MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 15226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_009972	ATG	2	6	5632085	5632090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_009972	ATG	2	6	5634171	5634176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_009972	TGC	2	6	5634187	5634192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_009972	ATGC	2	8	5634197	5634204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13505	NC_009972	TCA	2	6	5634941	5634946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_009972	C	6	6	5634985	5634990	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13507	NC_009972	GCT	2	6	5634991	5634996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_009972	TCG	2	6	5634997	5635002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13509	NC_009972	GCGG	2	8	5635009	5635016	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13510	NC_009972	GTT	2	6	5636322	5636327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_009972	CCG	2	6	5637022	5637027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13512	NC_009972	GATT	2	8	5637044	5637051	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_009972	GAA	2	6	5637620	5637625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_009972	AAC	2	6	5637670	5637675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_009972	ATT	2	6	5637699	5637704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13517	NC_009972	GCC	2	6	5639485	5639490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13518	NC_009972	GGC	2	6	5639506	5639511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_009972	CA	4	8	5646129	5646136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13520	NC_009972	GT	3	6	5646138	5646143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_009972	AAAATA	2	12	5646199	5646210	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13526	NC_009972	T	7	7	5646391	5646397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13531	NC_009972	CTTGA	2	10	5653129	5653138	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13532	NC_009972	GTTGTA	2	12	5653163	5653174	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_009972	ATT	2	6	5653186	5653191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13538	NC_009972	AAT	2	6	5653428	5653433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_009972	TGAT	2	8	5653436	5653443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_009972	ATTTT	2	10	5653472	5653481	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_009972	T	6	6	5653478	5653483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_009972	AACT	2	8	5653486	5653493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13543	NC_009972	AG	3	6	5653584	5653589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_009972	GCTG	2	8	5653592	5653599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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13550	NC_009972	CAA	2	6	5653878	5653883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13551	NC_009972	TGA	2	6	5653952	5653957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_009972	T	6	6	5654043	5654048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_009972	AAG	2	6	5656564	5656569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_009972	A	7	7	5657512	5657518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13556	NC_009972	T	6	6	5658386	5658391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_009972	AAC	2	6	5659912	5659917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13558	NC_009972	AAT	2	6	5660029	5660034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_009972	GAAC	2	8	5660062	5660069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13560	NC_009972	ATC	2	6	5660087	5660092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_009972	TTG	2	6	5661192	5661197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_009972	CCTT	2	8	5665352	5665359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13563	NC_009972	TA	3	6	5665491	5665496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_009972	ACG	2	6	5665527	5665532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13565	NC_009972	ACCA	2	8	5665553	5665560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13566	NC_009972	AG	3	6	5665643	5665648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_009972	CTA	2	6	5665695	5665700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13569	NC_009972	AGG	2	6	5665742	5665747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_009972	T	6	6	5666412	5666417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_009972	GCTA	2	8	5666488	5666495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13574	NC_009972	GTT	2	6	5669883	5669888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13577	NC_009972	CATT	2	8	5672110	5672117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13578	NC_009972	TCA	2	6	5672164	5672169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13583	NC_009972	CATC	2	8	5673010	5673017	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13591	NC_009972	GAA	2	6	5678288	5678293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_009972	G	6	6	5678305	5678310	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_009972	TGGG	2	8	5678345	5678352	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_009972	AGGCG	2	10	5678392	5678401	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13595	NC_009972	ATC	2	6	5678409	5678414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13598	NC_009972	CAA	2	6	5680805	5680810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13599	NC_009972	GCGA	2	8	5680851	5680858	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13600	NC_009972	G	6	6	5680859	5680864	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_009972	CAAAGC	2	12	5680870	5680881	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13603	NC_009972	ATT	2	6	5681619	5681624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_009972	TC	3	6	5683165	5683170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13605	NC_009972	GCG	2	6	5683192	5683197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13606	NC_009972	CGAT	2	8	5683207	5683214	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13607	NC_009972	ATG	2	6	5683219	5683224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13609	NC_009972	CTCGC	2	10	5683237	5683246	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13610	NC_009972	G	6	6	5683265	5683270	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_009972	GAT	2	6	5683276	5683281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_009972	ACA	2	6	5683316	5683321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13613	NC_009972	ATG	2	6	5684685	5684690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_009972	TTC	2	6	5686382	5686387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13615	NC_009972	CTCGC	2	10	5689044	5689053	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13616	NC_009972	CCA	2	6	5690212	5690217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13617	NC_009972	TCG	2	6	5690237	5690242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13619	NC_009972	TTC	3	9	5690275	5690283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_009972	GCA	2	6	5690295	5690300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13621	NC_009972	TTA	2	6	5690314	5690319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13623	NC_009972	CAA	2	6	5694501	5694506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13624	NC_009972	ATC	2	6	5694549	5694554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13627	NC_009972	ATA	2	6	5694628	5694633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13629	NC_009972	CAA	2	6	5694672	5694677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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