MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus somnus 2336 chromosome

Total Repeats: 6868

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010519	TCA	2	6	15	20	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010519	AAG	2	6	27	32	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010519	T	7	7	140	146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010519	T	7	7	174	180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010519	TAA	2	6	188	193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010519	A	6	6	3846	3851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010519	A	6	6	7239	7244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010519	CAA	2	6	7262	7267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010519	T	6	6	7293	7298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010519	ATT	2	6	8003	8008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010519	T	7	7	8035	8041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010519	AAT	2	6	8069	8074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010519	A	6	6	8644	8649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010519	T	6	6	8666	8671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010519	T	6	6	8673	8678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010519	A	8	8	8725	8732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010519	CTTT	2	8	9552	9559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010519	T	6	6	9561	9566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010519	A	8	8	9567	9574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010519	AAT	2	6	9588	9593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010519	ATT	2	6	11559	11564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010519	ATT	2	6	12284	12289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010519	GAA	2	6	12303	12308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010519	TTC	2	6	16054	16059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010519	GATGT	2	10	16074	16083	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010519	AT	3	6	16087	16092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010519	TTA	2	6	16093	16098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010519	TTG	2	6	16527	16532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010519	A	6	6	16554	16559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010519	TTC	2	6	19471	19476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010519	AAAG	2	8	19494	19501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010519	AAAT	2	8	19508	19515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010519	TAT	2	6	19523	19528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010519	TTG	2	6	19588	19593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010519	A	6	6	19635	19640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010519	AAT	2	6	20972	20977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010519	AAG	2	6	21002	21007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010519	T	6	6	21015	21020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010519	GATTTT	2	12	21023	21034	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010519	TAA	2	6	21921	21926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010519	ATA	2	6	22706	22711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010519	TA	3	6	22710	22715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010519	GGA	2	6	23691	23696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010519	ATTT	2	8	23724	23731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010519	TGT	2	6	24569	24574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010519	ATG	2	6	24582	24587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010519	TGA	2	6	24969	24974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010519	TAG	2	6	25961	25966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010519	ACA	2	6	26921	26926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010519	GAG	2	6	26956	26961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010519	GTAAAA	2	12	27863	27874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010519	A	6	6	27892	27897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010519	TACA	2	8	27898	27905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010519	TAT	2	6	27907	27912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010519	A	6	6	27937	27942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010519	TG	3	6	28255	28260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010519	TTA	2	6	28300	28305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010519	TA	4	8	29485	29492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010519	TGGT	2	8	29528	29535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010519	TAA	2	6	29585	29590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010519	AGA	2	6	29652	29657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010519	T	7	7	29674	29680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010519	ATTT	2	8	30249	30256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010519	ATTG	2	8	30266	30273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010519	T	6	6	30651	30656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010519	TCT	2	6	30660	30665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010519	TGG	2	6	30681	30686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010519	AAT	3	9	30702	30710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010519	ATT	2	6	30741	30746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010519	T	6	6	30748	30753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010519	GAT	2	6	30778	30783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010519	ACTTT	2	10	30801	30810	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010519	GTTT	2	8	30833	30840	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010519	T	6	6	30875	30880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010519	AAT	2	6	32151	32156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010519	TGAAT	2	10	32186	32195	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010519	T	6	6	32281	32286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010519	T	6	6	32292	32297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010519	TTA	2	6	32307	32312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010519	AG	3	6	33702	33707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010519	A	7	7	36141	36147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010519	TTA	2	6	36206	36211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010519	TCT	2	6	36255	36260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010519	A	6	6	36266	36271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010519	AGCA	2	8	36278	36285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010519	TTTAC	2	10	36706	36715	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010519	AGT	2	6	36734	36739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010519	A	6	6	37495	37500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010519	T	6	6	37525	37530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010519	ATT	2	6	37542	37547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010519	TATT	2	8	37586	37593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010519	GTT	2	6	37690	37695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010519	TTAT	2	8	40541	40548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010519	TA	3	6	40583	40588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010519	ATA	2	6	40616	40621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010519	TAT	3	9	40627	40635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010519	GGA	2	6	40741	40746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010519	CTTAAT	2	12	41387	41398	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010519	CAT	2	6	41406	41411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010519	A	9	9	41429	41437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010519	TACAT	2	10	41499	41508	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010519	GTT	2	6	41516	41521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010519	AGA	2	6	41532	41537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010519	GT	3	6	41543	41548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010519	A	6	6	41551	41556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010519	GAA	2	6	41614	41619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010519	A	6	6	43171	43176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010519	T	6	6	43194	43199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010519	TC	3	6	44768	44773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010519	AAATT	2	10	44853	44862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010519	ATT	2	6	44881	44886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010519	TGT	2	6	44888	44893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010519	ATTT	2	8	44941	44948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010519	CTT	2	6	45309	45314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010519	A	7	7	45345	45351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010519	TTA	2	6	46436	46441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010519	T	6	6	46475	46480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010519	CAT	2	6	46489	46494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010519	TAA	2	6	46515	46520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010519	ATTA	2	8	49381	49388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010519	ATTT	2	8	49982	49989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010519	CAA	2	6	49991	49996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010519	TAAAAA	2	12	50999	51010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010519	GCA	2	6	51064	51069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010519	CTT	2	6	51569	51574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010519	A	6	6	51589	51594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010519	A	6	6	52888	52893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010519	TTA	2	6	52905	52910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010519	TCT	2	6	52919	52924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010519	AAC	2	6	54165	54170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010519	ACT	2	6	54196	54201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010519	AT	3	6	54238	54243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010519	CAT	2	6	55272	55277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010519	TTATT	2	10	55326	55335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010519	A	6	6	55343	55348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010519	A	6	6	56636	56641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010519	TTAA	2	8	56696	56703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010519	AAG	2	6	56719	56724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010519	CCG	2	6	56748	56753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_010519	CAT	2	6	56831	56836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010519	ATT	2	6	56910	56915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010519	TGG	2	6	56921	56926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010519	CTAC	2	8	57091	57098	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010519	TAT	2	6	57132	57137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010519	A	6	6	57142	57147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010519	T	6	6	57164	57169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010519	A	9	9	57172	57180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010519	T	7	7	57184	57190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010519	ATT	2	6	57191	57196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_010519	TTA	2	6	180005	180010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_010519	TA	3	6	180015	180020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_010519	AAC	2	6	180021	180026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_010519	ATG	2	6	180120	180125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_010519	A	6	6	183139	183144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_010519	T	6	6	183149	183154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_010519	A	6	6	189249	189254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_010519	ATT	2	6	189269	189274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_010519	AT	3	6	189290	189295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_010519	TA	3	6	189363	189368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_010519	TTA	2	6	189426	189431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_010519	GA	3	6	189434	189439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
454	NC_010519	TGA	2	6	190323	190328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_010519	TTA	2	6	193523	193528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_010519	AGA	2	6	193569	193574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_010519	ATT	2	6	194179	194184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_010519	T	8	8	194222	194229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_010519	AT	3	6	194263	194268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_010519	A	6	6	196319	196324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_010519	T	6	6	196348	196353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_010519	T	6	6	197459	197464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_010519	AAG	2	6	197720	197725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
473	NC_010519	TTAT	2	8	197835	197842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_010519	T	6	6	200109	200114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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