MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 10112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011852	A	6	6	1996822	1996827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_011852	ACA	2	6	1996906	1996911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_011852	CAG	2	6	1996924	1996929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_011852	ATAG	2	8	1996932	1996939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_011852	AG	3	6	1996938	1996943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_011852	CAA	2	6	1996961	1996966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_011852	CATTA	2	10	1997016	1997025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9008	NC_011852	AT	3	6	1997489	1997494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_011852	T	6	6	1997574	1997579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_011852	AAT	2	6	2000692	2000697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_011852	TAT	2	6	2000718	2000723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_011852	TAT	2	6	2000730	2000735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_011852	TTC	2	6	2003288	2003293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_011852	GAA	2	6	2003400	2003405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_011852	TTTC	2	8	2003407	2003414	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9016	NC_011852	GAA	2	6	2003427	2003432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_011852	GAA	2	6	2004532	2004537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_011852	TCC	2	6	2004546	2004551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9019	NC_011852	TCC	2	6	2004600	2004605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9020	NC_011852	TTC	2	6	2004653	2004658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_011852	AC	3	6	2004737	2004742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9022	NC_011852	CAT	2	6	2004919	2004924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_011852	CCA	2	6	2004925	2004930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9024	NC_011852	CTA	2	6	2004931	2004936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_011852	AT	3	6	2005242	2005247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_011852	G	7	7	2005258	2005264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_011852	AGG	2	6	2005298	2005303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_011852	AG	3	6	2005307	2005312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_011852	T	7	7	2005314	2005320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_011852	GTG	2	6	2005321	2005326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_011852	TAA	2	6	2005351	2005356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_011852	TTGAT	2	10	2005398	2005407	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_011852	TAC	2	6	2006154	2006159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_011852	TAA	2	6	2008966	2008971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_011852	CCA	2	6	2009006	2009011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9036	NC_011852	T	7	7	2009028	2009034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_011852	ATC	2	6	2009052	2009057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_011852	ATG	2	6	2009061	2009066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_011852	ACTC	2	8	2009099	2009106	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9040	NC_011852	A	6	6	2009136	2009141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_011852	A	6	6	2009209	2009214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_011852	ATGA	2	8	2009216	2009223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_011852	GTC	2	6	2009982	2009987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_011852	TTGAG	2	10	2009991	2010000	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_011852	AGCTTA	2	12	2010025	2010036	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9046	NC_011852	CTTA	2	8	2010481	2010488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9047	NC_011852	T	7	7	2010514	2010520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_011852	TAT	2	6	2010526	2010531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_011852	TTAT	2	8	2010576	2010583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_011852	ATT	2	6	2010585	2010590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_011852	AAC	2	6	2010665	2010670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_011852	CAAA	2	8	2010710	2010717	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9053	NC_011852	GA	3	6	2010895	2010900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_011852	TGA	2	6	2010994	2010999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_011852	ATT	2	6	2011011	2011016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_011852	CTA	2	6	2011035	2011040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_011852	ATG	2	6	2011074	2011079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_011852	G	6	6	2011165	2011170	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_011852	AAC	2	6	2011207	2011212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_011852	GAT	2	6	2011373	2011378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_011852	TAA	2	6	2011399	2011404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_011852	GTC	2	6	2011464	2011469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_011852	ATT	2	6	2011475	2011480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_011852	T	6	6	2011502	2011507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_011852	T	6	6	2011549	2011554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_011852	T	7	7	2011578	2011584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_011852	CAA	2	6	2011625	2011630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_011852	AAT	2	6	2011634	2011639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_011852	TAA	2	6	2011648	2011653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_011852	ATA	2	6	2012040	2012045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_011852	CTAA	2	8	2014198	2014205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9072	NC_011852	TAG	2	6	2014382	2014387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_011852	TCAA	2	8	2014418	2014425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9074	NC_011852	TAA	2	6	2014488	2014493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_011852	AAT	2	6	2014527	2014532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_011852	GAG	2	6	2014533	2014538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_011852	AC	3	6	2014844	2014849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9078	NC_011852	GT	3	6	2014853	2014858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_011852	ACA	2	6	2014865	2014870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9080	NC_011852	AC	3	6	2014911	2014916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9081	NC_011852	GT	3	6	2014920	2014925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_011852	AGT	2	6	2016609	2016614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_011852	T	6	6	2016640	2016645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_011852	GAT	2	6	2016663	2016668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_011852	TCT	2	6	2016692	2016697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9086	NC_011852	TAT	2	6	2016701	2016706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_011852	ATT	2	6	2016723	2016728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_011852	CAAC	2	8	2017854	2017861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9089	NC_011852	TTC	2	6	2019241	2019246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9091	NC_011852	AG	3	6	2019329	2019334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_011852	ATA	2	6	2019371	2019376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_011852	TAT	2	6	2019396	2019401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_011852	AAC	2	6	2019410	2019415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9095	NC_011852	TCAA	2	8	2019467	2019474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9096	NC_011852	GACC	2	8	2019528	2019535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9097	NC_011852	TTCGT	2	10	2019600	2019609	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9098	NC_011852	GGCA	2	8	2019709	2019716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9099	NC_011852	A	7	7	2019742	2019748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_011852	TGAT	2	8	2019795	2019802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_011852	CTA	2	6	2019928	2019933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9102	NC_011852	CA	3	6	2020006	2020011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9103	NC_011852	CTC	2	6	2020022	2020027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9104	NC_011852	CAG	2	6	2020205	2020210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9105	NC_011852	AGA	2	6	2020284	2020289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_011852	TTG	2	6	2020297	2020302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_011852	CGC	2	6	2020548	2020553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9108	NC_011852	TGC	2	6	2020554	2020559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9109	NC_011852	GCC	2	6	2020609	2020614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9110	NC_011852	CAT	2	6	2020631	2020636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_011852	TGG	2	6	2020697	2020702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_011852	CGT	2	6	2020703	2020708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9113	NC_011852	CTG	2	6	2020886	2020891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_011852	CAG	2	6	2020976	2020981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_011852	CTG	2	6	2021003	2021008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9116	NC_011852	CTG	2	6	2021084	2021089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_011852	CTG	2	6	2021165	2021170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_011852	CTG	2	6	2021273	2021278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9119	NC_011852	ATT	2	6	2021457	2021462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_011852	C	7	7	2021529	2021535	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9121	NC_011852	ATC	2	6	2021598	2021603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9122	NC_011852	GT	3	6	2021699	2021704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_011852	TGA	2	6	2021810	2021815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_011852	TTA	2	6	2021818	2021823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_011852	ATT	2	6	2021859	2021864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_011852	TGT	2	6	2021910	2021915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_011852	ACGCC	2	10	2021981	2021990	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9128	NC_011852	ACC	2	6	2021991	2021996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9129	NC_011852	AATTG	2	10	2022006	2022015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_011852	GATT	2	8	2022258	2022265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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9132	NC_011852	GCA	2	6	2022283	2022288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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