MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 1308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010368	TCG	2	6	240041	240046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_010368	TGGG	2	8	240073	240080	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_010368	C	6	6	240150	240155	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1004	NC_010368	GCC	2	6	240218	240223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_010368	AC	3	6	240346	240351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_010368	TCAG	2	8	240396	240403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_010368	CAT	2	6	240450	240455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_010368	TTC	3	9	240456	240464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_010368	TTAG	2	8	240496	240503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010368	TGCT	2	8	240510	240517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_010368	ACCG	2	8	241693	241700	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_010368	CGT	2	6	241707	241712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_010368	CGG	2	6	241736	241741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_010368	GCC	2	6	241748	241753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_010368	GACAGC	2	12	241754	241765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_010368	CGA	2	6	241798	241803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_010368	CAC	2	6	241806	241811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_010368	ACA	2	6	241896	241901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_010368	CACT	2	8	241936	241943	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_010368	AG	3	6	242067	242072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010368	ATCC	2	8	242075	242082	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_010368	CTT	2	6	242098	242103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_010368	GA	3	6	242107	242112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010368	GAG	2	6	242161	242166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010368	CAA	2	6	242170	242175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_010368	CT	4	8	242184	242191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_010368	GGAC	2	8	242202	242209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_010368	TTC	2	6	242230	242235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_010368	GTA	2	6	243996	244001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010368	TCC	2	6	244038	244043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_010368	CCG	2	6	244088	244093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_010368	AC	3	6	244141	244146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_010368	ACT	2	6	244209	244214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_010368	TGC	2	6	244277	244282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010368	GTCGG	2	10	244347	244356	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_010368	GTA	2	6	246795	246800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010368	ATC	2	6	246842	246847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_010368	CTA	2	6	246892	246897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_010368	CGATT	2	10	246902	246911	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1040	NC_010368	GGA	2	6	246913	246918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010368	CTT	3	9	246934	246942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_010368	CAC	2	6	246943	246948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_010368	ATA	2	6	247170	247175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010368	CTT	2	6	247481	247486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_010368	TCT	2	6	247551	247556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_010368	CTT	2	6	247678	247683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_010368	TCA	2	6	247749	247754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_010368	AGCG	2	8	247760	247767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_010368	TATC	2	8	247768	247775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_010368	TCGC	2	8	247809	247816	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_010368	CTC	2	6	247817	247822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_010368	CGC	2	6	247835	247840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_010368	GCG	2	6	247873	247878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_010368	GA	3	6	247879	247884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010368	CGACA	2	10	247945	247954	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1056	NC_010368	TTC	2	6	247967	247972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_010368	TTC	2	6	248088	248093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_010368	AAC	2	6	248180	248185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_010368	CAT	2	6	248213	248218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_010368	ATCT	2	8	248300	248307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_010368	TCG	2	6	248343	248348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_010368	CAC	2	6	248482	248487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_010368	TCGA	2	8	248550	248557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_010368	AAG	2	6	248561	248566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010368	GTC	2	6	248627	248632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_010368	ATC	2	6	248675	248680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_010368	TCA	2	6	248691	248696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_010368	CCA	2	6	250052	250057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_010368	ATA	2	6	250102	250107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010368	AGA	2	6	250196	250201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_010368	GT	3	6	251215	251220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010368	TAC	2	6	251223	251228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_010368	CTT	2	6	251238	251243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_010368	CGAG	2	8	251255	251262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_010368	CGA	2	6	251857	251862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_010368	GCG	2	6	251868	251873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_010368	TTG	2	6	251942	251947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010368	CAA	2	6	251998	252003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_010368	TATT	2	8	252030	252037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010368	CATACC	2	12	252083	252094	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_010368	CGA	2	6	254332	254337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_010368	CGTA	2	8	254394	254401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_010368	GGCT	2	8	254447	254454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_010368	GCT	2	6	254482	254487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_010368	TTC	2	6	254492	254497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_010368	CGT	2	6	255443	255448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_010368	GATTG	2	10	255474	255483	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010368	GAG	2	6	255531	255536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010368	GGT	2	6	255630	255635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010368	GCT	2	6	255653	255658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_010368	CCT	2	6	255659	255664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_010368	GGA	2	6	255927	255932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_010368	CTA	2	6	255959	255964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_010368	CTACGT	2	12	255983	255994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_010368	CTGCCT	2	12	256095	256106	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_010368	GCA	2	6	256107	256112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_010368	GTG	2	6	256113	256118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010368	TGA	2	6	257429	257434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010368	CCT	2	6	257461	257466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_010368	TTCC	2	8	257469	257476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_010368	GCC	2	6	257495	257500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_010368	CTAA	2	8	257521	257528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_010368	GCC	2	6	257537	257542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_010368	CA	3	6	257553	257558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_010368	CTGC	2	8	257571	257578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_010368	GCCC	2	8	257672	257679	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1107	NC_010368	GAT	2	6	257702	257707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_010368	TCA	2	6	257725	257730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_010368	GAG	2	6	257786	257791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_010368	AC	3	6	257796	257801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_010368	AAG	2	6	257874	257879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_010368	GAT	2	6	257882	257887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_010368	GAT	2	6	257963	257968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_010368	GAA	2	6	258077	258082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010368	CAA	2	6	258125	258130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_010368	CTT	2	6	258152	258157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_010368	GTGC	2	8	258218	258225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_010368	ATCG	2	8	258230	258237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_010368	GCG	2	6	258398	258403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_010368	GGAA	2	8	258423	258430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010368	CTC	2	6	258461	258466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_010368	CGCT	2	8	259790	259797	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_010368	CGT	2	6	259875	259880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_010368	GTG	2	6	259886	259891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010368	ACA	2	6	259928	259933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_010368	GCC	2	6	259946	259951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_010368	CT	3	6	259966	259971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_010368	CAT	2	6	259984	259989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_010368	TC	3	6	260484	260489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_010368	TC	4	8	260491	260498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_010368	GAC	2	6	260556	260561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_010368	GCT	2	6	260565	260570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_010368	AGCC	2	8	260637	260644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_010368	GCTC	2	8	260709	260716	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_010368	TCG	2	6	260768	260773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1272	NC_010368	GCT	2	6	276695	276700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1273	NC_010368	TCGT	2	8	276735	276742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1274	NC_010368	GAA	2	6	276745	276750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_010368	TCT	2	6	276821	276826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1276	NC_010368	AACA	2	8	276865	276872	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1277	NC_010368	AAC	2	6	276938	276943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1278	NC_010368	GAC	2	6	279664	279669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1281	NC_010368	GGT	2	6	279843	279848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1282	NC_010368	GAG	2	6	279871	279876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1288	NC_010368	ACC	2	6	282976	282981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1289	NC_010368	TAC	2	6	283018	283023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1292	NC_010368	ACG	2	6	283270	283275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1295	NC_010368	ACG	2	6	283444	283449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1298	NC_010368	GAC	2	6	283559	283564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1301	NC_010368	CTG	2	6	283720	283725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1302	NC_010368	TCG	2	6	283876	283881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1308	NC_010368	AGG	2	6	284216	284221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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