MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS2

Total Repeats: 1066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010369	CGG	2	6	80158	80163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_010369	CCGC	2	8	80178	80185	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
503	NC_010369	CGA	2	6	80188	80193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_010369	GAA	2	6	80207	80212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010369	TCC	2	6	80235	80240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_010369	CA	3	6	80311	80316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_010369	CGC	2	6	80320	80325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_010369	CGA	3	9	80335	80343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010369	TGC	2	6	80420	80425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010369	GTG	2	6	80435	80440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010369	GA	3	6	80457	80462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010369	GTTG	2	8	80476	80483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010369	CCA	2	6	80492	80497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_010369	TCTGT	2	10	80541	80550	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
515	NC_010369	GTC	2	6	80559	80564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_010369	GCTGTC	2	12	80598	80609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_010369	GGC	2	6	80610	80615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_010369	GCGAC	2	10	80625	80634	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
519	NC_010369	CGC	2	6	80655	80660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_010369	GGTG	2	8	80665	80672	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010369	AGCA	2	8	81847	81854	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_010369	CTAA	2	8	81861	81868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
523	NC_010369	GGA	2	6	81922	81927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010369	GCC	2	6	82042	82047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_010369	GGCT	2	8	82059	82066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
526	NC_010369	TGA	2	6	82095	82100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010369	GTACTC	2	12	82201	82212	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_010369	GGT	2	6	82260	82265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010369	GCG	2	6	82310	82315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_010369	CGGT	2	8	82370	82377	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
531	NC_010369	GCCGT	2	10	82378	82387	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
532	NC_010369	CTCC	2	8	82415	82422	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
533	NC_010369	CTT	2	6	82425	82430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_010369	CCGA	2	8	82440	82447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
535	NC_010369	TTC	2	6	82462	82467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_010369	GAG	2	6	82492	82497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010369	CTG	2	6	82535	82540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_010369	AAC	2	6	82590	82595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_010369	CT	3	6	82670	82675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_010369	ACG	2	6	82685	82690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_010369	CGA	2	6	82707	82712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_010369	CGG	2	6	82720	82725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_010369	TGC	2	6	82739	82744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_010369	GCA	2	6	82748	82753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_010369	TTC	2	6	82762	82767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_010369	CAG	2	6	82770	82775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_010369	CA	3	6	83026	83031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_010369	TGG	2	6	83044	83049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010369	ACG	2	6	83065	83070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_010369	TA	3	6	83441	83446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010369	TGCT	2	8	83508	83515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_010369	CGG	2	6	84735	84740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010369	GCC	3	9	84743	84751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_010369	GACAGC	2	12	84752	84763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_010369	TCG	2	6	84775	84780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_010369	TCT	2	6	84785	84790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_010369	ACC	2	6	84798	84803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_010369	CCG	2	6	84816	84821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_010369	AGTC	2	8	84884	84891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_010369	GACC	2	8	84922	84929	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
561	NC_010369	GCTGTC	2	12	84956	84967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_010369	GGC	2	6	84968	84973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_010369	GCC	2	6	84979	84984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_010369	AGCA	2	8	86205	86212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_010369	CTAA	2	8	86219	86226	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_010369	TAGC	2	8	86271	86278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_010369	CT	3	6	86298	86303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_010369	CGAA	2	8	86359	86366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_010369	TTG	2	6	86409	86414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_010369	TGAT	2	8	86420	86427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010369	CGG	2	6	86432	86437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_010369	TTG	2	6	86518	86523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010369	CTG	2	6	86585	86590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_010369	TCG	2	6	86599	86604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_010369	TGG	2	6	87994	87999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010369	TG	3	6	88292	88297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_010369	TGC	2	6	88324	88329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010369	AT	3	6	88331	88336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010369	AAT	2	6	88364	88369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_010369	AT	3	6	88368	88373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010369	ACTT	2	8	88376	88383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_010369	GAG	2	6	88401	88406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010369	CTA	2	6	88410	88415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_010369	CAT	2	6	88662	88667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_010369	CAC	2	6	88668	88673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_010369	GCA	2	6	88699	88704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_010369	GTAC	2	8	88708	88715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_010369	AGT	2	6	88849	88854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_010369	CAC	2	6	89151	89156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_010369	TCAC	2	8	89578	89585	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_010369	CAA	2	6	89588	89593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_010369	TGCT	2	8	89684	89691	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_010369	CCG	2	6	89712	89717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_010369	AGG	2	6	89745	89750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010369	ACG	2	6	89751	89756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_010369	GAC	2	6	90002	90007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010369	GAC	2	6	90059	90064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_010369	GAAGA	2	10	90136	90145	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010369	AAG	2	6	90210	90215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010369	CAA	2	6	90685	90690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_010369	TCG	2	6	90737	90742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_010369	CGG	2	6	90761	90766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_010369	CTA	2	6	90802	90807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_010369	TTCG	2	8	91078	91085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_010369	GGA	2	6	91734	91739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010369	AAC	2	6	91758	91763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_010369	CGA	2	6	91764	91769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_010369	GGGC	2	8	91816	91823	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
609	NC_010369	GGT	2	6	91859	91864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010369	AT	3	6	91865	91870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010369	AGA	2	6	91926	91931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010369	CGA	2	6	92070	92075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_010369	CAA	2	6	92142	92147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010369	CAG	2	6	92180	92185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010369	GTC	2	6	92266	92271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_010369	ACC	2	6	92315	92320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_010369	GGT	2	6	92360	92365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010369	TCC	2	6	94984	94989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_010369	GACC	2	8	94992	94999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
620	NC_010369	ACA	2	6	95008	95013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_010369	GGT	2	6	95033	95038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010369	GTCT	2	8	95939	95946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_010369	ACT	2	6	96010	96015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_010369	CT	3	6	102780	102785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_010369	TGC	2	6	102827	102832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_010369	GTC	2	6	102851	102856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_010369	TCT	2	6	104615	104620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_010369	GCG	2	6	104688	104693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010369	AGT	2	6	104727	104732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010369	TG	3	6	104735	104740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010369	CTA	2	6	104773	104778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_010369	GGC	2	6	105884	105889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_010369	GCAG	2	8	105976	105983	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_010369	CCGA	2	8	105994	106001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
635	NC_010369	CGC	2	6	106030	106035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_010369	CCG	2	6	106077	106082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_010369	GAG	2	6	106112	106117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_010369	AGG	2	6	106187	106192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_010369	CGA	2	6	106265	106270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_010369	GAG	2	6	106290	106295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
641	NC_010369	GGC	2	6	107800	107805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_010369	GTTT	2	8	107822	107829	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
643	NC_010369	AAACC	2	10	107839	107848	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
644	NC_010369	TA	3	6	107923	107928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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647	NC_010369	AATG	2	8	108216	108223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
648	NC_010369	TTCA	2	8	108677	108684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
649	NC_010369	ACG	2	6	108998	109003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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651	NC_010369	TGT	2	6	109093	109098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
652	NC_010369	CTG	2	6	109109	109114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_010369	TGT	2	6	110251	110256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
654	NC_010369	ATA	2	6	110292	110297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
655	NC_010369	GCT	2	6	110333	110338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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659	NC_010369	CGAG	2	8	111157	111164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
660	NC_010369	CGA	2	6	111845	111850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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664	NC_010369	CTG	2	6	112099	112104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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673	NC_010369	CCT	4	12	117078	117089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
674	NC_010369	GACA	2	8	117095	117102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
675	NC_010369	AG	3	6	117603	117608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
676	NC_010369	CAG	2	6	117669	117674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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678	NC_010369	AGT	2	6	118969	118974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_010369	TC	3	6	121365	121370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
682	NC_010369	GAG	2	6	121376	121381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
683	NC_010369	GGT	2	6	121597	121602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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688	NC_010369	TGA	2	6	121785	121790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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693	NC_010369	CGG	2	6	122237	122242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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764	NC_010369	GA	3	6	131217	131222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
765	NC_010369	CGAAT	2	10	132169	132178	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
766	NC_010369	CGC	2	6	132206	132211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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768	NC_010369	CGG	3	9	132238	132246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
769	NC_010369	AGA	2	6	133683	133688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
770	NC_010369	CGCT	2	8	133708	133715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
771	NC_010369	A	6	6	133727	133732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
772	NC_010369	CAA	2	6	133757	133762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_010369	GCGCCC	2	12	134518	134529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
774	NC_010369	GTG	2	6	134566	134571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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778	NC_010369	TCG	2	6	135320	135325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_010369	CGGCAT	2	12	135345	135356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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781	NC_010369	GTT	2	6	135921	135926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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804	NC_010369	GAT	2	6	139467	139472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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