151675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011852	GAT	2	6	152464	152469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011852	AGT	2	6	153798	153803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011852	AGA	2	6	153865	153870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011852	A	6	6	153881	153886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011852	AT	3	6	153896	153901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011852	AT	3	6	155096	155101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011852	CTA	2	6	155150	155155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011852	TC	3	6	156154	156159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_011852	T	6	6	156187	156192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011852	C	6	6	156822	156827	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
629	NC_011852	T	7	7	156870	156876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011852	A	6	6	156888	156893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011852	A	6	6	156910	156915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011852	TA	3	6	156925	156930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011852	AAATGA	2	12	156952	156963	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011852	TTA	3	9	156985	156993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011852	GTG	2	6	156999	157004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011852	ATT	2	6	157005	157010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011852	CGC	2	6	157013	157018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_011852	T	6	6	157089	157094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_011852	ACA	2	6	157126	157131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_011852	ATG	2	6	157238	157243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_011852	ATC	2	6	157265	157270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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953	NC_011852	T	6	6	221722	221727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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