MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halobacterium salinarum R1 plasmid PHS3

Total Repeats: 1308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010368	GTTC	2	8	145140	145147	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_010368	GAG	3	9	145164	145172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010368	GAG	2	6	145351	145356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010368	CGT	2	6	145429	145434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_010368	CGA	2	6	145450	145455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_010368	AAT	2	6	145794	145799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010368	CA	4	8	145820	145827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_010368	GTC	2	6	145863	145868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010368	CTG	2	6	145957	145962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010368	GTA	2	6	147371	147376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010368	GAGT	2	8	147409	147416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010368	GCC	2	6	147419	147424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_010368	AG	3	6	147428	147433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010368	TCA	2	6	147445	147450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010368	AGA	2	6	147459	147464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010368	TCA	2	6	147492	147497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_010368	CGC	2	6	147553	147558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_010368	CA	3	6	147584	147589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_010368	TCC	2	6	147596	147601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_010368	GAG	2	6	147617	147622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010368	CA	3	6	147625	147630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_010368	GTA	2	6	147680	147685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_010368	TGA	2	6	147799	147804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010368	TGT	2	6	147836	147841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010368	GACG	2	8	147884	147891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
526	NC_010368	GCC	2	6	147894	147899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_010368	CTT	2	6	147938	147943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_010368	AC	3	6	147946	147951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_010368	ACT	2	6	147987	147992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_010368	AAT	2	6	148022	148027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010368	ACC	2	6	148103	148108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_010368	TTC	2	6	148151	148156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_010368	TCT	2	6	148219	148224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_010368	TGC	2	6	148316	148321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_010368	ACG	2	6	148340	148345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_010368	AT	3	6	148422	148427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010368	GAG	2	6	148688	148693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010368	CTG	2	6	148695	148700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_010368	ATA	2	6	148805	148810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_010368	ATA	2	6	148853	148858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_010368	CTCAG	2	10	148980	148989	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
542	NC_010368	CGCA	2	8	148994	149001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
543	NC_010368	CAG	2	6	149110	149115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_010368	A	6	6	149133	149138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010368	ACA	2	6	149174	149179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_010368	ACC	2	6	149218	149223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_010368	TTC	2	6	149292	149297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_010368	CTT	2	6	149316	149321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_010368	AGC	2	6	150329	150334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_010368	AGCA	2	8	150350	150357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_010368	AT	4	8	150371	150378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010368	GCG	2	6	150513	150518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010368	GGA	2	6	150556	150561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010368	TCGG	2	8	150690	150697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_010368	ACGA	2	8	150725	150732	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
556	NC_010368	ACT	2	6	150766	150771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_010368	CG	3	6	150817	150822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_010368	TGG	2	6	150840	150845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010368	TCG	2	6	150875	150880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_010368	TCC	2	6	150884	150889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_010368	TTA	2	6	150925	150930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010368	ATTT	2	8	150931	150938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_010368	TCG	2	6	150981	150986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_010368	TTCGT	2	10	151034	151043	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
565	NC_010368	TCA	2	6	151075	151080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_010368	CAGA	2	8	151146	151153	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_010368	ATA	2	6	151160	151165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_010368	AGG	2	6	151211	151216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_010368	ATA	2	6	151217	151222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_010368	CGC	2	6	152590	152595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_010368	CGT	2	6	152604	152609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_010368	CACC	2	8	152632	152639	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
573	NC_010368	ACG	2	6	152712	152717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_010368	ACCG	2	8	152763	152770	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
575	NC_010368	GTA	2	6	155734	155739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010368	CGA	2	6	155824	155829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_010368	GGC	2	6	155857	155862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010368	GACC	2	8	155906	155913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
579	NC_010368	CA	3	6	155963	155968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_010368	AT	3	6	156037	156042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010368	TAT	2	6	156050	156055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010368	GCA	2	6	160356	160361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_010368	TGA	2	6	160401	160406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010368	GCT	2	6	160417	160422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_010368	CCT	2	6	160443	160448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_010368	CGT	2	6	160506	160511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_010368	CGG	2	6	160514	160519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_010368	TC	3	6	160550	160555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_010368	GTG	2	6	160556	160561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010368	TG	5	10	160581	160590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_010368	CA	3	6	160592	160597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_010368	GCCG	2	8	160635	160642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_010368	CCG	2	6	160648	160653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_010368	GCG	2	6	160724	160729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010368	AGC	2	6	160786	160791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_010368	GC	3	6	160790	160795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_010368	CG	3	6	160819	160824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_010368	GCTG	2	8	160846	160853	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_010368	ACC	2	6	160903	160908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_010368	TG	3	6	160955	160960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010368	CCG	2	6	161438	161443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_010368	GGT	2	6	161497	161502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010368	CTA	2	6	163513	163518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_010368	CGCA	2	8	163526	163533	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_010368	GAT	2	6	163588	163593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010368	TGAC	2	8	163607	163614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
607	NC_010368	GAT	2	6	163641	163646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010368	GCT	2	6	163712	163717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010368	CTT	2	6	163953	163958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_010368	CTG	2	6	163996	164001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010368	TACA	2	8	165445	165452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_010368	ATA	2	6	168000	168005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010368	CAG	2	6	168021	168026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010368	GAC	2	6	168047	168052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010368	ATA	2	6	168842	168847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010368	CCG	2	6	170518	170523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_010368	A	6	6	172616	172621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010368	AGT	2	6	172633	172638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010368	CCA	2	6	172657	172662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_010368	GT	4	8	172667	172674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_010368	TTC	3	9	173280	173288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010368	GC	3	6	173294	173299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_010368	GCCC	2	8	173322	173329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
624	NC_010368	TGGC	2	8	173394	173401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
625	NC_010368	CTT	2	6	173470	173475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_010368	GATC	2	8	174818	174825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
627	NC_010368	GTC	2	6	174967	174972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_010368	TCG	2	6	175063	175068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010368	CAG	2	6	175503	175508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_010368	GTGG	2	8	176442	176449	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010368	CAG	2	6	177336	177341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_010368	TGT	2	6	182441	182446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010368	CTC	2	6	182520	182525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_010368	AGG	2	6	182556	182561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_010368	GATG	2	8	182581	182588	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_010368	GCT	2	6	183206	183211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_010368	CCGA	2	8	183223	183230	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
638	NC_010368	TGT	2	6	183253	183258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_010368	CGA	2	6	183427	183432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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642	NC_010368	TGG	2	6	183509	183514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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659	NC_010368	GCA	2	6	189981	189986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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662	NC_010368	GTA	2	6	190132	190137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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670	NC_010368	CT	3	6	190399	190404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
671	NC_010368	GCT	2	6	190431	190436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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774	NC_010368	AGT	2	6	203322	203327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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779	NC_010368	TTCG	2	8	203593	203600	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
780	NC_010368	TTC	2	6	203601	203606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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782	NC_010368	CGT	2	6	210408	210413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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784	NC_010368	ATC	2	6	210445	210450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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792	NC_010368	GTC	2	6	211079	211084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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903	NC_010368	A	6	6	224773	224778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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907	NC_010368	TGA	2	6	224935	224940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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