MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 10112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011852	ATA	2	6	1835657	1835662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_011852	T	6	6	1835725	1835730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_011852	CAT	2	6	1835742	1835747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_011852	CCA	2	6	1835753	1835758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_011852	TAAA	2	8	1835789	1835796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_011852	TCA	2	6	1835801	1835806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_011852	ATTG	2	8	1835830	1835837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_011852	TA	3	6	1835841	1835846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_011852	GTA	2	6	1835880	1835885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_011852	TTCGG	2	10	1835895	1835904	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8011	NC_011852	AAT	2	6	1835909	1835914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_011852	GAA	2	6	1835973	1835978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_011852	TGT	2	6	1835979	1835984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_011852	AT	3	6	1836049	1836054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_011852	CTGA	2	8	1836067	1836074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8016	NC_011852	GTT	2	6	1836095	1836100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_011852	GTTT	2	8	1836106	1836113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_011852	ATTT	2	8	1836152	1836159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_011852	ATT	2	6	1836207	1836212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_011852	T	6	6	1836259	1836264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_011852	CAA	2	6	1836326	1836331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_011852	T	6	6	1836350	1836355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_011852	A	6	6	1836364	1836369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_011852	CAAC	2	8	1836399	1836406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8025	NC_011852	T	6	6	1836422	1836427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_011852	ACA	2	6	1836454	1836459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_011852	TC	3	6	1836497	1836502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_011852	GTA	2	6	1836624	1836629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_011852	CTA	2	6	1836665	1836670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_011852	AAC	2	6	1836682	1836687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_011852	GTT	2	6	1836710	1836715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_011852	AT	3	6	1836742	1836747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_011852	TAA	2	6	1838467	1838472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_011852	A	6	6	1838530	1838535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_011852	T	6	6	1838541	1838546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_011852	CCA	2	6	1838547	1838552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_011852	GTTTT	2	10	1838598	1838607	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_011852	CTA	2	6	1838638	1838643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_011852	TTG	2	6	1838764	1838769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_011852	AGTT	2	8	1838789	1838796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_011852	TAA	2	6	1838818	1838823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_011852	CGA	2	6	1838829	1838834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_011852	GTC	2	6	1838933	1838938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_011852	TGA	2	6	1838951	1838956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_011852	TC	3	6	1838958	1838963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8046	NC_011852	TCT	2	6	1838966	1838971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_011852	T	6	6	1838971	1838976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_011852	TAGT	2	8	1839063	1839070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_011852	TTG	2	6	1839071	1839076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_011852	CT	3	6	1839088	1839093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8051	NC_011852	CT	3	6	1839096	1839101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_011852	AC	3	6	1839187	1839192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8053	NC_011852	CGT	2	6	1839205	1839210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_011852	CAA	2	6	1839217	1839222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_011852	AGC	2	6	1839382	1839387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_011852	ACG	2	6	1839436	1839441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_011852	TGA	2	6	1839516	1839521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_011852	CCG	2	6	1839544	1839549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8059	NC_011852	ACC	2	6	1839631	1839636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_011852	TGTC	2	8	1839672	1839679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8061	NC_011852	GCTT	2	8	1839690	1839697	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8062	NC_011852	CTC	2	6	1839750	1839755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_011852	GAG	2	6	1839769	1839774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_011852	CCA	2	6	1839794	1839799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8065	NC_011852	GGT	2	6	1839854	1839859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_011852	CTT	2	6	1839896	1839901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_011852	ATTTCA	2	12	1840010	1840021	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8068	NC_011852	CAT	2	6	1840049	1840054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_011852	GCC	2	6	1840124	1840129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8070	NC_011852	GGCA	2	8	1840195	1840202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8071	NC_011852	TAA	2	6	1840249	1840254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_011852	CAGC	2	8	1840262	1840269	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8073	NC_011852	TC	3	6	1840377	1840382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8074	NC_011852	ACC	2	6	1840407	1840412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8075	NC_011852	TCA	2	6	1840506	1840511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_011852	TC	3	6	1840512	1840517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8077	NC_011852	TGT	2	6	1840948	1840953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_011852	CGACT	2	10	1841036	1841045	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8079	NC_011852	CTTT	2	8	1841060	1841067	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8080	NC_011852	TGG	2	6	1841071	1841076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_011852	GTT	2	6	1841166	1841171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_011852	TG	3	6	1841202	1841207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_011852	TCGGT	2	10	1841411	1841420	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8084	NC_011852	GTAC	2	8	1841619	1841626	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_011852	GGA	2	6	1841725	1841730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_011852	C	6	6	1841735	1841740	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8087	NC_011852	TTG	2	6	1841775	1841780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_011852	TTC	2	6	1841851	1841856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_011852	TGC	2	6	1841863	1841868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_011852	CTTTCG	2	12	1841884	1841895	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_011852	CGC	2	6	1841898	1841903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8092	NC_011852	TAG	2	6	1841999	1842004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_011852	TTC	2	6	1842006	1842011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_011852	CTT	2	6	1842052	1842057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_011852	CTT	2	6	1842094	1842099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_011852	ACT	2	6	1842185	1842190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_011852	TAC	2	6	1842228	1842233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_011852	TC	3	6	1842281	1842286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8099	NC_011852	A	6	6	1842345	1842350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_011852	CCG	2	6	1842394	1842399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8101	NC_011852	ACA	2	6	1842436	1842441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_011852	TG	3	6	1842549	1842554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_011852	TTCA	2	8	1842571	1842578	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8104	NC_011852	GT	3	6	1842723	1842728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_011852	TCG	2	6	1842861	1842866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_011852	GT	3	6	1842892	1842897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_011852	ATG	2	6	1842917	1842922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_011852	TCC	2	6	1842943	1842948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8109	NC_011852	CCGA	2	8	1842979	1842986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8110	NC_011852	CAA	2	6	1842995	1843000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_011852	GAC	2	6	1843056	1843061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_011852	GCA	2	6	1843068	1843073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_011852	CTT	2	6	1843116	1843121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_011852	TTC	2	6	1843144	1843149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_011852	GCCTTC	2	12	1843388	1843399	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8116	NC_011852	TCC	2	6	1843405	1843410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8117	NC_011852	CCCT	2	8	1843450	1843457	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8118	NC_011852	GCT	2	6	1843595	1843600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_011852	CTT	2	6	1843620	1843625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_011852	TCA	2	6	1843672	1843677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_011852	CTT	2	6	1843704	1843709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_011852	C	6	6	1843739	1843744	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8123	NC_011852	CTG	2	6	1843763	1843768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_011852	TCG	2	6	1843838	1843843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_011852	CCA	2	6	1843862	1843867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8126	NC_011852	CGT	2	6	1843963	1843968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_011852	AAAG	2	8	1844027	1844034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_011852	CTTC	2	8	1844039	1844046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8129	NC_011852	GCC	2	6	1844079	1844084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_011852	A	7	7	1844155	1844161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8132	NC_011852	TCAA	2	8	1844233	1844240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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