MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori G27 plasmid pHPG27

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011334	ACA	2	6	161	166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011334	GGA	2	6	287	292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011334	AG	4	8	294	301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011334	TTA	2	6	335	340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011334	TAGTGC	2	12	348	359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011334	TTA	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011334	TAT	2	6	458	463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011334	GAA	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011334	T	6	6	3581	3586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011334	GTA	2	6	3596	3601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011334	T	6	6	3613	3618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011334	GTTG	2	8	3626	3633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011334	AGT	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011334	TAA	2	6	4798	4803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011334	TAAC	2	8	5917	5924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011334	AAT	2	6	5945	5950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011334	ATA	2	6	6042	6047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011334	AAT	2	6	6050	6055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011334	T	7	7	6061	6067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011334	TAA	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011334	T	6	6	6096	6101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011334	A	6	6	6158	6163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011334	T	6	6	6167	6172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011334	TC	3	6	6205	6210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011334	GTA	2	6	7459	7464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011334	CCTTG	2	10	7521	7530	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011334	A	6	6	7559	7564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011334	TGA	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011334	GTT	2	6	7677	7682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011334	TGT	2	6	7686	7691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011334	TC	3	6	7807	7812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011334	TG	3	6	7861	7866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011334	TGT	2	6	7881	7886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011334	TG	3	6	7904	7909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011334	TCA	2	6	7955	7960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011334	AG	4	8	8015	8022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011334	TTAG	2	8	8033	8040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011334	T	7	7	8496	8502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011334	G	7	7	8527	8533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011334	G	6	6	8538	8543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011334	TA	3	6	8590	8595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011334	TAT	2	6	8614	8619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011334	TTTTA	2	10	8620	8629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011334	ATA	2	6	8653	8658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011334	TGAT	2	8	8668	8675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011334	TTC	2	6	9259	9264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011334	GAAT	2	8	9278	9285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011334	ATC	2	6	9307	9312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011334	ATT	2	6	9354	9359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011334	T	6	6	9455	9460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011334	T	6	6	9484	9489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011334	GTAG	2	8	9495	9502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011334	T	6	6	9516	9521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011334	GTTG	2	8	9529	9536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011334	A	6	6	9555	9560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011334	AAC	2	6	9575	9580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011334	A	7	7	9593	9599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011334	AAGCG	2	10	9704	9713	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011334	CAAAA	2	10	9915	9924	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011334	GTT	2	6	9944	9949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011334	T	6	6	9979	9984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011334	GC	4	8	9999	10006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011334	G	6	6	10019	10024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.