MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori P12 plasmid HPP12

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011499	TAAC	2	8	2253	2260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011499	ATA	2	6	2378	2383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011499	AAT	2	6	2386	2391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011499	T	7	7	2397	2403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011499	TAA	2	6	2424	2429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011499	T	6	6	2432	2437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011499	A	7	7	2494	2500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011499	T	6	6	2504	2509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011499	T	7	7	4833	4839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011499	G	7	7	4862	4868	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011499	TA	4	8	4924	4931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011499	TAT	2	6	4948	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011499	ATA	2	6	4986	4991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011499	TGAT	2	8	5001	5008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011499	A	6	6	5599	5604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011499	TCA	2	6	5643	5648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011499	A	7	7	5657	5663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011499	TTTG	2	8	5699	5706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011499	T	6	6	5784	5789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011499	TGTA	2	8	5794	5801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011499	T	6	6	5815	5820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011499	GTTG	2	8	5828	5835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011499	A	6	6	5854	5859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011499	AAC	2	6	5874	5879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011499	A	6	6	5892	5897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011499	ATCT	2	8	5961	5968	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011499	AGCG	2	8	6002	6009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011499	TTTG	2	8	6040	6047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011499	AAGCG	2	10	6067	6076	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011499	A	6	6	6186	6191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011499	CTAAAA	2	12	6195	6206	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_011499	GTT	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011499	GC	4	8	6287	6294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011499	CTT	2	6	6376	6381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011499	CTT	2	6	6398	6403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011499	CTT	2	6	6420	6425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011499	T	6	6	6513	6518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011499	TGTA	2	8	6523	6530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011499	T	6	6	6544	6549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011499	GTTG	2	8	6557	6564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011499	A	6	6	6583	6588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011499	AAC	2	6	6603	6608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011499	A	6	6	6621	6626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011499	ATCT	2	8	6690	6697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011499	AGCG	2	8	6731	6738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011499	TTTG	2	8	6769	6776	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011499	AAGCG	2	10	6796	6805	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011499	A	6	6	6915	6920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011499	CTAAAA	2	12	6924	6935	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011499	GTT	2	6	6963	6968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011499	GC	4	8	7016	7023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011499	CTT	2	6	7105	7110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011499	CTT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011499	CTT	2	6	7149	7154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011499	CTT	2	6	7171	7176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011499	CTT	2	6	7193	7198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011499	ATT	2	6	7214	7219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011499	TAA	2	6	7235	7240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011499	AGG	2	6	7348	7353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011499	ATA	2	6	7375	7380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011499	TAA	2	6	7433	7438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011499	CTT	2	6	7459	7464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011499	TTA	2	6	7481	7486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011499	ATGC	2	8	9954	9961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011499	GAAA	2	8	9991	9998	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011499	CA	3	6	10142	10147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011499	TAT	2	6	10207	10212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.