MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 2015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011126	AGA	2	6	413921	413926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011126	GCAAA	2	10	413937	413946	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
503	NC_011126	AG	3	6	413949	413954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011126	A	6	6	413960	413965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011126	T	6	6	413967	413972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011126	TCTT	2	8	414010	414017	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
507	NC_011126	TATC	2	8	414043	414050	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_011126	GA	3	6	414211	414216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011126	CTG	2	6	414240	414245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_011126	GAT	2	6	414311	414316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011126	TAC	2	6	414330	414335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_011126	ACA	2	6	414394	414399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_011126	AGA	3	9	414455	414463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011126	CTTT	2	8	414521	414528	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_011126	TTTA	2	8	414529	414536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011126	AAAC	2	8	414613	414620	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_011126	TA	3	6	414631	414636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011126	ATT	2	6	414640	414645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011126	AGA	2	6	414756	414761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011126	ACAA	2	8	414766	414773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_011126	AGAT	2	8	414779	414786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011126	TAT	2	6	414816	414821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011126	GTA	2	6	414832	414837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011126	AGA	2	6	414846	414851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011126	A	6	6	414880	414885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011126	TAT	2	6	414886	414891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011126	TA	3	6	414898	414903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011126	ATCT	2	8	414919	414926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_011126	A	6	6	414946	414951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011126	GTA	2	6	415051	415056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011126	AAAT	2	8	415057	415064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011126	T	6	6	415091	415096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011126	CTT	2	6	415133	415138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011126	TTC	2	6	415204	415209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_011126	TTA	2	6	415270	415275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011126	ATCTT	2	10	415296	415305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
537	NC_011126	AAAAGA	2	12	415365	415376	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011126	TAT	2	6	415389	415394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011126	T	6	6	415403	415408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011126	AGA	2	6	415455	415460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011126	TA	3	6	415495	415500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011126	TAA	2	6	415535	415540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011126	CTG	2	6	415571	415576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_011126	ACA	2	6	415601	415606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_011126	TGG	2	6	415637	415642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011126	ATGAAG	2	12	415658	415669	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011126	AGG	2	6	415761	415766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011126	AAG	2	6	415829	415834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011126	AAG	2	6	415841	415846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011126	ATTA	2	8	415848	415855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011126	A	6	6	415861	415866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011126	TCA	2	6	415889	415894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_011126	GAAGA	2	10	415921	415930	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011126	GAT	2	6	415960	415965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011126	TA	3	6	416046	416051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011126	AAG	2	6	416083	416088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011126	AAG	2	6	416144	416149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011126	ATCT	2	8	416187	416194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
559	NC_011126	TAT	2	6	416226	416231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011126	TAA	2	6	426814	426819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011126	TTC	2	6	426822	426827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011126	TTAA	2	8	426838	426845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011126	A	6	6	426936	426941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011126	TAT	3	9	426956	426964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011126	TGTT	2	8	426978	426985	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011126	A	6	6	426986	426991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011126	ATT	2	6	427008	427013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011126	T	6	6	427012	427017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011126	AAG	2	6	427027	427032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011126	AAG	2	6	427065	427070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011126	CAA	2	6	427081	427086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011126	A	6	6	427133	427138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011126	TAT	2	6	427144	427149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011126	AGA	2	6	427183	427188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011126	AGA	3	9	427252	427260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011126	AGT	3	9	427321	427329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011126	AGA	2	6	427369	427374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011126	AAG	2	6	427387	427392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011126	A	6	6	427408	427413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011126	T	6	6	427415	427420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011126	AGA	2	6	427620	427625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011126	CTT	2	6	427691	427696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_011126	T	6	6	427695	427700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011126	A	6	6	427704	427709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011126	TAC	2	6	427778	427783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_011126	GAGAT	2	10	427812	427821	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
587	NC_011126	ACA	2	6	427842	427847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_011126	AGA	3	9	427903	427911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011126	CTTT	2	8	427969	427976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_011126	TTTA	2	8	427977	427984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011126	TA	3	6	428078	428083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011126	ATT	2	6	428087	428092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011126	A	6	6	428120	428125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011126	GTA	2	6	428196	428201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011126	AGA	2	6	428204	428209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011126	CAA	2	6	428216	428221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011126	AGAT	2	8	428227	428234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011126	GTA	2	6	428280	428285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011126	AGA	2	6	428294	428299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011126	TAT	2	6	428334	428339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011126	AT	3	6	428365	428370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011126	AAGA	2	8	428394	428401	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011126	A	6	6	428458	428463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011126	ATA	2	6	428482	428487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011126	TAAT	2	8	431125	431132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011126	GAGC	2	8	434552	434559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
607	NC_011126	CAA	2	6	434577	434582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_011126	GTG	2	6	434596	434601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011126	CGCT	2	8	434618	434625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
610	NC_011126	AT	3	6	434713	434718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011126	A	6	6	440000	440005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011126	TAT	2	6	441339	441344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011126	TAT	3	9	442698	442706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011126	A	6	6	443332	443337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011126	CTTC	2	8	443369	443376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_011126	TTA	2	6	443413	443418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011126	T	6	6	443436	443441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011126	ATT	2	6	443452	443457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011126	AC	3	6	446662	446667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_011126	TAA	2	6	446672	446677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011126	TACTA	2	10	446687	446696	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
622	NC_011126	TAA	2	6	446697	446702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011126	ATG	2	6	446717	446722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011126	TAT	2	6	447600	447605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011126	A	6	6	447630	447635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011126	ATA	2	6	447651	447656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011126	AGG	2	6	448421	448426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011126	TATAA	2	10	451394	451403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011126	AGG	2	6	451407	451412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011126	ATTTAT	2	12	455398	455409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011126	AGG	2	6	458688	458693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011126	TAG	2	6	460553	460558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011126	GGTG	2	8	460559	460566	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011126	TTA	2	6	462368	462373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011126	A	7	7	464298	464304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011126	TTTTA	2	10	470156	470165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011126	AAAT	2	8	472070	472077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011126	TCA	2	6	473249	473254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_011126	TAA	2	6	473260	473265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_011126	CTT	3	9	473641	473649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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