MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 10112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_011852	GAA	2	6	1916573	1916578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_011852	ACC	2	6	1916595	1916600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8503	NC_011852	CTG	2	6	1916615	1916620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_011852	GAA	2	6	1916633	1916638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_011852	GGC	2	6	1916681	1916686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_011852	GATC	2	8	1916782	1916789	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8507	NC_011852	GAT	2	6	1916869	1916874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_011852	GCCAA	2	10	1916886	1916895	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8509	NC_011852	A	6	6	1917732	1917737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_011852	T	6	6	1917759	1917764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_011852	TAA	2	6	1917849	1917854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_011852	GCAA	11	44	1917868	1917911	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8513	NC_011852	A	6	6	1920188	1920193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_011852	T	6	6	1921332	1921337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_011852	TCA	2	6	1921390	1921395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8516	NC_011852	TTGGT	2	10	1921400	1921409	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_011852	T	6	6	1921444	1921449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_011852	AAC	2	6	1921486	1921491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_011852	GTT	2	6	1921569	1921574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_011852	GGTT	2	8	1921589	1921596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_011852	TCA	2	6	1921639	1921644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_011852	ATG	2	6	1921647	1921652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_011852	T	7	7	1921754	1921760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_011852	TCG	2	6	1921822	1921827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_011852	GAT	2	6	1921938	1921943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_011852	TAA	2	6	1921957	1921962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_011852	CA	3	6	1922021	1922026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8528	NC_011852	A	6	6	1922151	1922156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_011852	AGC	2	6	1922176	1922181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8530	NC_011852	A	6	6	1922216	1922221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_011852	AGA	2	6	1922254	1922259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_011852	ATC	2	6	1922274	1922279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_011852	AAAG	2	8	1922282	1922289	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_011852	GAA	2	6	1922309	1922314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_011852	CCG	2	6	1922363	1922368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8536	NC_011852	GAG	2	6	1922397	1922402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_011852	TGA	2	6	1922426	1922431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_011852	TAC	2	6	1922436	1922441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_011852	AGTG	2	8	1922453	1922460	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_011852	GGA	2	6	1922477	1922482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_011852	GT	3	6	1922511	1922516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_011852	AGT	2	6	1922568	1922573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_011852	GTGC	2	8	1922603	1922610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8544	NC_011852	AGA	2	6	1922666	1922671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_011852	GCT	2	6	1922786	1922791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_011852	ACA	2	6	1922849	1922854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8547	NC_011852	AAT	2	6	1922884	1922889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_011852	CTA	2	6	1922918	1922923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_011852	ATA	2	6	1922953	1922958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_011852	AATT	2	8	1923999	1924006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_011852	A	7	7	1924031	1924037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_011852	CAAA	2	8	1924039	1924046	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8553	NC_011852	ATT	2	6	1924064	1924069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_011852	TAA	2	6	1924070	1924075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_011852	A	6	6	1924650	1924655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_011852	GGTTA	2	10	1924693	1924702	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_011852	TGA	2	6	1925504	1925509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_011852	TAAA	2	8	1925648	1925655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_011852	CTTTT	2	10	1926025	1926034	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8560	NC_011852	TCTT	2	8	1926035	1926042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8561	NC_011852	CAT	2	6	1927181	1927186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_011852	GGA	2	6	1927239	1927244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_011852	TCC	2	6	1927319	1927324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8564	NC_011852	GTAA	2	8	1927348	1927355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_011852	CAG	2	6	1927360	1927365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8566	NC_011852	TC	4	8	1927370	1927377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8567	NC_011852	GGA	2	6	1927405	1927410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_011852	TCC	2	6	1927485	1927490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8569	NC_011852	AAT	2	6	1927514	1927519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_011852	AAT	2	6	1927579	1927584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_011852	TAT	2	6	1927625	1927630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_011852	ATT	2	6	1927632	1927637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_011852	ATT	2	6	1927672	1927677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_011852	T	6	6	1927742	1927747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_011852	TTA	2	6	1927772	1927777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8579	NC_011852	TCA	2	6	1930997	1931002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8582	NC_011852	ATT	2	6	1932441	1932446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8587	NC_011852	CTTT	2	8	1932628	1932635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8592	NC_011852	TGAT	2	8	1932745	1932752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_011852	T	6	6	1932755	1932760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_011852	TAAA	2	8	1932819	1932826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_011852	TCA	2	6	1932831	1932836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8600	NC_011852	GTA	2	6	1933010	1933015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_011852	AAT	2	6	1933022	1933027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_011852	GTG	2	6	1933045	1933050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_011852	GTT	2	6	1933126	1933131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_011852	GTTT	2	8	1933137	1933144	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_011852	AAT	2	6	1933153	1933158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8610	NC_011852	ATT	2	6	1933358	1933363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_011852	TAT	2	6	1933369	1933374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_011852	CAA	2	6	1933377	1933382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8613	NC_011852	CTA	2	6	1933399	1933404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8615	NC_011852	GAA	2	6	1934297	1934302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8621	NC_011852	AATTTA	2	12	1938986	1938997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8623	NC_011852	TTTA	2	8	1939048	1939055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8626	NC_011852	AAAT	2	8	1939921	1939928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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