MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 15226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_009972	AAT	2	6	5833145	5833150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_009972	CTT	2	6	5833187	5833192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_009972	TGG	2	6	5833205	5833210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_009972	TC	3	6	5834595	5834600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14005	NC_009972	ATT	2	6	5834612	5834617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_009972	TAT	2	6	5835632	5835637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_009972	GGC	2	6	5835639	5835644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_009972	CCAA	2	8	5835656	5835663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14009	NC_009972	TA	4	8	5836467	5836474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_009972	TGTT	3	12	5838792	5838803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_009972	CTA	2	6	5840148	5840153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_009972	TTCC	2	8	5841557	5841564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14013	NC_009972	TGG	2	6	5841594	5841599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_009972	ATC	2	6	5841666	5841671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_009972	CAAA	2	8	5843906	5843913	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14016	NC_009972	A	7	7	5843911	5843917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_009972	T	6	6	5843939	5843944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_009972	CAAT	2	8	5843950	5843957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14019	NC_009972	TCC	2	6	5844852	5844857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14020	NC_009972	TAG	2	6	5844945	5844950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_009972	CTT	2	6	5844963	5844968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_009972	TTCA	2	8	5845001	5845008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14023	NC_009972	GCT	2	6	5846091	5846096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_009972	ATC	2	6	5846132	5846137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_009972	ATCA	2	8	5847760	5847767	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14026	NC_009972	ATG	2	6	5847925	5847930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_009972	ATT	2	6	5847970	5847975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_009972	ACG	2	6	5848730	5848735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_009972	AAGG	2	8	5848760	5848767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_009972	GTT	2	6	5850223	5850228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_009972	CATC	2	8	5851728	5851735	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14032	NC_009972	T	6	6	5851758	5851763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_009972	TG	3	6	5851793	5851798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14035	NC_009972	TAAT	2	8	5851849	5851856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_009972	A	6	6	5851879	5851884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_009972	TAAT	2	8	5851907	5851914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_009972	CAAT	2	8	5851917	5851924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14039	NC_009972	TGC	2	6	5851927	5851932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14040	NC_009972	TGA	2	6	5851957	5851962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_009972	TTG	2	6	5851965	5851970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_009972	GCT	2	6	5851971	5851976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_009972	CCA	2	6	5851992	5851997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14044	NC_009972	GCT	2	6	5852046	5852051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_009972	GAA	2	6	5852053	5852058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_009972	TGG	2	6	5852065	5852070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_009972	TC	3	6	5852224	5852229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14048	NC_009972	CTT	2	6	5852250	5852255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_009972	GTT	2	6	5852272	5852277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14051	NC_009972	AAT	2	6	5852299	5852304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_009972	TAA	2	6	5852307	5852312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_009972	T	7	7	5854343	5854349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_009972	CTCGC	2	10	5854385	5854394	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14055	NC_009972	CCCA	2	8	5854444	5854451	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14056	NC_009972	AC	3	6	5856400	5856405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14057	NC_009972	GTT	2	6	5856471	5856476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_009972	TTCG	2	8	5856484	5856491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14059	NC_009972	GGTT	2	8	5856495	5856502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_009972	CAAC	2	8	5856519	5856526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14061	NC_009972	CGG	2	6	5856555	5856560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_009972	CGC	2	6	5856573	5856578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14063	NC_009972	ACCT	2	8	5856605	5856612	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14064	NC_009972	GCA	2	6	5856636	5856641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_009972	CCT	2	6	5857208	5857213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14066	NC_009972	GATC	2	8	5857234	5857241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14067	NC_009972	CT	4	8	5857895	5857902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14068	NC_009972	TTA	2	6	5857993	5857998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14074	NC_009972	GCTA	2	8	5865078	5865085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14075	NC_009972	TGT	2	6	5865135	5865140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14082	NC_009972	CGAGG	2	10	5865389	5865398	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14083	NC_009972	CCG	2	6	5865437	5865442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14092	NC_009972	TGCG	2	8	5868892	5868899	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14093	NC_009972	TAT	2	6	5870701	5870706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_009972	GGCT	2	8	5870707	5870714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14095	NC_009972	GCA	3	9	5870726	5870734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14099	NC_009972	ATT	2	6	5870918	5870923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_009972	TTA	2	6	5870946	5870951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_009972	ATG	2	6	5871004	5871009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14103	NC_009972	ATC	2	6	5871029	5871034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14107	NC_009972	CTG	2	6	5871591	5871596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14108	NC_009972	ATT	2	6	5871714	5871719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_009972	TTTGA	2	10	5871747	5871756	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_009972	ACA	2	6	5871821	5871826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_009972	AGG	2	6	5871837	5871842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_009972	TTAA	2	8	5872870	5872877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_009972	TGC	2	6	5872897	5872902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_009972	T	7	7	5872920	5872926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14118	NC_009972	AAAGC	2	10	5876520	5876529	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14119	NC_009972	CTAA	2	8	5876560	5876567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14125	NC_009972	TCCT	2	8	5879539	5879546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14126	NC_009972	CAA	2	6	5879602	5879607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_009972	GCT	2	6	5879619	5879624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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