MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 1410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009973	ACG	2	6	2434	2439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009973	AC	3	6	2447	2452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009973	CGT	2	6	2469	2474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009973	ACC	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009973	CCA	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009973	CGC	2	6	2569	2574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009973	ACG	3	9	2619	2627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009973	CAG	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009973	TCG	2	6	2669	2674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009973	ATC	2	6	2698	2703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009973	ATC	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009973	ACC	2	6	2769	2774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_009973	CTT	3	9	2777	2785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009973	GCT	2	6	2809	2814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009973	CGA	2	6	4004	4009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009973	CGG	2	6	4020	4025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009973	AAC	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009973	CGG	2	6	4088	4093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009973	TGG	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009973	TTA	2	6	4580	4585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009973	AGC	2	6	4604	4609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009973	GCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009973	CTC	2	6	9148	9153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_009973	GCA	2	6	10203	10208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009973	GCC	2	6	10216	10221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009973	TTC	2	6	10244	10249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009973	GAG	2	6	10293	10298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009973	CGC	2	6	10321	10326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009973	CCA	2	6	10411	10416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009973	CACG	2	8	10447	10454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009973	CCACC	2	10	10455	10464	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
32	NC_009973	GC	3	6	10490	10495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009973	AAT	2	6	10541	10546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009973	ACCT	2	8	12537	12544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009973	ATAGC	2	10	12566	12575	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009973	GCA	2	6	12720	12725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009973	ATT	2	6	12842	12847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009973	CCA	2	6	12908	12913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009973	A	7	7	12921	12927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009973	CGC	2	6	12980	12985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009973	TC	3	6	13001	13006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009973	TAG	2	6	13017	13022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009973	ACA	2	6	15100	15105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009973	TGT	2	6	15133	15138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009973	ACA	2	6	16783	16788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009973	CAA	2	6	16803	16808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009973	TGT	2	6	16813	16818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009973	CAGT	2	8	16826	16833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009973	CAA	2	6	16857	16862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009973	AATA	2	8	16883	16890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009973	CAT	2	6	16905	16910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009973	CAA	3	9	16932	16940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009973	CAA	2	6	16954	16959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009973	TATT	2	8	16960	16967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009973	ACA	2	6	17010	17015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009973	CAA	2	6	17030	17035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009973	TAT	2	6	17040	17045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009973	ATT	2	6	17437	17442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009973	TTTTA	2	10	17533	17542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009973	TCCT	2	8	20464	20471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009973	TCA	2	6	20472	20477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009973	CAA	2	6	20518	20523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009973	GCTG	2	8	20533	20540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009973	ACG	3	9	20656	20664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009973	CCAT	2	8	20682	20689	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009973	CA	3	6	20743	20748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009973	GTC	2	6	20793	20798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009973	ATC	2	6	20823	20828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009973	AGC	2	6	22762	22767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009973	GGA	2	6	22780	22785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009973	AAG	2	6	23118	23123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009973	GA	3	6	23172	23177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009973	TTTTA	2	10	23188	23197	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009973	GAT	2	6	23276	23281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009973	CAG	2	6	23304	23309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009973	TCC	2	6	23335	23340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009973	AAT	2	6	23349	23354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009973	GCA	2	6	23390	23395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009973	CCA	2	6	23404	23409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009973	CGT	2	6	23456	23461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009973	CGAG	2	8	23464	23471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009973	CACCG	2	10	23597	23606	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_009973	TGA	2	6	23628	23633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009973	TCAA	2	8	23668	23675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009973	CCA	2	6	23712	23717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009973	GCG	2	6	23722	23727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009973	ATC	2	6	23730	23735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009973	TCA	2	6	23830	23835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009973	ATC	2	6	23836	23841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009973	TCC	2	6	23844	23849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_009973	ACC	2	6	23860	23865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009973	TCC	2	6	24978	24983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009973	ACC	2	6	25000	25005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009973	AG	3	6	25259	25264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009973	AGA	2	6	25284	25289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009973	AT	4	8	25306	25313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009973	AT	3	6	25338	25343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009973	CGA	2	6	25831	25836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009973	GAT	2	6	25866	25871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009973	ATGC	2	8	26259	26266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009973	T	6	6	26351	26356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009973	ATGGC	2	10	26378	26387	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009973	CCA	2	6	26458	26463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_009973	CCA	2	6	26475	26480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_009973	CAG	2	6	26561	26566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009973	GGT	2	6	26619	26624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009973	ACG	2	6	26667	26672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009973	GAG	2	6	26678	26683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009973	ATT	2	6	26691	26696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009973	GAC	2	6	26819	26824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009973	CAT	2	6	26831	26836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009973	CAG	3	9	26840	26848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009973	CCAT	2	8	26849	26856	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009973	CAG	2	6	26919	26924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009973	TCG	2	6	26938	26943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009973	GAT	2	6	27027	27032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009973	CAG	2	6	27274	27279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009973	CGG	2	6	27315	27320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009973	TTG	2	6	27353	27358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009973	AGGG	2	8	27390	27397	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009973	CGG	3	9	27438	27446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009973	ATA	2	6	27470	27475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009973	TTA	2	6	27491	27496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009973	TC	3	6	27576	27581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009973	CAA	2	6	27617	27622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009973	AG	3	6	27632	27637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009973	GTG	2	6	27699	27704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009973	GT	3	6	27710	27715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009973	GCG	2	6	27725	27730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009973	AGG	2	6	27791	27796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009973	TTC	2	6	27798	27803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009973	GAT	2	6	27829	27834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009973	GGT	2	6	27944	27949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009973	GCTG	2	8	27968	27975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009973	CT	3	6	27989	27994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009973	GAG	2	6	28014	28019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009973	CTG	2	6	29056	29061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009973	GGA	2	6	29082	29087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009973	ATG	2	6	29186	29191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009973	GCT	2	6	29217	29222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009973	CGC	2	6	29264	29269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_009973	ATGGAG	2	12	30178	30189	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009973	TATG	2	8	30238	30245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009973	CAAG	2	8	30262	30269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009973	TGA	2	6	30339	30344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009973	CACG	2	8	30414	30421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009973	TTGTC	2	10	30452	30461	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_009973	GGA	2	6	30514	30519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_009973	TAGGA	2	10	31621	31630	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_009973	CGA	2	6	34097	34102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_009973	TGA	2	6	34822	34827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_009973	GCG	2	6	52420	52425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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415	NC_009973	AC	3	6	81593	81598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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418	NC_009973	GCA	2	6	83800	83805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
419	NC_009973	TTC	2	6	83871	83876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_009973	TGAT	2	8	83892	83899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
422	NC_009973	TTA	2	6	83933	83938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_009973	ATC	2	6	84026	84031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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